seq1 = pF1KB6309.tfa, 774 bp
seq2 = pF1KB6309/gi568815579f_17411673.tfa (gi568815579f:17411673_17621078), 209406 bp

>pF1KB6309 774
>gi568815579f:17411673_17621078 (Chr19)

1-288  (100001-100288)   100% ->
289-396  (104501-104608)   100% ->
397-498  (105616-105717)   100% ->
499-639  (106038-106178)   99% ->
640-774  (109272-109406)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCGCCGGCCCCGGGCCTCATCTCGGTGTTCTCGAGTTCCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGCGCCGGCCCCGGGCCTCATCTCGGTGTTCTCGAGTTCCCAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGGTGCGGCGCTAGCGCAGCTGGTGGCCCAGCGCGCAGCATGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGGTGCGGCGCTAGCGCAGCTGGTGGCCCAGCGCGCAGCATGCTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCAGGGGCCCGCGCCCGTTTCGCGCTCGGCCTGTCGGGCGGGAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCAGGGGCCCGCGCCCGTTTCGCGCTCGGCCTGTCGGGCGGGAGCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCTCGATGCTAGCCCGCGAGCTACCCGCCGCCGTCGCCCCTGCCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCTCGATGCTAGCCCGCGAGCTACCCGCCGCCGTCGCCCCTGCCGGGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCTAGCTTAGCGCGCTGGACGCTGGGCTTCTGCGACGAGCGCCTCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGCTAGCTTAGCGCGCTGGACGCTGGGCTTCTGCGACGAGCGCCTCGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTTCGATCACGCCGAGAGCACGTACGGCCTCTACCGG         ACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100251 CCTTCGATCACGCCGAGAGCACGTACGGCCTCTACCGGGTG...CAGACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CATCTTCTCTCCAGACTGCCGATCCCAGAAAGCCAGGTGATCACCATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104504 CATCTTCTCTCCAGACTGCCGATCCCAGAAAGCCAGGTGATCACCATTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCCCGAGCTGCCTGTGGAGGAGGCGGCTGAGGACTACGCCAAGAAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104554 CCCCGAGCTGCCTGTGGAGGAGGCGGCTGAGGACTACGCCAAGAAGCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GACAG         GCATTCCAAGGGGACTCCATCCCGGTTTTCGACCTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104604 GACAGGTG...CAGGCATTCCAAGGGGACTCCATCCCGGTTTTCGACCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTGATCCTGGGGGTGGGCCCCGATGGTCACACCTGCTCACTCTTCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105652 CTGATCCTGGGGGTGGGCCCCGATGGTCACACCTGCTCACTCTTCCCAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCACCCCCTCCTACAG         GAGCGGGAGAAGATTGTGGCTCCCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105702 CCACCCCCTCCTACAGGTG...AAGGAGCGGGAGAAGATTGTGGCTCCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCAGTGACTCCCCGAAGCCACCGCCACAGCGTGTGACCCTCACGCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 106063 TCAGTGACTCCCCGAAGCCACCGCCACAGCGTGTGACCCTCACACTACCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTCCTGAATGCAGCACGAACTGTCATCTTTGTGGCAACTGGAGAAGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106113 GTCCTGAATGCAGCACGAACTGTCATCTTTGTGGCAACTGGAGAAGGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGCAGCTGTTCTGAAG         CGCATTTTGGAGGACCAGGAGGAAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 106163 GGCAGCTGTTCTGAAGGTA...CAGCGCATTTTGGAGGACCAGGAGGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACCCGCTGCCCGCCGCCCTGGTCCAGCCCCACACCGGGAAACTGTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109297 ACCCGCTGCCCGCCGCCCTGGTCCAGCCCCACACCGGGAAACTGTGCTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTCTTGGACGAGGCGGCCGCCCGCCTCCTGACCGTGCCCTTCGAGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109347 TTCTTGGACGAGGCGGCCGCCCGCCTCCTGACCGTGCCCTTCGAGAAGCA

    800     .    :
    765 TTCCACTTTG
        ||||||||||
 109397 TTCCACTTTG