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seq2 = pF1KB6278/gi568815596r_173809944.tfa (gi568815596r:173809944_174064554), 254611 bp

>pF1KB6278 2343
>gi568815596r:173809944_174064554 (Chr2)

(complement)

1-156  (99996-100150)   98% ->
157-279  (100672-100794)   100% ->
280-1639  (108323-109682)   100% ->
1640-1832  (145770-145962)   100% ->
1833-2029  (151289-151485)   100% ->
2030-2343  (154298-154611)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCGCTCCCGAAAAGCCCGTGAAACAAGAGGAAATGGCTGCCTTGGA
         ||-| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 CTG CAGCTCCCGAAAAGCCCGTGAAACAAGAGGAAATGGCTGCCTTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGGATAGCGGCGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGCGGCCACGGCGAGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100045 CGTGGATAGCGGCGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGCGGCCACGGCGAGTATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCAGCAGCAGCAACAGCACGGAAACGGTGCGGTGGCGGCGGCAGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100095 TGCAGCAGCAGCAACAGCACGGAAACGGTGCGGTGGCGGCGGCAGCGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCCAG         GACACTCAGCCGTCACCGCTCGCTCTGCTGGCCGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100145 GCCCAGGTG...TAGGACACTCAGCCGTCACCGCTCGCTCTGCTGGCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TACCTGCAGCAAGATAGGGCCGCCATCGCCGGGCGACGACGAGGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100707 TACCTGCAGCAAGATAGGGCCGCCATCGCCGGGCGACGACGAGGAGGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGGCCGCCGCAGCCGGGGCCCCCGCCGCCGCCGGAGCG         ACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100757 CGGCCGCCGCAGCCGGGGCCCCCGCCGCCGCCGGAGCGGTA...CAGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGTGATTTGGCTTCTGCACAGTTAGGAGGAGCACCAAACCGATGGGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108326 GGTGATTTGGCTTCTGCACAGTTAGGAGGAGCACCAAACCGATGGGAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTTGTCAGCCACACCTACAACTATAAAAGATGAAGCTGGTAATCTAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108376 TTTGTCAGCCACACCTACAACTATAAAAGATGAAGCTGGTAATCTAGTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGATTCCAAGTGCTGCTACTTCAAGTGGGCAGTATGTTCTTCCCCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108426 AGATTCCAAGTGCTGCTACTTCAAGTGGGCAGTATGTTCTTCCCCTTCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AATTTGCAGAATCAACAAATATTTTCCGTTGCACCAGGATCAGATTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108476 AATTTGCAGAATCAACAAATATTTTCCGTTGCACCAGGATCAGATTCATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AAATGGTACAGTGTCCAGTGTTCAATATCAAGTGATACCACAGATCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108526 AAATGGTACAGTGTCCAGTGTTCAATATCAAGTGATACCACAGATCCAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CAGCAGATGGTCAGCAGGTTCAAATTGGTTTCACAGGCTCTTCAGATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108576 CAGCAGATGGTCAGCAGGTTCAAATTGGTTTCACAGGCTCTTCAGATAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGGGGTATAAATCAAGAAAGCAGTCAAATTCAGATCATTCCTGGCTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108626 GGGGGTATAAATCAAGAAAGCAGTCAAATTCAGATCATTCCTGGCTCTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TCAAACCTTACTTGCCTCTGGAACACCTTCTGCTAACATCCAGAATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108676 TCAAACCTTACTTGCCTCTGGAACACCTTCTGCTAACATCCAGAATCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TACCACAGACTGGTCAAGTCCAGGTTCAGGGAGTTGCAATTGGTGGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108726 TACCACAGACTGGTCAAGTCCAGGTTCAGGGAGTTGCAATTGGTGGTTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TCTTTTCCTGGTCAAACCCAAGTAGTTGCTAATGTGCCTCTTGGTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108776 TCTTTTCCTGGTCAAACCCAAGTAGTTGCTAATGTGCCTCTTGGTCTGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 AGGAAATATTACGTTTGTACCAATCAATAGTGTCGATCTAGATTCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108826 AGGAAATATTACGTTTGTACCAATCAATAGTGTCGATCTAGATTCTTTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GACTCTCGGGCAGTTCTCAGACAATGACTGCAGGCATTAATGCCGACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108876 GACTCTCGGGCAGTTCTCAGACAATGACTGCAGGCATTAATGCCGACGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CATTTGATAAACACAGGACAAGCTATGGATAGTTCAGACAATTCAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108926 CATTTGATAAACACAGGACAAGCTATGGATAGTTCAGACAATTCAGAAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GACTGGTGAGCGGGTTTCTCCTGATATTAATGAAACTAATACTGATACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108976 GACTGGTGAGCGGGTTTCTCCTGATATTAATGAAACTAATACTGATACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ATTTATTTGTGCCAACATCCTCTTCATCACAGTTGCCTGTTACGATAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109026 ATTTATTTGTGCCAACATCCTCTTCATCACAGTTGCCTGTTACGATAGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 AGTACAGGTATATTACAACAAAACACAAATAGCTTGACTACATCTAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109076 AGTACAGGTATATTACAACAAAACACAAATAGCTTGACTACATCTAGTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GCAGGTTCATTCTTCAGATCTTCAGGGAAATTATATCCAGTCGCCTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109126 