seq1 = pF1KB6324.tfa, 846 bp
seq2 = pF1KB6324/gi568815593r_34808768.tfa (gi568815593r:34808768_35014892), 206125 bp

>pF1KB6324 846
>gi568815593r:34808768_35014892 (Chr5)

(complement)

1-198  (100001-100198)   100% ->
199-307  (101315-101423)   100% ->
308-566  (103081-103339)   100% ->
567-665  (105537-105635)   100% ->
666-846  (105945-106125)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCCTTCTGACCCAACAGATCCAAGACGAGGATGATCAGTACAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCCTTCTGACCCAACAGATCCAAGACGAGGATGATCAGTACAGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGGCCAGCCTTGACAACGTTAGGAATCTCTCCACTATCTTGAAAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTGGCCAGCCTTGACAACGTTAGGAATCTCTCCACTATCTTGAAAGCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCATTTCCGAGAACATGCCACGTGTTTCGCAACTAAAAATGGTATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTCATTTCCGAGAACATGCCACGTGTTTCGCAACTAAAAATGGTATCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTAACAGTGGAAAATGCAAAGTGTGTGCAAGCAAATGCTTTTATTCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100151 GTAACAGTGGAAAATGCAAAGTGTGTGCAAGCAAATGCTTTTATTCAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199        GCTGGAATATTTCAGGAGTTTAAAGTTCAGGAAGAGTCTGTTA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 A...TAGGCTGGAATATTTCAGGAGTTTAAAGTTCAGGAAGAGTCTGTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTTTTCGAATTAATTTAACTGTCCTTTTAGACTGTTTATCTATTTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101358 CTTTTCGAATTAATTTAACTGTCCTTTTAGACTGTTTATCTATTTTTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCAAGTCCTATGCCAG         GGACTTTAACTGCACTTCGAATGTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101408 TCAAGTCCTATGCCAGGTA...CAGGGACTTTAACTGCACTTCGAATGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTACCAAGGTTATGGTTACCCTTTGATGCTGTTCCTGGAAGAAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103106 TTACCAAGGTTATGGTTACCCTTTGATGCTGTTCCTGGAAGAAGGAGGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGTGACAGTCTGCAAAATCAATACACAGGAACCTGAGGAGACCCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103156 TGGTGACAGTCTGCAAAATCAATACACAGGAACCTGAGGAGACCCTGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTTGATTTCTGCAGCACCAATGTTATTAATAAAATTATTCTGCAGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103206 TTTGATTTCTGCAGCACCAATGTTATTAATAAAATTATTCTGCAGTCAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGGGCTCCGTGAAGCATTTTCTGAATTGGATATGACGAGTGAAGTCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103256 GGGGCTCCGTGAAGCATTTTCTGAATTGGATATGACGAGTGAAGTCCTAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAATTACCATGTCTCCTGACAAGCCTTATTTCAG         GTTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 103306 AAATTACCATGTCTCCTGACAAGCCTTATTTCAGGTA...TAGGTTATCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACTTTTGGAAATGCAGGAAGTTCCCACCTTGACTATCCCAAAGATTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105544 ACTTTTGGAAATGCAGGAAGTTCCCACCTTGACTATCCCAAAGATTCTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TTTGATGGAAGCATTTCATTGTAATCAGACCCAAGTCAACAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 105594 TTTGATGGAAGCATTTCATTGTAATCAGACCCAAGTCAACAGGTC...CA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    666  ATACAAGATTTCCTTACTGAAACCCTCTACAAAGGCATTAGTCCTATCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105944 GATACAAGATTTCCTTACTGAAACCCTCTACAAAGGCATTAGTCCTATCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TGTAAGGTATCTATTCGGACAGATAACAGAGGCTTCCTTTCATTACAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105994 TGTAAGGTATCTATTCGGACAGATAACAGAGGCTTCCTTTCATTACAGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TATGATTAGAAATGAAGATGGACAAATATGTTTTGTGGAATATTACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106044 TATGATTAGAAATGAAGATGGACAAATATGTTTTGTGGAATATTACTGCT

    850     .    :    .    :    .    :
    815 GCCCTGATGAAGAAGTTCCTGAATCTGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 106094 GCCCTGATGAAGAAGTTCCTGAATCTGAGTCT