seq1 = pF1KB6345.tfa, 795 bp
seq2 = pF1KB6345/gi568815586f_49862018.tfa (gi568815586f:49862018_50065174), 203157 bp

>pF1KB6345 795
>gi568815586f:49862018_50065174 (Chr12)

1-363  (100001-100363)   100% ->
364-528  (101475-101639)   100% ->
529-612  (102075-102158)   100% ->
613-795  (102975-103157)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGAAGGAGGTGTGCTCCGTGGCCTTCCTCAAGGCCGTGTTCGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGAAGGAGGTGTGCTCCGTGGCCTTCCTCAAGGCCGTGTTCGCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCTTGGCCACCCTCATCTTCGTCTTCTTTGGCCTGGGCTCGGCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTCTTGGCCACCCTCATCTTCGTCTTCTTTGGCCTGGGCTCGGCCCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTGGCCGTCGGCGCTGCCTACCATCCTGCAGATCGCGCTGGCGTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTGGCCGTCGGCGCTGCCTACCATCCTGCAGATCGCGCTGGCGTTTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGCCATAGGCACGCTGGCCCAGGCCCTGGGACCCGTGAGCGGCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGCCATAGGCACGCTGGCCCAGGCCCTGGGACCCGTGAGCGGCGGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATCAACCCCGCCATCACCCTGGCCCTCTTGGTGGGCAACCAGATCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATCAACCCCGCCATCACCCTGGCCCTCTTGGTGGGCAACCAGATCTCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTCCGGGCTTTCTTCTACGTGGCGGCCCAGCTGGTGGGCGCCATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTCCGGGCTTTCTTCTACGTGGCGGCCCAGCTGGTGGGCGCCATTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGGCTGGCATCCTCTACGGTGTGGCACCGCTCAATGCCCGGGGCAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGGCTGGCATCCTCTACGGTGTGGCACCGCTCAATGCCCGGGGCAATCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCGTCAACGCG         CTCAACAACAACACAACGCAGGGCCAGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCGTCAACGCGGTG...CAGCTCAACAACAACACAACGCAGGGCCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCATGGTGGTGGAGCTGATTCTGACCTTCCAGCTGGCACTCTGCATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101503 CCATGGTGGTGGAGCTGATTCTGACCTTCCAGCTGGCACTCTGCATCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCTCCACTGACTCCCGCCGCACCAGCCCTGTGGGCTCCCCAGCCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101553 GCCTCCACTGACTCCCGCCGCACCAGCCCTGTGGGCTCCCCAGCCCTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATTGGCCTGTCTGTCACCCTGGGCCACCTTGTCGGA         ATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101603 CATTGGCCTGTCTGTCACCCTGGGCCACCTTGTCGGAGTG...CAGATCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACTTCACTGGCTGCTCCATGAACCCAGCCCGCTCTTTTGGCCCTGCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102079 ACTTCACTGGCTGCTCCATGAACCCAGCCCGCTCTTTTGGCCCTGCGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTCATGAATCGGTTCAGCCCCGCTCACTGG         GTTTTCTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102129 GTCATGAATCGGTTCAGCCCCGCTCACTGGGTG...CAGGTTTTCTGGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGGGCCCATCGTGGGGGCGGTCCTGGCTGCCATCCTTTACTTCTACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102986 AGGGCCCATCGTGGGGGCGGTCCTGGCTGCCATCCTTTACTTCTACCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCTTCCCCAACTCCCTGAGCCTGAGTGAGCGTGTGGCCATCATCAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103036 TCTTCCCCAACTCCCTGAGCCTGAGTGAGCGTGTGGCCATCATCAAAGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ACGTATGAGCCTGACGAGGACTGGGAGGAGCAGCGGGAAGAGCGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103086 ACGTATGAGCCTGACGAGGACTGGGAGGAGCAGCGGGAAGAGCGGAAGAA

    800     .    :    .    :
    774 GACCATGGAGCTGACCACCCGC
        ||||||||||||||||||||||
 103136 GACCATGGAGCTGACCACCCGC