seq1 = pF1KB6344.tfa, 873 bp
seq2 = pF1KB6344/gi568815588r_74994679.tfa (gi568815588r:74994679_75204076), 209398 bp

>pF1KB6344 873
>gi568815588r:74994679_75204076 (Chr10)

(complement)

1-183  (100001-100183)   100% ->
184-278  (102116-102210)   98% ->
279-452  (106192-106365)   100% ->
453-673  (108282-108502)   99% ->
674-873  (109199-109398)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCTCTGCCACTTTGCCACCCTGGCACTGATCCTGCTGGTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCTCTGCCACTTTGCCACCCTGGCACTGATCCTGCTGGTGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGGCTCTGGCCCAGGCGGACACACAGAAGATGGTGGAAGCCCAGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGGCTCTGGCCCAGGCGGACACACAGAAGATGGTGGAAGCCCAGCGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGTCGGCCCTAGAGCCTGCTACTCCATCTGGCTCCTCCTGGCGCCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGTCGGCCCTAGAGCCTGCTACTCCATCTGGCTCCTCCTGGCGCCTACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCCCTCTCAGCCACTGTCTTCAGTCTCCACAG         AAACAGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100151 CCCCCTCTCAGCCACTGTCTTCAGTCTCCACAGGTG...TAGAAACAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCAAGTGTGCGGAGACAGGCGGCTGAAAGCCGGCAGCACGAACTGCCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 102124 TCAAGTGTGCGGAGACAGGCGGCTGAAAGCCAGCAGCACGAACTGCCCGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGAGAAGTGCACAGCCTGGGCCAGATACTCCCACAG         GATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102174 CAGAGAAGTGCACAGCCTGGGCCAGATACTCCCACAGGTG...CAGGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GACTCACTGCAGAAGCAGGACCTCCGGAGGCCCAAGATCCATGGGGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106196 GACTCACTGCAGAAGCAGGACCTCCGGAGGCCCAAGATCCATGGGGCAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCAGGCATCTCCCTACCAGCCGCCCACATTGGCTTCGCTGCAGCGCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106246 CCAGGCATCTCCCTACCAGCCGCCCACATTGGCTTCGCTGCAGCGCTTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGTGGGTCCGTCAGGCTGCCACACTGAACCATATCGATGAGGTCTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106296 TGTGGGTCCGTCAGGCTGCCACACTGAACCATATCGATGAGGTCTGGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGCCTCTTCCTGGGAGATGC         GTACGCAGCCCGGGACAAGAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 106346 AGCCTCTTCCTGGGAGATGCGTG...CAGGTACGCAGCCCGGGACAAGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAAGCTGATCCAGCTGGGAATCACCCACGTTGTGAATGCCGCTGCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108303 CAAGCTGATCCAGCTGGGAATCACCCACGTTGTGAATGCCGCTGCAGGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGTTCCAGGTGGACACAGGTGCCAAATTCTACCGTGGAATGTCCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108353 AGTTCCAGGTGGACACAGGTGCCAAATTCTACCGTGGAATGTCCCTGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TACTATGGCATCGAGGCGGATGACAACCCCTTCTTCGACCTCAGTGTCTA
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 108403 TACTATGGCATCGAGGCGGACGACAACCCCTTCTTCGACCTCAGTGTCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTTTCTGCCTGTTGCTCGATACATCCGAGCTGCCCTCAGTGTTCCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108453 CTTTCTGCCTGTTGCTCGATACATCCGAGCTGCCCTCAGTGTTCCCCAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674          GCCGCGTGCTGGTACACTGTGCCATGGGGGTAAGCCGCTCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108503 GTG...CAGGCCGCGTGCTGGTACACTGTGCCATGGGGGTAAGCCGCTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCCACACTTGTCCTGGCCTTCCTCATGATCTATGAGAACATGACGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 109240 GCCACACTTGTCCTGGCCTTCCTCATGATCTGTGAGAACATGACGCTGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGAGGCCATCCAGACGGTGCAGGCCCACCGCAATATCTGCCCTAACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109290 AGAGGCCATCCAGACGGTGCAGGCCCACCGCAATATCTGCCCTAACTCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GCTTCCTCCGGCAGCTCCAGGTTCTGGACAACCGACTGGGGCGGGAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109340 GCTTCCTCCGGCAGCTCCAGGTTCTGGACAACCGACTGGGGCGGGAGACG

    900     .
    865 GGGCGGTTC
        |||||||||
 109390 GGGCGGTTC