seq1 = pF1KB6327.tfa, 783 bp
seq2 = pF1KB6327/gi568815581f_38770190.tfa (gi568815581f:38770190_39018775), 248586 bp

>pF1KB6327 783
>gi568815581f:38770190_39018775 (Chr17)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-164  (107897-107991)   100% ->
165-249  (120231-120315)   100% ->
250-357  (128223-128330)   99% ->
358-508  (144136-144286)   99% ->
509-612  (144854-144957)   100% ->
613-783  (148416-148586)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCCCAACTGCGCCCGGTGCGGCAAGATCGTGTATCCCACGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCCCAACTGCGCCCGGTGCGGCAAGATCGTGTATCCCACGGAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGAACTGTCTGGATAAG         TTCTGGCATAAAGCATGCTTCC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGAACTGTCTGGATAAGGTG...CAGTTCTGGCATAAAGCATGCTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATTGCGAGACCTGCAAGATGACACTGAACATGAAGAACTACAAGGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107919 ATTGCGAGACCTGCAAGATGACACTGAACATGAAGAACTACAAGGGCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGAAGAAGCCCTACTGCAACGC         ACACTACCCCAAGCAGTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107969 GAGAAGAAGCCCTACTGCAACGCGTG...CAGACACTACCCCAAGCAGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTTCACCATGGTGGCGGACACCCCGGAAAACCTTCGCCTCAAGCAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120249 CTTCACCATGGTGGCGGACACCCCGGAAAACCTTCGCCTCAAGCAACAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGAGCTCCAGAGTCAG         GTGCGCTACAAGGAGGAGTTTGAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 120299 GTGAGCTCCAGAGTCAGGTG...CAGGTGCGCTACAAGGAGGAGTTTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAGAACAAGGGCAAAGGTTTCAGCGTAGTGGCAGACACGCCCGAGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128247 AAGAACAAGGGCAAAGGTTTCAGCGTAGTGGCAGACACGCCCGAGCTCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAGAATCAAGAAGACCCAGGACCAGATCAGTAAT         ATAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| >>>...>>>|||||||
 128297 GAGAATCAAGAAGACCCAGGACCAGATCAGTAACGTG...CAGATAAAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ACCATGAGGAGTTTGAGAAGAGCCGCATGGGCCCTAGCGGGGGCGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144143 ACCATGAGGAGTTTGAGAAGAGCCGCATGGGCCCTAGCGGGGGCGAGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATGGAGCCAGAGCGTCGGGATTCGCAGGACGGCAGCAGCTACCGGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 144193 ATGGAGCCAGAGCGTCGGGATTCACAGGACGGCAGCAGCTACCGGCGGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCTGGAGCAGCAGCAGCCTCACCACATCCCGACCAGTGCCCCGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 144243 CCTGGAGCAGCAGCAGCCTCACCACATCCCGACCAGTGCCCCGGGTG...

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    509    TTTACCAGCAGCCCCAGCAGCAGCCGGTGGCCCAGTCCTATGGTGGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144851 CAGTTTACCAGCAGCCCCAGCAGCAGCCGGTGGCCCAGTCCTATGGTGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TACAAGGAGCCTGCAGCCCCAGTCTCCATACAGCGCAGCGCCCCAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144901 TACAAGGAGCCTGCAGCCCCAGTCTCCATACAGCGCAGCGCCCCAGGTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGGCGGG         AAGCGGTACCGCGCGGTGTATGACTACAGCGCCG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144951 TGGCGGGGTG...CAGAAGCGGTACCGCGCGGTGTATGACTACAGCGCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCGACGAGGACGAGGTCTCCTTCCAGGACGGGGACACCATCGTCAACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148450 CCGACGAGGACGAGGTCTCCTTCCAGGACGGGGACACCATCGTCAACGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CAGCAGATCGACGACGGCTGGATGTACGGGACGGTGGAGCGCACCGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148500 CAGCAGATCGACGACGGCTGGATGTACGGGACGGTGGAGCGCACCGGCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .
    747 CACGGGGATGCTGCCGGCCAACTACGTGGAGGCCATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148550 CACGGGGATGCTGCCGGCCAACTACGTGGAGGCCATC