seq1 = pF1KB6255.tfa, 2286 bp
seq2 = pF1KB6255/gi568815597r_113598262.tfa (gi568815597r:113598262_113858703), 260442 bp

>pF1KB6255 2286
>gi568815597r:113598262_113858703 (Chr1)

(complement)

1-45  (100001-100045)   100% ->
46-102  (100949-101005)   100% ->
103-172  (119905-119974)   100% ->
173-331  (120436-120594)   99% ->
332-488  (132130-132286)   100% ->
489-623  (133811-133945)   100% ->
624-783  (145266-145425)   100% ->
784-957  (146591-146764)   100% ->
958-1047  (146869-146958)   100% ->
1048-1269  (148229-148450)   100% ->
1270-1398  (151982-152110)   100% ->
1399-1671  (152542-152814)   100% ->
1672-1803  (153907-154038)   100% ->
1804-1890  (154537-154623)   100% ->
1891-2046  (157755-157910)   100% ->
2047-2142  (158905-159000)   100% ->
2143-2268  (160317-160442)   100% ->
2269-2286  (160979-160996)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCAAATGAGAGAGATGCTATATCGTGGTACCAAAAGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100001 ATGGCCTCAAATGAGAGAGATGCTATATCGTGGTACCAAAAGAAGGTA..

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     46     ATTGGAGCCTACGATCAGCAGATATGGGAAAAGTCAATCGAACAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 .CAGATTGGAGCCTACGATCAGCAGATATGGGAAAAGTCAATCGAACAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTCAGATTAAG         GGTTTGAAAAACAAACCGAAAAAGATGGGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100995 CTCAGATTAAGGTA...TAGGGTTTGAAAAACAAACCGAAAAAGATGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CACATAAAGCCAGACTTGATTGACGTTGACTTAATCAGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 119935 CACATAAAGCCAGACTTGATTGACGTTGACTTAATCAGAGGTT...AAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 GTCAACATTTGCCAAAGCAAAACCTGAAATTCCATGGACATCTCTGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120437 GTCAACATTTGCCAAAGCAAAACCTGAAATTCCATGGACATCTCTGACTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GGAAGGGGCTTGTTCGAGTTGTATTTTTTCCATTGTTCAGCAATTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120487 GGAAGGGGCTTGTTCGAGTTGTATTTTTTCCATTGTTCAGCAATTGGTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATTCAGGTCACCTCTTTAAGAATCTTTGTTTGGCTGTTACTACTTTATTT
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120537 ATTCAGGTTACCTCTTTAAGAATCTTTGTTTGGCTGTTACTACTTTATTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CATGCAAG         TTATAGCAATTGTCTTATATTTGATGATGCCTA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 120587 CATGCAAGGTA...CAGTTATAGCAATTGTCTTATATTTGATGATGCCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TTGTGAACATAAGTGAAGTACTTGGACCCTTGTGCCTTATGCTACTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132163 TTGTGAACATAAGTGAAGTACTTGGACCCTTGTGCCTTATGCTACTCATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGAACTGTCCACTGTCAAATTGTGTCTACTCAGATAACAAGACCATCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132213 GGAACTGTCCACTGTCAAATTGTGTCTACTCAGATAACAAGACCATCAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAACAATGGAAATCGAAGAAGAAG         AAAATTACGAAAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 132263 AAACAATGGAAATCGAAGAAGAAGGTA...TAGAAAATTACGAAAAACTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TAAATGGTGATGGGAGCCGAGAAAATGGAAATAACTCCTCTGATAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133828 TAAATGGTGATGGGAGCCGAGAAAATGGAAATAACTCCTCTGATAAAGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGAGGAATAGAAACTTTGGAATCTGTACCCATTATTGGTGGTTTTTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133878 AGAGGAATAGAAACTTTGGAATCTGTACCCATTATTGGTGGTTTTTGGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GACTATCTTTGGCAACAG         GATTAAAAGAGTAAAATTAATAT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 133928 