seq1 = pF1KB6269.tfa, 2082 bp
seq2 = pF1KB6269/gi568815591f_26052499.tfa (gi568815591f:26052499_26285780), 233282 bp

>pF1KB6269 2082
>gi568815591f:26052499_26285780 (Chr7)

1-570  (100001-100570)   100% ->
571-750  (125445-125624)   100% ->
751-834  (131203-131286)   100% ->
835-2082  (132035-133282)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCACCTGAAGCGGTGGTGGTCGGCCGGCGGCGGCCTCCTGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGCACCTGAAGCGGTGGTGGTCGGCCGGCGGCGGCCTCCTGCACCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCCTCCTGCTGAGCTTGGCGGGGCTCCGCGTAGACCTAGATCTTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCCTCCTGCTGAGCTTGGCGGGGCTCCGCGTAGACCTAGATCTTTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTGCTGCCGCCGCCCACCCTGCTGCAGGACGAGCTGCTGTTCCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTGCTGCCGCCGCCCACCCTGCTGCAGGACGAGCTGCTGTTCCTGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCCGGCCAGCTCCGCCTACGCGCTCAGCCCCTTCTCGGCCTCGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCCCGGCCAGCTCCGCCTACGCGCTCAGCCCCTTCTCGGCCTCGGGAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTGGGGGCGCGCGGGCCACTTGCACCCCAAGGGCCGGGAGCTGGACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTGGGGGCGCGCGGGCCACTTGCACCCCAAGGGCCGGGAGCTGGACCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGCGCCGCCCGAGGGCCAGCTGCTCCGGGAGGTGCGCGCGCTCGGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGCGCCGCCCGAGGGCCAGCTGCTCCGGGAGGTGCGCGCGCTCGGGGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCTTCGTCCCTCGCACCAGCGTGGATGCATGGCTGGTGCACAGCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCTTCGTCCCTCGCACCAGCGTGGATGCATGGCTGGTGCACAGCGTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCCGGGAGCGCGGACGAGGCCCACGGGCTGCTCGGCGCCGCCGCCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGCCGGGAGCGCGGACGAGGCCCACGGGCTGCTCGGCGCCGCCGCCGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGTCCACCGGAGGAGCCGGCGCCAGCGTGGACGGCGGCAGCCAGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGTCCACCGGAGGAGCCGGCGCCAGCGTGGACGGCGGCAGCCAGGCTGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAGGGGGGCGGCGGGGACCCCCGAGCGGCTCGGAGTGGCCCCTTGGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAGGGGGGCGGCGGGGACCCCCGAGCGGCTCGGAGTGGCCCCTTGGACGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGGGGAAGAGGAGAAGGCACCCGCGGAACCGACGGCTCAGGTGCCGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGGGGAAGAGGAGAAGGCACCCGCGGAACCGACGGCTCAGGTGCCGGACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGGCGGATGTGCGAGCGAG         GAGAATGGGGTACTAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100551 CTGGCGGATGTGCGAGCGAGGTA...TAGGAGAATGGGGTACTAAGAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AAGCACGAAGCTGTGGATCATAGTTCCCAGCATGAGGAAAATGAAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125466 AAGCACGAAGCTGTGGATCATAGTTCCCAGCATGAGGAAAATGAAGAAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGTGTCAGCCCAGAAGGAGAACTCACTTCAGCAGAATGATGATGATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125516 GGTGTCAGCCCAGAAGGAGAACTCACTTCAGCAGAATGATGATGATGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACAAAATAGCAGAGAAACCTGACTGGGAGGCAGAAAAGACCACTGAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125566 ACAAAATAGCAGAGAAACCTGACTGGGAGGCAGAAAAGACCACTGAATCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AGAAATGAG         AGACATCTGAATGGGACAGATACTTCTTTCTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 125616 AGAAATGAGGTA...CAGAGACATCTGAATGGGACAGATACTTCTTTCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TCTGGAAGACTTATTCCAGTTGCTTTCATCACAGCCTGAAAATTCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131235 TCTGGAAGACTTATTCCAGTTGCTTTCATCACAGCCTGAAAATTCACTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AG         GGCATCTCATTGGGAGATATTCCTCTTCCAGGCAGTATC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131285 AGGTA...CAGGGCATCTCATTGGGAGATATTCCTCTTCCAGGCAGTATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AGTGATGGCATGAATTCTTCAGCACATTATCATGTAAACTTCAGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132074 AGTGATGGCATGAATTCTTCAGCACATTATCATGTAAACTTCAGCCAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TATAAGTCAGGATGTGAATCTTCATGAGGCCATCTTGCTTTGTCCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132124 TATAAGTCAGGATGTGAATCTTCATGAGGCCATCTTGCTTTGTCCCAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 ATACATTTAGAAGAGATCCAACAGCAAGGACTTCACAGTCACAAGAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132174 