seq1 = pF1KB6342.tfa, 873 bp
seq2 = pF1KB6342/gi568815579r_1478415.tfa (gi568815579r:1478415_1692631), 214217 bp

>pF1KB6342 873
>gi568815579r:1478415_1692631 (Chr19)

(complement)

1-110  (100001-100110)   100% ->
111-270  (107418-107577)   100% ->
271-408  (107955-108092)   100% ->
409-499  (109920-110010)   100% ->
500-677  (111363-111540)   100% ->
678-873  (114094-114289)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCGGAAGAGGTGGGAGTGCCCGGCGCTCCCGCAGGGCTGGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCGGAAGAGGTGGGAGTGCCCGGCGCTCCCGCAGGGCTGGGAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAAGAAGTGCCCAGAAGGTCGGGGCTGTCGGCCGGCCACAGGGATGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAAGAAGTGCCCAGAAGGTCGGGGCTGTCGGCCGGCCACAGGGATGTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTACTATAG         CCCGAGCGGGAAGAAGTTCCGCAGCAAGCCG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTACTATAGGTG...CAGCCCGAGCGGGAAGAAGTTCCGCAGCAAGCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGCTGGCGCGCTACCTGGGCGGCTCCATGGACCTGAGCACCTTCGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107449 CAGCTGGCGCGCTACCTGGGCGGCTCCATGGACCTGAGCACCTTCGACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCGCACGGGCAAGATGCTGATGAGCAAGATGAACAAGAGCCGCCAGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107499 CCGCACGGGCAAGATGCTGATGAGCAAGATGAACAAGAGCCGCCAGCGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCGCTACGACTCCTCCAACCAGGTCAAG         GGCAAGCCCGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 107549 TGCGCTACGACTCCTCCAACCAGGTCAAGGTG...CAGGGCAAGCCCGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGAACACGGCGCTGCCCGTGCGCCAGACGGCGTCCATCTTCAAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107967 CTGAACACGGCGCTGCCCGTGCGCCAGACGGCGTCCATCTTCAAGCAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGTGACCAAGATTACCAACCACCCCAGCAACAAGGTCAAGAGCGACCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108017 GGTGACCAAGATTACCAACCACCCCAGCAACAAGGTCAAGAGCGACCCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGAAGGCGGTGGACCAGCCGCGCCAG         CTCTTCTGGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 108067 AGAAGGCGGTGGACCAGCCGCGCCAGGTG...CAGCTCTTCTGGGAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGCTGAGCGGCCTGAACGCCTTCGACATTGCTGAGGAGCTGGTCAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109935 AAGCTGAGCGGCCTGAACGCCTTCGACATTGCTGAGGAGCTGGTCAAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATGGACCTCCCCAAGGGCCTGCAGG         GGGTGGGACCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 109985 CATGGACCTCCCCAAGGGCCTGCAGGGTG...CAGGGGTGGGACCTGGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCACGGATGAGACGCTGCTGTCGGCCATCGCCAGCGCCCTGCACACTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111378 GCACGGATGAGACGCTGCTGTCGGCCATCGCCAGCGCCCTGCACACTAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACCATGCCCATCACGGGACAGCTCTCGGCCGCCGTGGAGAAGAACCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111428 ACCATGCCCATCACGGGACAGCTCTCGGCCGCCGTGGAGAAGAACCCCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGTATGGCTCAACACCACGCAGCCCCTGTGCAAAGCCTTCATGGTGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111478 CGTATGGCTCAACACCACGCAGCCCCTGTGCAAAGCCTTCATGGTGACCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACGAGGACATCAG         GAAGCAGGAAGAGCTGGTGCAGCAGGTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 111528 ACGAGGACATCAGGTA...CAGGAAGCAGGAAGAGCTGGTGCAGCAGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CGGAAGCGGCTGGAGGAGGCGCTGATGGCCGACATGCTGGCGCACGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114122 CGGAAGCGGCTGGAGGAGGCGCTGATGGCCGACATGCTGGCGCACGTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGAGCTGGCCCGTGACGGGGAGGCGCCGCTGGACAAGGCCTGCGCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114172 GGAGCTGGCCCGTGACGGGGAGGCGCCGCTGGACAAGGCCTGCGCTGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACGACGACGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGCCCGACCCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114222 ACGACGACGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGCCCGACCCGGAC

    900     .    :    .
    856 CCGGAGATGGAGCACGTC
        ||||||||||||||||||
 114272 CCGGAGATGGAGCACGTC