GACTATCTTTGGCAACAGGTG...TAGGATTAAAAGAGTAAAATTAATAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CTAACAAAGGGACTGAAACTGACAATGACCCAAGTTGTGTCCATCCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145289 CTAACAAAGGGACTGAAACTGACAATGACCCAAGTTGTGTCCATCCTATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATTAAGAGGAGACAATGTCGACCAGAGATTAGAATGTGGCAAACAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145339 ATTAAGAGGAGACAATGTCGACCAGAGATTAGAATGTGGCAAACAAGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GAAAGCAAAATTTTCAGATGGAGAAAAGTGCCGTAGG         GAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 145389 GAAAGCAAAATTTTCAGATGGAGAAAAGTGCCGTAGGGTA...TAGGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CTTTTAGGCGTTTGGGTAATGGGGTGTCTGATGACCTGTCAAGTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146595 CTTTTAGGCGTTTGGGTAATGGGGTGTCTGATGACCTGTCAAGTGAAGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GATGGTGAAGCACGGACACAGATGATATTATTGCGTAGGAGTGTGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146645 GATGGTGAAGCACGGACACAGATGATATTATTGCGTAGGAGTGTGGAAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGCCTCAAGTGACAATGGTTGTGAAGTTAAGAATAGAAAATCAATACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146695 GGCCTCAAGTGACAATGGTTGTGAAGTTAAGAATAGAAAATCAATACTTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CAAGGCACCTAAACTCTCAG         GTAAAGAAAACCACTACAAGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 146745 CAAGGCACCTAAACTCTCAGGTA...CAGGTAAAGAAAACCACTACAAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TGGTGTCATATTGTGCGGGATTCAGATAGTCTGGCTGAATCAGAATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146890 TGGTGTCATATTGTGCGGGATTCAGATAGTCTGGCTGAATCAGAATTTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 ATCAGCAGCCTTCAGCCAG         GGCTCTAGATCGGGTGTGAGTG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 146940 ATCAGCAGCCTTCAGCCAGGTA...AAGGGCTCTAGATCGGGTGTGAGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GTGGCTCTCGAAGCCTCAACATGTCAAGAAGAGACTCAGAAAGCACCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148251 GTGGCTCTCGAAGCCTCAACATGTCAAGAAGAGACTCAGAAAGCACCCGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CATGACTCGGAGACTGAGGACATGTTATGGGACGACCTGCTACATGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148301 CATGACTCGGAGACTGAGGACATGTTATGGGACGACCTGCTACATGGCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 AGAGTGCCGGTCATCTGTCACCAGTGACAGTGAGGGGGCCCATGTGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148351 AGAGTGCCGGTCATCTGTCACCAGTGACAGTGAGGGGGCCCATGTGAATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CCCTTCACTCAGGGACCAAACGTGACCCCAAAGAGGATGTTTTTCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148401 CCCTTCACTCAGGGACCAAACGTGACCCCAAAGAGGATGTTTTTCAGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270          AATCATTTATTCTGGCTTCAGAATTCAAGTCCTTCCTCTGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148451 GTC...CAGAATCATTTATTCTGGCTTCAGAATTCAAGTCCTTCCTCTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TCGAGTTAGTGCAATAATCTGGGAGGGGAATGAGTGCAAAAAGATGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152023 TCGAGTTAGTGCAATAATCTGGGAGGGGAATGAGTGCAAAAAGATGGATA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TGTCTGTGTTGGAAATAAGTGGCATCATCATGAGCAGG         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 152073 TGTCTGTGTTGGAAATAAGTGGCATCATCATGAGCAGGGTA...CAGGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 AATGCCTATCAGCAAGGAGTAGGTTATCAGATGCTGGGAAATGTTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152545 AATGCCTATCAGCAAGGAGTAGGTTATCAGATGCTGGGAAATGTTGTCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 