seq1 = pF1KB6265.tfa, 2070 bp
seq2 = pF1KB6265/gi568815575r_84221892.tfa (gi568815575r:84221892_84575397), 353506 bp

>pF1KB6265 2070
>gi568815575r:84221892_84575397 (ChrX)

(complement)

1-147  (100001-100147)   100% ->
148-1251  (105823-106926)   100% ->
1252-1305  (134813-134866)   100% ->
1306-1452  (213786-213932)   100% ->
1453-1660  (230941-231148)   100% ->
1661-1740  (238518-238597)   100% ->
1741-1824  (241556-241639)   100% ->
1825-1947  (249098-249220)   100% ->
1948-2070  (253384-253506)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATCTACGTTCTGTATTTACTGTAGAACAACAAAGGATTTTACAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATCTACGTTCTGTATTTACTGTAGAACAACAAAGGATTTTACAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTATTATGAAAATGGAATGACAAATCAAAGTAAAAATTGCTTTCAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTATTATGAAAATGGAATGACAAATCAAAGTAAAAATTGCTTTCAGCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TATTACAGTGTGCACAGGAGACTAAGCTGGACTTCAGTGTAGTCAGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100101 TATTACAGTGTGCACAGGAGACTAAGCTGGACTTCAGTGTAGTCAGGGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    148       ACGTGGGTTGGCAATAAGAGAAGAAAGATGAGTAGTAAGAACTC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ...CAGACGTGGGTTGGCAATAAGAGAAGAAAGATGAGTAGTAAGAACTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAATCTGGAACAGCAACAACAGGAACCTCTTTGTCAGCTCCAGACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105867 TGAATCTGGAACAGCAACAACAGGAACCTCTTTGTCAGCTCCAGACATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGTCAGAAATGTGGTTAATATTGCTCGACCCTCAAGCCAGCAGTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105917 CAGTCAGAAATGTGGTTAATATTGCTCGACCCTCAAGCCAGCAGTCTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGGACATCTGCCAATAATGATGTCATTGTAACTGGTATATACAGTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105967 TGGACATCTGCCAATAATGATGTCATTGTAACTGGTATATACAGTCCAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGTTCATCAAGTAGGCAAGGAACAAACAAACATACAGACACACAAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106017 CAGTTCATCAAGTAGGCAAGGAACAAACAAACATACAGACACACAAATTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CAGAAGCACATAAAATCCCTATTCAGAAAACAGCCACTAAAAATGATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106067 CAGAAGCACATAAAATCCCTATTCAGAAAACAGCCACTAAAAATGATACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAGTTTCAGTTACACATTCCTGTCCAAAGACAAGTAGCACACTGTAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106117 GAGTTTCAGTTACACATTCCTGTCCAAAGACAAGTAGCACACTGTAAAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGCTTCCCTACTCCTAGGTGAAAAAACAATTATTTTGTCAAGACAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106167 TGCTTCCCTACTCCTAGGTGAAAAAACAATTATTTTGTCAAGACAGACAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GTGTGCTAAATGCTGGAAACTCAGTATTCAATCACGCAAAGAAAAACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106217 GTGTGCTAAATGCTGGAAACTCAGTATTCAATCACGCAAAGAAAAACTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGAAACTCTTCAGTACAAGCTTCTGAAATGACAGTACCTCAAAAGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106267 GGAAACTCTTCAGTACAAGCTTCTGAAATGACAGTACCTCAAAAGCCTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGTGTGCCACCGACCTTGTAAAATTGAACCAGTTGGGATTCAAAGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106317 TGTGTGCCACCGACCTTGTAAAATTGAACCAGTTGGGATTCAAAGGTCAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ATAAGCCTGAACACACAGGCCCAGCATTACATAACTTATGTGGGCAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106367 ATAAGCCTGAACACACAGGCCCAGCATTACATAACTTATGTGGGCAAAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCAACTATTAGAGACCCTTACTGTAGAACACAAAACTTGGAAATCCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106417 CCAACTATTAGAGACCCTTACTGTAGAACACAAAACTTGGAAATCCGTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AGTGTTTTCATTGGCAGTTAGCGATTACCCCCAGAGAATTCTGGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106467 AGTGTTTTCATTGGCAGTTAGCGATTACCCCCAGAGAATTCTGGGAGGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ATGCCCCACAGAAGCCTAGCTCAGCAGAAGGAAATTGTTTGTCCATTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106517 ATGCCCCACAGAAGCCTAGCTCAGCAGAAGGAAATTGTTTGTCCATTGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ATGGAGACTGGAGATGCTGAGGATGAATATGCCAGAGAGGAAGAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106567 ATGGAGACTGGAGATGCTGAGGATGAATATGCCAGAGAGGAAGAGCTGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 ATCGATGAGAGCACAGATACCAAGCTATTCGAGATTTTATGAAAGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106617 ATCGATGAGAGCACAGATACCAAGCTATTCGAGATTTTATGAAAGTGGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GTTCCCTTCGAGCTGAGAACCAAAGTACAACCTTGCCCGGACCAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106667 GTTCCCTTCGAGCTGAGAACCAAAGTACAACCTTGCCCGGACCAGGAAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AATATGCCAAATTCACAAATGGTGAATATTAGAGATATGTCAGACAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106717 AATATGCCAAATTCACAAATGGTGAATATTAGAGATATGTCAGACAATGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 ACTGTATCAAAACAGAAACTACCATTTGACACCACGGACCTCATTACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106767 ACTGTATCAAAACAGAAACTACCATTTGACACCACGGACCTCATTACATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CAGCATCTAGTACAATGTACAGTAATACCAATCCATTACGGAGTAATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106817 CAGCATCTAGTACAATGTACAGTAATACCAATCCATTACGGAGTAATTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 TCTCCTCATTTTGCATCATCAAACCAATTGAGATTATCACAAAACCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106867 TCTCCTCATTTTGCATCATCAAACCAATTGAGATTATCACAAAACCAAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CAATTACCAG         ATTTCAGGAAACCTTACTGTGCCTTGGATTA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106917 CAATTACCAGGTA...CAGATTTCAGGAAACCTTACTGTGCCTTGGATTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 CAGGGTGTTCTAGAAAAAGAGCA         CTACAGGACCGCACTCAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 134844 CAGGGTGTTCTAGAAAAAGAGCAGTA...CAGCTACAGGACCGCACTCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 TTCAGTGACCGAGACTTAGCCACCCTTAAGAAGTATTGGGACAATGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213804 TTCAGTGACCGAGACTTAGCCACCCTTAAGAAGTATTGGGACAATGGCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GACCAGCCTGGGCTCTGTTTGTAGAGAGAAAATTGAAGCTGTGGCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213854 GACCAGCCTGGGCTCTGTTTGTAGAGAGAAAATTGAAGCTGTGGCAACTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 AATTAAATGTTGACTGTGAAATAGTTCGG         ACTTGGATTGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 213904 AATTAAATGTTGACTGTGAAATAGTTCGGGTA...AAGACTTGGATTGGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 AATCGAAGAAGGAAATATCGTTTAATGGGGATTGAAGTTCCACCTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 230953 AATCGAAGAAGGAAATATCGTTTAATGGGGATTGAAGTTCCACCTCCAAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 AGGAGGCCCTGCTGATTTCTCTGAGCAGCCTGAGTCTGGTTCTTTATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231003 AGGAGGCCCTGCTGATTTCTCTGAGCAGCCTGAGTCTGGTTCTTTATCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 CACTCACACCAGGAGAGGAAGCTGGGCCTGAAGTAGGAGAGGATAATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231053 CACTCACACCAGGAGAGGAAGCTGGGCCTGAAGTAGGAGAGGATAATGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 AGAAATGATGAAGTATCCATCTGTTTGTCTGAAGGAAGCTCTCAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 231103 AGAAATGATGAAGTATCCATCTGTTTGTCTGAAGGAAGCTCTCAAGGTA.

