seq1 = pF1KB6326.tfa, 858 bp
seq2 = pF1KB6326/gi568815592r_7189867.tfa (gi568815592r:7189867_7413120), 223254 bp

>pF1KB6326 858
>gi568815592r:7189867_7413120 (Chr6)

(complement)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-192  (103092-103204)   100% ->
193-280  (109484-109571)   100% ->
281-543  (111549-111811)   100% ->
544-620  (114298-114374)   100% ->
621-699  (115120-115198)   100% ->
700-793  (117636-117729)   100% ->
794-858  (123190-123254)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGACTCCTCCCCCGCTTGCTGCTGCTTCTCTTACTCGTGTTCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGACTCCTCCCCCGCTTGCTGCTGCTTCTCTTACTCGTGTTCCCTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACTGTCTTGTTCCGAGGCGGCCCCAGAG         GCTTGTTAGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 CACTGTCTTGTTCCGAGGCGGCCCCAGAGGTG...TAGGCTTGTTAGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGCACAAGATCTTACAGAGGATGAAGAAACAGTAGAAGATTCCATAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103104 TGGCACAAGATCTTACAGAGGATGAAGAAACAGTAGAAGATTCCATAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGATGAAGATGATGAAGCCGAGGTAGAAGAAGATGAACCCACAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103154 GAGGATGAAGATGATGAAGCCGAGGTAGAAGAAGATGAACCCACAGATTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 G         GTAGAAGATAAAGAGGAAGAAGATGTGTCTGGTGAACCTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103204 GGTT...TAGGTAGAAGATAAAGAGGAAGAAGATGTGTCTGGTGAACCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGCTTCACCGAGTGCAGATACAACTATACTGTTTGTAAAAGGAGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 109524 AAGCTTCACCGAGTGCAGATACAACTATACTGTTTGTAAAAGGAGAAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    281        ATTTTCCAGCAAATAACATTGTGAAGTTCCTGGTAGGCTTTAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109574 A...CAGATTTTCCAGCAAATAACATTGTGAAGTTCCTGGTAGGCTTTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAACAAGGGTACAGAAGATTTTATTGTTGAATCCTTAGATGCCTCATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111592 CAACAAGGGTACAGAAGATTTTATTGTTGAATCCTTAGATGCCTCATTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTTATCCTCAGGACTACCAGTTTTATATCCAGAATTTCACAGCTCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111642 GTTATCCTCAGGACTACCAGTTTTATATCCAGAATTTCACAGCTCTTCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGAACACTGTAGTGCCACCCCAGAGACAGGCAACTTTTGAGTACTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111692 CTGAACACTGTAGTGCCACCCCAGAGACAGGCAACTTTTGAGTACTCTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATTCCTGCAGAGCCCATGGGCGGACGACCATTTGGTTTGGTCATCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111742 CATTCCTGCAGAGCCCATGGGCGGACGACCATTTGGTTTGGTCATCAATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGAACTACAAAGATTTGAAC         GGCAATGTATTCCAAGATGCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 111792 TGAACTACAAAGATTTGAACGTA...CAGGGCAATGTATTCCAAGATGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTCTTCAATCAAACAGTTACAGTTATTGAAAGAGAGGATGGGTTAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114319 GTCTTCAATCAAACAGTTACAGTTATTGAAAGAGAGGATGGGTTAGATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGAAAC         AATCTTTATGTATATGTTCCTTGCTGGTCTTGGGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114369 AGAAACGTA...CAGAATCTTTATGTATATGTTCCTTGCTGGTCTTGGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTCTGGTTATTGTTGGCCTTCATCAACTCCTAGAATCTAGAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 115155 TTCTGGTTATTGTTGGCCTTCATCAACTCCTAGAATCTAGAAAGGTA...

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    700    CGTAAGAGACCCATACAGAAAGTAGAAATGGGTACATCAAGTCAGAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117633 TAGCGTAAGAGACCCATACAGAAAGTAGAAATGGGTACATCAAGTCAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGATGTTGACATGAGTTGGATTCCTCAGGAAACATTGAATCAAATCA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 117683 TGATGTTGACATGAGTTGGATTCCTCAGGAAACATTGAATCAAATCAGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    794       ATAAAGCTTCACCAAGAAGGTTGCCCAGGAAACGGGCACAGAAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117733 ...CAGATAAAGCTTCACCAAGAAGGTTGCCCAGGAAACGGGCACAGAAG

    900     .    :    .    :
    838 AGATCAGTGGGATCTGATGAG
        |||||||||||||||||||||
 123234 AGATCAGTGGGATCTGATGAG