seq1 = pF1KB6332.tfa, 864 bp
seq2 = pF1KB6332/gi568815588r_68184180.tfa (gi568815588r:68184180_68406844), 222665 bp

>pF1KB6332 864
>gi568815588r:68184180_68406844 (Chr10)

(complement)

1-84  (100001-100084)   100% ->
85-184  (109860-109959)   100% ->
185-283  (110481-110579)   100% ->
284-393  (114607-114716)   99% ->
394-423  (114806-114835)   100% ->
424-512  (117826-117914)   100% ->
513-691  (118184-118362)   100% ->
692-754  (121435-121497)   100% ->
755-864  (122556-122665)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCTTCCTATTTTCATAGCAGATGCATTCACAGCAAGAGCATTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGCTTCCTATTTTCATAGCAGATGCATTCACAGCAAGAGCATTTCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGAATCCTGCTGCTGTTTGCCTCCTAGAAAAT         GAATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100051 TGGGAATCCTGCTGCTGTTTGCCTCCTAGAAAATGTA...AAGGAATTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGAAGACATGCATCAGAAAATTGCAAGGGAGATGAACCTCTCTGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109867 ATGAAGACATGCATCAGAAAATTGCAAGGGAGATGAACCTCTCTGAAACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTTTTATCCGAAAACTGCACCCGACAGACAACTTTGCACAAA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 109917 GCTTTTATCCGAAAACTGCACCCGACAGACAACTTTGCACAAAGTA...C

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    185   GTTCCTGCTTTGGACTGAGATGGTTTACACCAGCGAGTGAGGTCCCAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110479 AGGTTCCTGCTTTGGACTGAGATGGTTTACACCAGCGAGTGAGGTCCCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCTGTGGCCATGCCACCCTGGCTTCTGCAGCTGTGCTGTTTCACAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110529 TCTGTGGCCATGCCACCCTGGCTTCTGCAGCTGTGCTGTTTCACAAAATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 A         AAAACATGAATAGCACGCTCACGTTTGTCACTCTGAGTGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110579 AGTA...CAGAAAACATGAATAGCACGCTCACGTTTGTCACTCTGAGTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGAACTAAGGGCCAGACGAGCAGAGGACGGCATCGTCCTGGACTTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 114647 AGAACTAAGGGCCAGACGAGCAGAGGATGGCATCGTCCTGGACTTGCCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTTATCCAGCCCACCCCCAG         GACTTCCATGAAGTAGAGGAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 114697 TTTATCCAGCCCACCCCCAGGTC...TAGGACTTCCATGAAGTAGAGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TTGATAAAG         ACTGCCATAGGCAACACACTGGTCCAGGACAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 114827 TTGATAAAGGTT...CAGACTGCCATAGGCAACACACTGGTCCAGGACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CTGTTATTCTCCAGATACCCAAAAGCTCCTCGTCCGCCTCAGTGACGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117858 CTGTTATTCTCCAGATACCCAAAAGCTCCTCGTCCGCCTCAGTGACGTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACAACAG         GTCGTTTCTGGAGAACCTGAAAGTGAACACGGAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117908 ACAACAGGTA...AAGGTCGTTTCTGGAGAACCTGAAAGTGAACACGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AATCTGCTGCAAGTTGAAAACACAGGGAAGGTGAAAGGGCTTATTCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118218 AATCTGCTGCAAGTTGAAAACACAGGGAAGGTGAAAGGGCTTATTCTTAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CCTTAAAGGAGAGCCTGGTGGGCAGACCCAAGCATTTGACTTTTACTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118268 CCTTAAAGGAGAGCCTGGTGGGCAGACCCAAGCATTTGACTTTTACTCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GATATTTTGCACCGTGGGTTGGTGTGGCTGAAGACCCAGTGACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 118318 GATATTTTGCACCGTGGGTTGGTGTGGCTGAAGACCCAGTGACAGGTA..

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692     GGTCTGCACACGCTGTTCTCAGCAGCTACTGGTCCCAGCATCTGGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118368 .GAGGGTCTGCACACGCTGTTCTCAGCAGCTACTGGTCCCAGCATCTGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GAAGAAAGAAATGCATG         CTTTTCAGTGTTCCCACCGAGGAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 121481 GAAGAAAGAAATGCATGGTA...TAGCTTTTCAGTGTTCCCACCGAGGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 GAGAGCTGGGAATTTCCCTTCGTCCAGACGGAAGGGTTGACATTAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122580 GAGAGCTGGGAATTTCCCTTCGTCCAGACGGAAGGGTTGACATTAGAGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .
    829 GGTGCAGCTGTTGTTTTAGAGGGCACACTGACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122630 GGTGCAGCTGTTGTTTTAGAGGGCACACTGACAGCC