seq1 = pF1KB6306.tfa, 840 bp
seq2 = pF1KB6306/gi568815597r_37897408.tfa (gi568815597r:37897408_38099412), 202005 bp

>pF1KB6306 840
>gi568815597r:37897408_38099412 (Chr1)

(complement)

1-156  (100001-100156)   100% ->
157-331  (100265-100439)   100% ->
332-501  (101281-101450)   100% ->
502-688  (101543-101729)   99% ->
689-840  (101854-102005)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGAGTCATTTGACTGTGCAAAATGCAACGAGTCCCTGTATGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCGAGTCATTTGACTGTGCAAAATGCAACGAGTCCCTGTATGGACG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGTACATCCAGACAGACAGCGGCCCCTACTGTGTGCCCTGCTATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGTACATCCAGACAGACAGCGGCCCCTACTGTGTGCCCTGCTATGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATACCTTTGCCAACACCTGTGCTGAGTGCCAGCAGCTTATCGGGCATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATACCTTTGCCAACACCTGTGCTGAGTGCCAGCAGCTTATCGGGCATGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGAGG         GAGCTGTTCTATGAAGACCGCCATTTCCACGAGGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCGAGGGTA...CAGGAGCTGTTCTATGAAGACCGCCATTTCCACGAGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGCTTCCGCTGCTGCCGCTGCCAGCGCTCACTAGCCGATGAACCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100300 CTGCTTCCGCTGCTGCCGCTGCCAGCGCTCACTAGCCGATGAACCCTTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTGCCAGGACAGTGAGCTGCTCTGCAATGACTGCTACTGCAGTGCGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100350 CCTGCCAGGACAGTGAGCTGCTCTGCAATGACTGCTACTGCAGTGCGTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCCTCGCAGTGCTCCGCTTGTGGGGAGACTGTCATGCCTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100400 TCCTCGCAGTGCTCCGCTTGTGGGGAGACTGTCATGCCTGGTA...CAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTCCCGGAAGCTGGAATATGGAGGCCAGACATGGCATGAGCACTGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101282 GTCCCGGAAGCTGGAATATGGAGGCCAGACATGGCATGAGCACTGCTTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGTGCAGTGGCTGTGAACAGCCACTGGGCTCCCGTTCTTTTGTGCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101332 TGTGCAGTGGCTGTGAACAGCCACTGGGCTCCCGTTCTTTTGTGCCCGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAGGGTGCTCACTACTGCGTGCCCTGCTATGAGAACAAGTTTGCTCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101382 AAGGGTGCTCACTACTGCGTGCCCTGCTATGAGAACAAGTTTGCTCCTCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTGCGCCCGCTGCAGCAAG         ACGCTGACACAGGGTGGAGTGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 101432 CTGCGCCCGCTGCAGCAAGGTG...CAGACGCTGACACAGGGTGGAGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CATACCGTGATCAGCCATGGCATCGAGAATGTCTGGTCTGTACCGGATGC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 101565 CATACCGTGATCAGCCGTGGCATCGAGAATGTCTGGTCTGTACCGGATGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CAGACGCCCCTGGCAGGGCAGCAGTTCACCTCCCGGGATGAAGATCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101615 CAGACGCCCCTGGCAGGGCAGCAGTTCACCTCCCGGGATGAAGATCCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTGTGTGGCCTGTTTTGGAGAACTCTTTGCACCTAAGTGCAGCAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101665 CTGTGTGGCCTGTTTTGGAGAACTCTTTGCACCTAAGTGCAGCAGCTGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGCGCCCCATCGTAG         GACTCGGTGGAGGCAAGTATGTGTCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101715 AGCGCCCCATCGTAGGTG...CAGGACTCGGTGGAGGCAAGTATGTGTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTTGAAGACCGACACTGGCACCACAACTGCTTCTCCTGCGCCCGCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101880 TTTGAAGACCGACACTGGCACCACAACTGCTTCTCCTGCGCCCGCTGCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TACCTCCCTGGTGGGCCAGGGCTTCGTACCGGATGGAGACCAAGTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101930 TACCTCCCTGGTGGGCCAGGGCTTCGTACCGGATGGAGACCAAGTGCTCT

    850     .    :    .    :    .
    815 GCCAGGGCTGTAGCCAGGCAGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||
 101980 GCCAGGGCTGTAGCCAGGCAGGGCCC