seq1 = pF1KB6335.tfa, 783 bp
seq2 = pF1KB6335/gi568815578r_5015286.tfa (gi568815578r:5015286_5219798), 204513 bp

>pF1KB6335 783
>gi568815578r:5015286_5219798 (Chr20)

(complement)

1-221  (100001-100221)   100% ->
222-319  (100933-101030)   100% ->
320-387  (101122-101189)   100% ->
388-582  (102135-102329)   100% ->
583-706  (104227-104350)   100% ->
707-783  (104437-104513)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCGAGGCGCGCCTGGTCCAGGGCTCCATCCTCAAGAAGGTGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCGAGGCGCGCCTGGTCCAGGGCTCCATCCTCAAGAAGGTGTTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCACTCAAGGACCTCATCAACGAGGCCTGCTGGGATATTAGCTCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCACTCAAGGACCTCATCAACGAGGCCTGCTGGGATATTAGCTCCAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGTAAACCTGCAGAGCATGGACTCGTCCCACGTCTCTTTGGTGCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGTAAACCTGCAGAGCATGGACTCGTCCCACGTCTCTTTGGTGCAGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCCTGCGGTCTGAGGGCTTCGACACCTACCGCTGCGACCGCAACCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCCTGCGGTCTGAGGGCTTCGACACCTACCGCTGCGACCGCAACCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGGGCGTGAACCTCACCAG         TATGTCCAAAATACTAAAAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100201 CATGGGCGTGAACCTCACCAGGTG...TAGTATGTCCAAAATACTAAAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCGCCGGCAATGAAGATATCATTACACTAAGGGCCGAAGATAACGCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100953 GCGCCGGCAATGAAGATATCATTACACTAAGGGCCGAAGATAACGCGGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACCTTGGCGCTAGTATTTGAAGCACCAA         ACCAGGAGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101003 ACCTTGGCGCTAGTATTTGAAGCACCAAGTA...TAGACCAGGAGAAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTCAGACTATGAAATGAAGTTGATGGATTTAGATGTTGAACAACTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101135 TTCAGACTATGAAATGAAGTTGATGGATTTAGATGTTGAACAACTTGGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTCCA         GAACAGGAGTACAGCTGTGTAGTAAAGATGCCTTCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101185 TTCCAGTG...TAGGAACAGGAGTACAGCTGTGTAGTAAAGATGCCTTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGTGAATTTGCACGTATATGCCGAGATCTCAGCCATATTGGAGATGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102171 GGTGAATTTGCACGTATATGCCGAGATCTCAGCCATATTGGAGATGCTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGTAATTTCCTGTGCAAAAGACGGAGTGAAATTTTCTGCAAGTGGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102221 TGTAATTTCCTGTGCAAAAGACGGAGTGAAATTTTCTGCAAGTGGAGAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTGGAAATGGAAACATTAAATTGTCACAGACAAGTAATGTCGATAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102271 TTGGAAATGGAAACATTAAATTGTCACAGACAAGTAATGTCGATAAAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAGGAAGCT         GTTACCATAGAGATGAATGAACCAGTTCAACT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102321 GAGGAAGCTGTA...TAGGTTACCATAGAGATGAATGAACCAGTTCAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AACTTTTGCACTGAGGTACCTGAACTTCTTTACAAAAGCCACTCCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104259 AACTTTTGCACTGAGGTACCTGAACTTCTTTACAAAAGCCACTCCACTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTTCAACGGTGACACTCAGTATGTCTGCAGATGTACCCCTTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104309 CTTCAACGGTGACACTCAGTATGTCTGCAGATGTACCCCTTGGTA...CA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    707  TTGTAGAGTATAAAATTGCGGATATGGGACACTTAAAATACTACTTGGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104436 GTTGTAGAGTATAAAATTGCGGATATGGGACACTTAAAATACTACTTGGC

    800     .    :    .    :    .
    756 TCCCAAGATCGAGGATGAAGAAGGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||
 104486 TCCCAAGATCGAGGATGAAGAAGGATCT