seq1 = pF1KB6346.tfa, 873 bp
seq2 = pF1KB6346/gi568815581r_7073662.tfa (gi568815581r:7073662_7278563), 204902 bp

>pF1KB6346 873
>gi568815581r:7073662_7278563 (Chr17)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-187  (101238-101354)   100% ->
188-283  (101488-101583)   100% ->
284-355  (101663-101734)   100% ->
356-442  (104104-104190)   100% ->
443-594  (104275-104426)   100% ->
595-701  (104497-104603)   100% ->
702-873  (104731-104902)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCAAGGAGTATCAAGACCTTCAGCATCTGGACAATGAGGAGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCAAGGAGTATCAAGACCTTCAGCATCTGGACAATGAGGAGAGTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACCATCAGCTCAGAAAAG         GGCCACCTCCTCCCCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 CCACCATCAGCTCAGAAAAGGTG...CAGGGCCACCTCCTCCCCAGCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCCTGCAGCGTCTCTGCTCCGGACCTCGCCTCCTCCTGCTCTCCCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101259 TCCTGCAGCGTCTCTGCTCCGGACCTCGCCTCCTCCTGCTCTCCCTGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCAGCCTCCTGCTGCTTGTGGTTGTCTGTGTGATCGGATCCCAAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 101309 CTCAGCCTCCTGCTGCTTGTGGTTGTCTGTGTGATCGGATCCCAAAGTG.

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    188      ACTCCCAGCTGCAGGAGGAGCTGCGGGGCCTGAGAGAGACGTTCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101359 ..CAGACTCCCAGCTGCAGGAGGAGCTGCGGGGCCTGAGAGAGACGTTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCAACTTCACAGCGAGCACGGAGGCCCAGGTCAAGGGCTTGAGCACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101533 GCAACTTCACAGCGAGCACGGAGGCCCAGGTCAAGGGCTTGAGCACCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 G         GAGGCAATGTGGGAAGAAAGATGAAGTCGCTAGAGTCCCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101583 GGTG...CAGGAGGCAATGTGGGAAGAAAGATGAAGTCGCTAGAGTCCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCTGGAGAAACAGCAGAAGGACCTGAGTGAAG         ATCACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101703 GCTGGAGAAACAGCAGAAGGACCTGAGTGAAGGTC...CAGATCACTCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GCCTGCTGCTCCACGTGAAGCAGTTCGTGTCTGACCTGCGGAGCCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104113 GCCTGCTGCTCCACGTGAAGCAGTTCGTGTCTGACCTGCGGAGCCTGAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TGTCAGATGGCGGCGCTCCAGGGCAATG         GCTCAGAAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 104163 TGTCAGATGGCGGCGCTCCAGGGCAATGGTA...CAGGCTCAGAAAGGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CTGCTGCCCGGTCAACTGGGTGGAGCACGAGCGCAGCTGCTACTGGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104288 CTGCTGCCCGGTCAACTGGGTGGAGCACGAGCGCAGCTGCTACTGGTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CTCGCTCCGGGAAGGCCTGGGCTGACGCCGACAACTACTGCCGGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104338 CTCGCTCCGGGAAGGCCTGGGCTGACGCCGACAACTACTGCCGGCTGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GACGCGCACCTGGTGGTGGTCACGTCCTGGGAGGAGCAG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 104388 GACGCGCACCTGGTGGTGGTCACGTCCTGGGAGGAGCAGGTG...CAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 ATTTGTCCAGCACCACATAGGCCCTGTGAACACCTGGATGGGCCTCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104499 ATTTGTCCAGCACCACATAGGCCCTGTGAACACCTGGATGGGCCTCCACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACCAAAACGGGCCCTGGAAGTGGGTGGACGGGACGGACTACGAGACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104549 ACCAAAACGGGCCCTGGAAGTGGGTGGACGGGACGGACTACGAGACGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TTCAA         GAACTGGAGGCCGGAGCAGCCGGACGACTGGTACGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104599 TTCAAGTG...CAGGAACTGGAGGCCGGAGCAGCCGGACGACTGGTACGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCACGGGCTCGGAGGAGGCGAGGACTGTGCCCACTTCACCGACGACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104767 CCACGGGCTCGGAGGAGGCGAGGACTGTGCCCACTTCACCGACGACGGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GCTGGAACGACGACGTCTGCCAGAGGCCCTACCGCTGGGTCTGCGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104817 GCTGGAACGACGACGTCTGCCAGAGGCCCTACCGCTGGGTCTGCGAGACA

    900     .    :    .    :    .    :    .
    838 GAGCTGGACAAGGCCAGCCAGGAGCCACCTCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104867 GAGCTGGACAAGGCCAGCCAGGAGCCACCTCTCCTT