seq1 = pF1KB6271.tfa, 2010 bp
seq2 = pF1KB6271/gi568815590f_143268988.tfa (gi568815590f:143268988_143482648), 213661 bp

>pF1KB6271 2010
>gi568815590f:143268988_143482648 (Chr8)

1-60  (100001-100060)   100% ->
61-176  (106566-106681)   100% ->
177-305  (107538-107666)   100% ->
306-381  (108393-108468)   100% ->
382-459  (109282-109359)   100% ->
460-584  (109709-109833)   100% ->
585-751  (109925-110091)   100% ->
752-945  (110328-110521)   100% ->
946-1102  (110842-110998)   100% ->
1103-1216  (111075-111188)   100% ->
1217-1411  (111602-111796)   100% ->
1412-1488  (112281-112357)   100% ->
1489-1635  (112585-112731)   100% ->
1636-1797  (112820-112981)   100% ->
1798-2010  (113449-113661)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCCTGGAGGAGAGGCCGGACGGCGCGGGCGCCGGCGAGGAGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCCTGGAGGAGAGGCCGGACGGCGCGGGCGCCGGCGAGGAGAGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGGCTGCAG         GGCTGTGACTCCCTGACGCAGATCCAGTGCG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGGCTGCAGGTG...CAGGGCTGTGACTCCCTGACGCAGATCCAGTGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCCAGCTGCAGAGCCGCAGGGCCCAGATTCACCAGCAGATTGACAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106597 GCCAGCTGCAGAGCCGCAGGGCCCAGATTCACCAGCAGATTGACAAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGCAGATGCGGACGGGCGCTGAGAACCTCTACAG         AGCCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 106647 CTGCAGATGCGGACGGGCGCTGAGAACCTCTACAGGTC...CAGAGCCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAGCAACAACCGGGTGAGAGAGACGGTCGCCCTGGAGCTGAGCTACGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107544 CAGCAACAACCGGGTGAGAGAGACGGTCGCCCTGGAGCTGAGCTACGTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTCCAACCTGCAGCTGCTGAAGGAGGAGCTGGAGGAGCTCAGCGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107594 ACTCCAACCTGCAGCTGCTGAAGGAGGAGCTGGAGGAGCTCAGCGGTGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGGACCCTGGCCGGCATGGGAG         CGAAGCTGTCACTGTCCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107644 GTGGACCCTGGCCGGCATGGGAGGTG...CAGCGAAGCTGTCACTGTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CATGATCCCCCTGGGCCTGAAGGAGACCAAGGAGCTGGACTGGTCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108411 CATGATCCCCCTGGGCCTGAAGGAGACCAAGGAGCTGGACTGGTCTACAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CGCTGAAG         GAGCTGATCTCAGTGCACTTTGGAGAGGACGGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108461 CGCTGAAGGTA...CAGGAGCTGATCTCAGTGCACTTTGGAGAGGACGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCCTCCTACGAGGCAGAAATCAGGGAGCTGGAGGCCCTGCGGCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 109315 GCCTCCTACGAGGCAGAAATCAGGGAGCTGGAGGCCCTGCGGCAGGTG..