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661      AAGAGCCCAATGAAGTTGTTCCGAATGATGCAAGGGCTCATAAGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231153 ..TAGAAGAGCCCAATGAAGTTGTTCCGAATGATGCAAGGGCTCATAAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 AAGAGGACCACCATGCAGTAACCACAGATAATGTG         AAAATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 238563 AAGAGGACCACCATGCAGTAACCACAGATAATGTGGTA...CAGAAAATA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 GAAATTATTGATGATGAAGAAAGTGACATGATAAGTAATTCTGAAGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 241562 GAAATTATTGATGATGAAGAAAGTGACATGATAAGTAATTCTGAAGTAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 ACAAGTAAACTCTTTCTTGGATTATAAG         AATGAAGAAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 241612 ACAAGTAAACTCTTTCTTGGATTATAAGGTA...CAGAATGAAGAAGTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 AATTCATTGAAAATGAGCTCGAGATTCAAAAGCAAAAATACTTTAAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 249111 AATTCATTGAAAATGAGCTCGAGATTCAAAAGCAAAAATACTTTAAACTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 CAGACTTTTGTTAGAAGCTTGATATTAGCAATGAAAGCTGATGATAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 249161 CAGACTTTTGTTAGAAGCTTGATATTAGCAATGAAAGCTGATGATAAGGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 ACAACAGCAG         GCACTGCTGTCAGATTTACCTCCTGAATTAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 249211 ACAACAGCAGGTA...CAGGCACTGCTGTCAGATTTACCTCCTGAATTAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 AGGAAATGGATTTCAATCATGCCTCACTGGAGCCTGATGATACCTCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253415 AGGAAATGGATTTCAATCATGCCTCACTGGAGCCTGATGATACCTCATTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 AGTGTATCTTCTTTGTCAGAGAAAAATGTCTCAGAAAGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 253465 AGTGTATCTTCTTTGTCAGAGAAAAATGTCTCAGAAAGTTTG