TATTGGATTAGCATTTTTTCCATTCTTACATCGACTTTTCCGTGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152595 TATTGGATTAGCATTTTTTCCATTCTTACATCGACTTTTCCGTGAGAAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GCCTTGACCAACTAAAGTCCATTTCAGCTGAGGAGATCTTGACTCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152645 GCCTTGACCAACTAAAGTCCATTTCAGCTGAGGAGATCTTGACTCTCTTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 TGTGGGGCACCACCTGTTACACCTATTATTGTTTTGTCGATAATTAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152695 TGTGGGGCACCACCTGTTACACCTATTATTGTTTTGTCGATAATTAATTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 TTTTGAAAGATTGTGTCTTACTTGGATGTTTTTTTTCATGATGTGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152745 TTTTGAAAGATTGTGTCTTACTTGGATGTTTTTTTTCATGATGTGTGTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CAGAGAGAACATATAAACAG         AGATTTTTATTTGCAAAACTC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 152795 CAGAGAGAACATATAAACAGGTC...TAGAGATTTTTATTTGCAAAACTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 TTCAGCCATATTACTTCTGCCAGGAAAGCTAGGAAATATGAAATACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153928 TTCAGCCATATTACTTCTGCCAGGAAAGCTAGGAAATATGAAATACCTCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 TTTCAGACTTAAGAAGGTGGAGAATATTAAAATATGGTTATCACTGCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153978 TTTCAGACTTAAGAAGGTGGAGAATATTAAAATATGGTTATCACTGCGTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 CCTATCTAAAG         AGACGGGGGCCACAGCGTTCAGTTGATGTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 154028 CCTATCTAAAGGTG...CAGAGACGGGGGCCACAGCGTTCAGTTGATGTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GTTGTATCCTCGGTTTTCCTACTGACACTTTCGATTGCTTTCATTTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154567 GTTGTATCCTCGGTTTTCCTACTGACACTTTCGATTGCTTTCATTTGTTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 TGCTCAG         GTTCTCCAAGGACATAAAACTTTCCTGAATGATG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154617 TGCTCAGGTA...TAGGTTCTCCAAGGACATAAAACTTTCCTGAATGATG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 CTTATAACTGGGAGTTTTTGATCTGGGAAACAGCTTTACTACTTTTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157789 CTTATAACTGGGAGTTTTTGATCTGGGAAACAGCTTTACTACTTTTTTTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 TTGCGTCTGGCCTCACTGGGGTCTGAAACCAATAAGAAATACAGCAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157839 TTGCGTCTGGCCTCACTGGGGTCTGAAACCAATAAGAAATACAGCAATGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 TTCAATATTACTTACAGAACAG         ATTAATTTATATCTTAAGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 157889 TTCAATATTACTTACAGAACAGGTA...TAGATTAATTTATATCTTAAGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 TGGAAAAAAAGCCAAATAAGAAAGAACAGCTTACTCTAGTAAACAATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158924 TGGAAAAAAAGCCAAATAAGAAAGAACAGCTTACTCTAGTAAACAATGTA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 TTAAAGCTGTCCACCAAGTTGTTGAAA         GAGCTGGACACACC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 158974 TTAAAGCTGTCCACCAAGTTGTTGAAAGTA...TAGGAGCTGGACACACC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 ATTTAGACTCTATGGACTGACAATGAATCCCTTAATCTACAATATCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160331 ATTTAGACTCTATGGACTGACAATGAATCCCTTAATCTACAATATCACAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 GAGTAGTTATCCTTTCTGCTGTCTCAGGTGTTATAAGTGATCTTCTAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160381 GAGTAGTTATCCTTTCTGCTGTCTCAGGTGTTATAAGTGATCTTCTAGGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .
   2257 TTTAATATAAGA         CTGTGGAAAATTAAATCA
        ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 160431 TTTAATATAAGAGTA...TAGCTGTGGAAAATTAAATCA