seq1 = pF1KB6305.tfa, 774 bp
seq2 = pF1KB6305/gi568815586r_51229682.tfa (gi568815586r:51229682_51445878), 216197 bp

>pF1KB6305 774
>gi568815586r:51229682_51445878 (Chr12)

(complement)

1-16  (99241-99256)   100% ->
17-99  (100002-100084)   100% ->
100-200  (102026-102126)   100% ->
201-326  (103179-103304)   100% ->
327-463  (104499-104635)   100% ->
464-609  (105874-106019)   100% ->
610-770  (116046-116205)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGTCCTTTATG         GACACAGCACCCAGGACCTTCCGGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
  99241 ATGCTGGTCCTTTATGGTA...AAGGACACAGCACCCAGGACCTTCCGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AACCAATGCCCGCGTAGTCGGAGGGACTGAGGCCGGGAGGAATTCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100027 AACCAATGCCCGCGTAGTCGGAGGGACTGAGGCCGGGAGGAATTCCTGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCTCTCAG         ATTTCCCTCCAGTACCGGTCTGGAGGTTCCCGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100077 CCTCTCAGGTG...TAGATTTCCCTCCAGTACCGGTCTGGAGGTTCCCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TATCACACCTGTGGAGGGACCCTTATCAGACAGAACTGGGTGATGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102059 TATCACACCTGTGGAGGGACCCTTATCAGACAGAACTGGGTGATGACAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCTCACTGCGTGGATTA         CCAGAAGACTTTCCGCGTGGTGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102109 TGCTCACTGCGTGGATTAGTA...CAGCCAGAAGACTTTCCGCGTGGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CTGGAGACCATAACCTGAGCCAGAATGATGGCACTGAGCAGTACGTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103202 CTGGAGACCATAACCTGAGCCAGAATGATGGCACTGAGCAGTACGTGAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTGCAGAAGATCGTGGTGCATCCATACTGGAACAGCGATAACGTGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103252 GTGCAGAAGATCGTGGTGCATCCATACTGGAACAGCGATAACGTGGCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CGG         CTATGACATCGCCCTGCTGCGCCTGGCCCAGAGCGTTA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103302 CGGGTA...CAGCTATGACATCGCCCTGCTGCGCCTGGCCCAGAGCGTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CCCTCAATAGCTATGTCCAGCTGGGTGTTCTGCCCCAGGAGGGAGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104537 CCCTCAATAGCTATGTCCAGCTGGGTGTTCTGCCCCAGGAGGGAGCCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGGCTAACAACAGTCCCTGCTACATCACAGGCTGGGGCAAGACCAAGA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 104587 CTGGCTAACAACAGTCCCTGCTACATCACAGGCTGGGGCAAGACCAAGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    464         CCAATGGGCAGCTGGCCCAGACCCTGCAGCAGGCTTACCTGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104637 TA...CAGCCAATGGGCAGCTGGCCCAGACCCTGCAGCAGGCTTACCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCTCTGTGGACTACGCCATCTGCTCCAGCTCCTCCTACTGGGGCTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105916 CCTCTGTGGACTACGCCATCTGCTCCAGCTCCTCCTACTGGGGCTCCACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GTGAAGAACACCATGGTGTGTGCTGGTGGAGATGGAGTTCGCTCTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105966 GTGAAGAACACCATGGTGTGTGCTGGTGGAGATGGAGTTCGCTCTGGATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCAG         GGTGACTCTGGGGGCCCCCTCCATTGCTTGGTGAATG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106016 CCAGGTG...CAGGGTGACTCTGGGGGCCCCCTCCATTGCTTGGTGAATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GCAAGTATTCTGTCCATGGAGTGACCAGCTTTGTGTCCAGCCGGGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116083 GCAAGTATTCTGTCCATGGAGTGACCAGCTTTGTGTCCAGCCGGGGCTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AATGTCTCCAGGAAGCCTACAGTCTTCACCCAGGTCTCTGCTTACATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116133 AATGTCTCCAGGAAGCCTACAGTCTTCACCCAGGTCTCTGCTTACATCTC

    800     .    :    .    :    .
    747 CTGGATAAATAATGTCA TCGCCTC
        ||||||||||||||| |-||-|-||
 116183 CTGGATAAATAATGTGAGTC C TC