ATACATTTAGAAGAGATCCAACAGCAAGGACTTCACAGTCACAAGAACCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TTTCTGCAGTTAAATTCTCATACCACCAATCCTGAGCAAACCCTTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132224 TTTCTGCAGTTAAATTCTCATACCACCAATCCTGAGCAAACCCTTCCTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 AACTAATTTGACAGGATTTCTTTCACCGGTTGACAATCATATGAGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132274 AACTAATTTGACAGGATTTCTTTCACCGGTTGACAATCATATGAGGAATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TAACAAGCCAAGACCTACTGTATGACCTTGACATAAATATATTTGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132324 TAACAAGCCAAGACCTACTGTATGACCTTGACATAAATATATTTGATGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 ATAAACTTAATGTCATTGGCCACAGAAGACAACTTTGATCCAATCGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132374 ATAAACTTAATGTCATTGGCCACAGAAGACAACTTTGATCCAATCGATGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TTCTCAGCTTTTTGATGAACCAGATTCTGATTCTGGCCTTTCTTTAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132424 TTCTCAGCTTTTTGATGAACCAGATTCTGATTCTGGCCTTTCTTTAGATT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 CAAGTCACAATAATACCTCTGTCATCAAGTCTAATTCCTCTCACTCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132474 CAAGTCACAATAATACCTCTGTCATCAAGTCTAATTCCTCTCACTCTGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 TGTGATGAAGGTGCTATAGGTTATTGCACTGACCATGAATCTAGTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132524 TGTGATGAAGGTGCTATAGGTTATTGCACTGACCATGAATCTAGTTCCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 TCATGACTTAGAAGGTGCTGTAGGTGGCTACTACCCAGAACCCAGTAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132574 TCATGACTTAGAAGGTGCTGTAGGTGGCTACTACCCAGAACCCAGTAAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TTTGTCACTTGGATCAAAGTGATTCTGATTTCCATGGAGATCTTACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132624 TTTGTCACTTGGATCAAAGTGATTCTGATTTCCATGGAGATCTTACATTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 CAACACGTATTTCATAACCACACTTACCACTTACAGCCAACTGCACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132674 CAACACGTATTTCATAACCACACTTACCACTTACAGCCAACTGCACCAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 ATCTACTTCTGAACCTTTTCCGTGGCCTGGGAAGTCACAGAAGATAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132724 ATCTACTTCTGAACCTTTTCCGTGGCCTGGGAAGTCACAGAAGATAAGGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 GTAGATACCTTGAAGACACAGATAGAAACTTGAGCCGTGATGAACAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132774 GTAGATACCTTGAAGACACAGATAGAAACTTGAGCCGTGATGAACAGCGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 GCTAAAGCTTTGCATATCCCTTTTTCTGTAGATGAAATTGTCGGCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132824 GCTAAAGCTTTGCATATCCCTTTTTCTGTAGATGAAATTGTCGGCATGCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 TGTTGATTCTTTCAATAGCATGTTAAGTAGATATTATCTGACAGACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132874 TGTTGATTCTTTCAATAGCATGTTAAGTAGATATTATCTGACAGACCTAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 AAGTCTCACTTATCCGTGACATCAGACGAAGAGGGAAAAATAAAGTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132924 AAGTCTCACTTATCCGTGACATCAGACGAAGAGGGAAAAATAAAGTTGCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 GCGCAGAACTGTCGTAAACGCAAATTGGACATAATTTTGAATTTAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132974 GCGCAGAACTGTCGTAAACGCAAATTGGACATAATTTTGAATTTAGAAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 TGATGTATGTAACTTGCAAGCAAAGAAGGAAACTCTTAAGAGAGAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133024 TGATGTATGTAACTTGCAAGCAAAGAAGGAAACTCTTAAGAGAGAGCAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 CACAATGTAACAAAGCTATTAACATAATGAAACAGAAACTGCATGACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133074 CACAATGTAACAAAGCTATTAACATAATGAAACAGAAACTGCATGACCTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1924 TATCATGATATTTTTAGTAGATTAAGAGATGACCAAGGTAGGCCAGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133124 TATCATGATATTTTTAGTAGATTAAGAGATGACCAAGGTAGGCCAGTCAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1974 TCCCAACCACTATGCTCTCCAGTGTACCCATGATGGAAGTATCTTGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133174 TCCCAACCACTATGCTCTCCAGTGTACCCATGATGGAAGTATCTTGATAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2024 TACCCAAAGAACTGGTGGCCTCAGGCCACAAAAAGGAAACCCAAAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133224 TACCCAAAGAACTGGTGGCCTCAGGCCACAAAAAGGAAACCCAAAAGGGA

   2100     .
   2074 AAGAGAAAG
        |||||||||
 133274 AAGAGAAAG