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    460     GCCATGCGGACCCCCAGCCGGAATGAGTCGGGCCTGGAGCTGCTCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109365 .CAGGCCATGCGGACCCCCAGCCGGAATGAGTCGGGCCTGGAGCTGCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CAGCCTATTACAACCAGCTGTGCTTCCTGGATGCGCGCTTCCTCACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109755 CAGCCTATTACAACCAGCTGTGCTTCCTGGATGCGCGCTTCCTCACCCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCCAGGAGCCTCGGGCTCTTCTTCCACTG         GTACGACTCGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 109805 GCCAGGAGCCTCGGGCTCTTCTTCCACTGGTA...CAGGTACGACTCGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TACTGGGGTCCCGGCCCAGCAGCGTGCCCTGGCCTTCGAGAAGGGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109937 TACTGGGGTCCCGGCCCAGCAGCGTGCCCTGGCCTTCGAGAAGGGCAGCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TTCTCTTCAACATCGGTGCCCTCCACACGCAGATTGGGGCGCGCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109987 TTCTCTTCAACATCGGTGCCCTCCACACGCAGATTGGGGCGCGCCAGGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CGCTCCTGCACCGAGGGTGCCCGCCGCGCTATGGAGGCCTTCCAGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110037 CGCTCCTGCACCGAGGGTGCCCGCCGCGCTATGGAGGCCTTCCAGAGGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CGCTG         GGGCCTTCAGCCTCCTGAGGGAGAACTTCTCCCATG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110087 CGCTGGTG...CAGGGGCCTTCAGCCTCCTGAGGGAGAACTTCTCCCATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CGCCGAGCCCAGACATGAGCGCTGCGTCCCTCTGCGCACTGGAGCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110364 CGCCGAGCCCAGACATGAGCGCTGCGTCCCTCTGCGCACTGGAGCAGCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ATGATGGCCCAGGCCCAGGAATGTGTGTTTGAGGGCCTCTCACCACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110414 ATGATGGCCCAGGCCCAGGAATGTGTGTTTGAGGGCCTCTCACCACCTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTCCATGGCCCCCCAAGACTGCCTGGCCCAGCTGCGCCTGGCGCAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110464 CTCCATGGCCCCCCAAGACTGCCTGGCCCAGCTGCGCCTGGCGCAGGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCGCCCAG         GTGGCAGCCGAGTACAGGCTAGTGCACCGGACC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 110514 CCGCCCAGGTG...CAGGTGGCAGCCGAGTACAGGCTAGTGCACCGGACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 ATGGCCCAGCCACCCGTCCACGACTACGTGCCTGTCTCCTGGACTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110875 ATGGCCCAGCCACCCGTCCACGACTACGTGCCTGTCTCCTGGACTGCCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGTGCATGTCAAGGCCGAGTACTTCCGCTCCCTGGCCCACTACCACGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110925 GGTGCATGTCAAGGCCGAGTACTTCCGCTCCCTGGCCCACTACCACGTAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CCATGGCCCTCTGCGACGGCTCCC         CAGCGACCGAGGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 110975 CCATGGCCCTCTGCGACGGCTCCCGTG...CAGCAGCGACCGAGGGAGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CTCCCCACGCACGAGCAGGTCTTCCTGCAGCCCCCCACCTCCTCTAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111092 CTCCCCACGCACGAGCAGGTCTTCCTGCAGCCCCCCACCTCCTCTAAGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CCGAGGCCCTGTGCTGCCGCAGGAGCTGGAGGAGCGCAGGCAGCTTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 111142 CCGAGGCCCTGTGCTGCCGCAGGAGCTGGAGGAGCGCAGGCAGCTTGGTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1217       GCAAGGCACACCTGAAGCGTGCCATCCTGGGGCAGGAGGAGGCG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111192 ...CAGGCAAGGCACACCTGAAGCGTGCCATCCTGGGGCAGGAGGAGGCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CTGCGGCTGCACGCCCTGTGCCGCGTCCTGCGCGAGGTGGACCTGCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111646 CTGCGGCTGCACGCCCTGTGCCGCGTCCTGCGCGAGGTGGACCTGCTTCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GGCTGTGATCTCCCAGACGCTGCAGCGCTCACTGGCCAAGTATGCGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111696 GGCTGTGATCTCCCAGACGCTGCAGCGCTCACTGGCCAAGTATGCGGAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TCGACCGTGAGGATGACTTCTGTGAGGCTGCCGAGGCCCCGGACATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111746 TCGACCGTGAGGATGACTTCTGTGAGGCTGCCGAGGCCCCGGACATCCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 C         CTAAGACCCACCAGAAGCCAGAGGCCAGGATGCCACGCCT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111796 CGTG...CAGCTAAGACCCACCAGAAGCCAGAGGCCAGGATGCCACGCCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GTCCCAGGGGAAGGGGCCTGACATCTTCCATCGGCTG         GGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 112321 GTCCCAGGGGAAGGGGCCTGACATCTTCCATCGGCTGGTG...CAGGGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CCCTGTCTGTGTTCTCAGCCAAGAACCGGTGGCGGCTGGTGGGGCCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112589 CCCTGTCTGTGTTCTCAGCCAAGAACCGGTGGCGGCTGGTGGGGCCCGTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CACCTGACCCGAGGAGAGGGCGGCTTTGGCCTCACGCTTCGGGGAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112639 CACCTGACCCGAGGAGAGGGCGGCTTTGGCCTCACGCTTCGGGGAGACTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GCCTGTCCTCATCGCTGCCGTCATTCCAGGGAGCCAGGCCGCG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 112689 GCCTGTCCTCATCGCTGCCGTCATTCCAGGGAGCCAGGCCGCGGTA...C

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1636   GCGGCTGGCCTGAAGGAGGGCGACTACATTGTGTCAGTGAATGGGCAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112818 AGGCGGCTGGCCTGAAGGAGGGCGACTACATTGTGTCAGTGAATGGGCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 CCATGCAGGTGGTGGAGACACGCGGAGGTGGTGACGGAGCTGAAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112868 CCATGCAGGTGGTGGAGACACGCGGAGGTGGTGACGGAGCTGAAGGCTGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GGGAGAGGCGGGCGCCAGCCTGCAGGTGGTGTCGCTGCTGCCCAGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112918 GGGAGAGGCGGGCGCCAGCCTGCAGGTGGTGTCGCTGCTGCCCAGCTCTA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GACTGCCCAGCTTG         GGGGACCGCCGGCCCGTCCTGCTGGGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 112968 GACTGCCCAGCTTGGTG...CAGGGGGACCGCCGGCCCGTCCTGCTGGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CCCAGGGGGCTTCTAAGGAGCCAGAGGGAGCATGGTTGCAAGACCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113476 CCCAGGGGGCTTCTAAGGAGCCAGAGGGAGCATGGTTGCAAGACCCCGGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 ATCCACGTGGGCCAGTCCCCGGCCCCTCCTCAACTGGAGCCGAAAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113526 ATCCACGTGGGCCAGTCCCCGGCCCCTCCTCAACTGGAGCCGAAAGGCCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 AGCAGGGCAAGACTGGAGGCTGCCCCCAGCCCTGTGCCCCAGTGAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113576 AGCAGGGCAAGACTGGAGGCTGCCCCCAGCCCTGTGCCCCAGTGAAGCCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .
   1975 GCTCCGCCCTCATCCTTGAAGCACCCAGGGTGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113626 GCTCCGCCCTCATCCTTGAAGCACCCAGGGTGGCCG