GCAGGTTCATTCTTCAGATCTTCAGGGAAATTATATCCAGTCGCCTGTTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CTGAAGAGACACAGGCACAGAATATTCAGGTTTCTACAGCACAGCCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109176 CTGAAGAGACACAGGCACAGAATATTCAGGTTTCTACAGCACAGCCTGTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GTACAGCATCTACAACTTCAAGAGTCTCAGCAGCCAACCAGTCAAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109226 GTACAGCATCTACAACTTCAAGAGTCTCAGCAGCCAACCAGTCAAGCCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 AATTGTGCAAGGTATTACACCACAGACAATCCATGGTGTGCAAGCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109276 AATTGTGCAAGGTATTACACCACAGACAATCCATGGTGTGCAAGCCAGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 GTCAAAATATATCACAACAGGCTTTGCAAAATCTTCAGTTGCAGCTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109326 GTCAAAATATATCACAACAGGCTTTGCAAAATCTTCAGTTGCAGCTGAAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 CCTGGAACCTTTTTAATTCAGGCACAGACAGTGACCCCTTCTGGACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109376 CCTGGAACCTTTTTAATTCAGGCACAGACAGTGACCCCTTCTGGACAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 AACTTGGCAAACGTTTCAAGTACAAGGGGTCCAGAACTTGCAGAATTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109426 AACTTGGCAAACGTTTCAAGTACAAGGGGTCCAGAACTTGCAGAATTTGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 AAATACAGAATACTGCTGCCCAACAAATAACTTTGACGCCTGTTCAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109476 AAATACAGAATACTGCTGCCCAACAAATAACTTTGACGCCTGTTCAAACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 CTCACACTTGGTCAAGTTGCGGCAGGTGGAGCCTTCACTTCAACTCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109526 CTCACACTTGGTCAAGTTGCGGCAGGTGGAGCCTTCACTTCAACTCCAGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 TAGTCTAAGCACTGGTCAGTTGCCAAATCTACAAACAGTTACAGTGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109576 TAGTCTAAGCACTGGTCAGTTGCCAAATCTACAAACAGTTACAGTGAACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 CTATAGATTCTGCTGGTATACAGCTACATCCAGGAGAGAATGCTGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109626 CTATAGATTCTGCTGGTATACAGCTACATCCAGGAGAGAATGCTGACAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 CCTGCAG         ATATTAGGATCAAGGAAGAAGAACCTGATCCTGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109676 CCTGCAGGTG...TAGATATTAGGATCAAGGAAGAAGAACCTGATCCTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 AGAGTGGCAGCTCAGTGGTGATTCTACCTTGAATACCAATGACCTAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145804 AGAGTGGCAGCTCAGTGGTGATTCTACCTTGAATACCAATGACCTAACAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 ACTTAAGAGTACAGGTGGTAGATGAAGAAGGGGACCAACAACATCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145854 ACTTAAGAGTACAGGTGGTAGATGAAGAAGGGGACCAACAACATCAAGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 GGAAAAAGACTTCGGAGGGTAGCTTGCACCTGTCCCAACTGTAAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145904 GGAAAAAGACTTCGGAGGGTAGCTTGCACCTGTCCCAACTGTAAAGAAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 TGGTGGAAG         AGGTACCAATCTTGGGAAAAAGAAGCAACACA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 145954 TGGTGGAAGGTA...TAGAGGTACCAATCTTGGGAAAAAGAAGCAACACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 TTTGTCATATACCAGGATGTGGTAAAGTCTATGGGAAGACCTCACATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151321 TTTGTCATATACCAGGATGTGGTAAAGTCTATGGGAAGACCTCACATCTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915 AGAGCTCATCTGCGTTGGCATTCTGGAGAACGCCCTTTTGTTTGTAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151371 AGAGCTCATCTGCGTTGGCATTCTGGAGAACGCCCTTTTGTTTGTAACTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1965 GATGTACTGTGGTAAAAGATTTACTCGAAGTGATGAATTACAGAGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151421 GATGTACTGTGGTAAAAGATTTACTCGAAGTGATGAATTACAGAGGCACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2015 GAAGAACACATACAG         GTGAGAAGAAATTTGTTTGTCCAGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 151471 GAAGAACACATACAGGTT...CAGGTGAGAAGAAATTTGTTTGTCCAGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 TGTTCAAAACGCTTTATGAGAAGTGACCACCTTGCCAAACATATTAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154324 TGTTCAAAACGCTTTATGAGAAGTGACCACCTTGCCAAACATATTAAAAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2106 ACACCAGAATAAAAAAGGTATTCACTCTAGCAGTACAGTGCTGGCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154374 ACACCAGAATAAAAAAGGTATTCACTCTAGCAGTACAGTGCTGGCATCTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2156 TGGAAGCTGCGCGAGATGATACTTTGATTACTGCAGGAGGAACAACGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154424 TGGAAGCTGCGCGAGATGATACTTTGATTACTGCAGGAGGAACAACGCTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2206 ATCCTTGCAAATATTCAACAAGGTTCTGTTTCAGGGATAGGAACTGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154474 ATCCTTGCAAATATTCAACAAGGTTCTGTTTCAGGGATAGGAACTGTTAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2256 TACTTCCGCCACCAGCAATCAAGATATCCTTACCAACACTGAAATACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154524 TACTTCCGCCACCAGCAATCAAGATATCCTTACCAACACTGAAATACCTT

   2350     .    :    .    :    .    :    .
   2306 TACAGCTTGTCACAGTTTCTGGAAATGAGACAATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154574 TACAGCTTGTCACAGTTTCTGGAAATGAGACAATGGAG