seq1 = pF1KB6316.tfa, 843 bp
seq2 = pF1KB6316/gi568815577f_14116187.tfa (gi568815577f:14116187_14327290), 211104 bp

>pF1KB6316 843
>gi568815577f:14116187_14327290 (Chr21)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-259  (103377-103539)   100% ->
260-332  (104911-104983)   100% ->
333-432  (108252-108351)   100% ->
433-843  (110694-111104)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCCCTGCTCAGGAGGAGGCCGACAGGACCGTGTTTGTTGGGAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCCCTGCTCAGGAGGAGGCCGACAGGACCGTGTTTGTTGGGAATTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGGCCCGAGTTCGGGAAGAGATTCTGTACGAGCTGTTCCTTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 AGAGGCCCGAGTTCGGGAAGAGATTCTGTACGAGCTGTTCCTTCAGGTA.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      GCGGGGCCACTAACCAAAGTGACTATATGCAAAGACAGAGAAGGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..TAGGCGGGGCCACTAACCAAAGTGACTATATGCAAAGACAGAGAAGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGCCAAAGTCTTTTGGATTTGTCTGCTTTAAACACCCAGAATCGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103422 AAGCCAAAGTCTTTTGGATTTGTCTGCTTTAAACACCCAGAATCGGTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTATGCCATAGCTTTGCTGAATGGAATTCGTTTATATGGAAGACCAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103472 TTATGCCATAGCTTTGCTGAATGGAATTCGTTTATATGGAAGACCAATTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACGTGCAGTATCGATTTG         GGAGTTCTCGCTCTTCTGAACCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103522 ACGTGCAGTATCGATTTGGTA...AAGGGAGTTCTCGCTCTTCTGAACCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCTAACCAAAGTTTTGAGAGCTGTGTTAAGATAAATTCACACAACTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104934 GCTAACCAAAGTTTTGAGAGCTGTGTTAAGATAAATTCACACAACTACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333          GAATGAAGAAATGTTGGTGGGCAGATCTTCCTTTCCCATGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104984 GTA...AAGGAATGAAGAAATGTTGGTGGGCAGATCTTCCTTTCCCATGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGTATTTTCCAATTAATAATACTTCTTTACCTCAAGAATATTTTCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108293 AGTATTTTCCAATTAATAATACTTCTTTACCTCAAGAATATTTTCTCTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAGAAGATG         CAGTGGCATGTGTATAATCCAGTGCTGCAGCT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 108343 CAGAAGATGGTA...CAGCAGTGGCATGTGTATAATCCAGTGCTGCAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCCTTACTATGAAATGACAGCTCCACTTCCTAATAGTGCATCCGTGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110726 TCCTTACTATGAAATGACAGCTCCACTTCCTAATAGTGCATCCGTGTCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCTCACTGAATCATGTTCCAGATCTTGAGGCTGGACCCAGCTCATATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110776 CCTCACTGAATCATGTTCCAGATCTTGAGGCTGGACCCAGCTCATATAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TGGACTCACCAACAACCAAGTGACTCTGACCTTTATCAGATGACAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110826 TGGACTCACCAACAACCAAGTGACTCTGACCTTTATCAGATGACAGCTCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACTTCCTAATAGTGCATCCGTGTCTTCCTCACTGAATCATGTTCCAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110876 ACTTCCTAATAGTGCATCCGTGTCTTCCTCACTGAATCATGTTCCAGATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTGAGGCTGGACCCAGCTCATATAAATGGACTCACCAACAACCAAGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110926 TTGAGGCTGGACCCAGCTCATATAAATGGACTCACCAACAACCAAGTGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TCTGACCTTTATCAGATGAATAAACGAAAGAGACAAAAGCAAACAAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110976 TCTGACCTTTATCAGATGAATAAACGAAAGAGACAAAAGCAAACAAGTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TAGTGATAGTAGCACAGACAACAACAGAGGCAACGAATGTAGCCAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111026 TAGTGATAGTAGCACAGACAACAACAGAGGCAACGAATGTAGCCAAAAGT

    850     .    :    .    :    .
    815 TCCGAAAGTCTAAGAAGAAGAAAAGATAC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 111076 TCCGAAAGTCTAAGAAGAAGAAAAGATAC