seq1 = pF1KB6251.tfa, 2280 bp
seq2 = pF1KB6251/gi568815591f_87064942.tfa (gi568815591f:87064942_87295137), 230196 bp

>pF1KB6251 2280
>gi568815591f:87064942_87295137 (Chr7)

1-109  (100001-100109)   100% ->
110-232  (101542-101664)   100% ->
233-327  (106054-106148)   98% ->
328-442  (108594-108708)   100% ->
443-519  (109652-109728)   100% ->
520-677  (114604-114761)   100% ->
678-710  (116368-116400)   100% ->
711-820  (117287-117396)   100% ->
821-1049  (119456-119684)   99% ->
1050-1201  (120888-121039)   100% ->
1202-1411  (123151-123360)   99% ->
1412-1494  (126004-126086)   100% ->
1495-1650  (128257-128412)   100% ->
1651-2028  (128784-129161)   99% ->
2029-2173  (129743-129887)   100% ->
2174-2280  (130090-130196)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCACAGTGGAAGAGGATTCTGACACAGTAACAGTAGAAACTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCACAGTGGAAGAGGATTCTGACACAGTAACAGTAGAAACTGTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCTGTGACTTTGACTCAGGACACAGAAGGGAATCTCATTCTTCACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCTGTGACTTTGACTCAGGACACAGAAGGGAATCTCATTCTTCACTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCAGAATG         AAGCGGATGAAATAGACTCAGAAGATAGTATT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCAGAATGGTA...TAGAAGCGGATGAAATAGACTCAGAAGATAGTATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAACCTCCACATAAAAGGCTTTGTTTGTCCTCTGAGGATGATCAGAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101574 GAACCTCCACATAAAAGGCTTTGTTTGTCCTCTGAGGATGATCAGAGTAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGATGATTCTACTCCTTGCATATCAGTTGTTGCACTTCCAC         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 101624 TGATGATTCTACTCCTTGCATATCAGTTGTTGCACTTCCACGTA...AAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTTCAGAAAATGATCAGAGCTTTGAAGTGACCATGACTGCGACCACAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 106054 TTTCAGAAAATGATCAGAGCTTTGAAGTGACCATGACTGCAACCACAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTAGCAGATGATGAGGTTACTGAGGGGACTGTGACACAGATACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 106104 GTAGCAGATGATGAGGTTACTGAGGGGACTGTGACACAGATACAGGTA..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    328     ATTTTGCAGAATGAGCAACTAGATGAAATATCTCCCTTGGGTAACG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106154 .AAGATTTTGCAGAATGAGCAACTAGATGAAATATCTCCCTTGGGTAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGAAGTTTCAGCAGTTAGCCAAGCATGGTTTACAACTAAAGAAGATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108640 AGGAAGTTTCAGCAGTTAGCCAAGCATGGTTTACAACTAAAGAAGATAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GATTCTCTGACTAATAAAG         GACATAAATGGAAGCAGGGGAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 108690 GATTCTCTGACTAATAAAGGTA...AAGGACATAAATGGAAGCAGGGGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTGGTCCAAGGAAGAAATTGATATTTTGATGAACAATATTGAACGCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109674 GTGGTCCAAGGAAGAAATTGATATTTTGATGAACAATATTGAACGCTATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTAAG         GCACGCGGAATAAAAGATGCTACAGAAATCATCTTT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109724 TTAAGGTA...TAGGCACGCGGAATAAAAGATGCTACAGAAATCATCTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAGATGTCAAAAGACGAAAGAAAAGATTTCTACAGGACTATAGCATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114640 GAGATGTCAAAAGACGAAAGAAAAGATTTCTACAGGACTATAGCATGGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCTGAACCGGCCTTTGTTTGCAGTTTATAGAAGAGTGCTTCGCATGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114690 TCTGAACCGGCCTTTGTTTGCAGTTTATAGAAGAGTGCTTCGCATGTATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATGACAGAAACCATGTGGGAAA         ATATACACCTGAAGAAATT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 114740 ATGACAGAAACCATGTGGGAAAGTA...TAGATATACACCTGAAGAAATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAGAAGCTCAAGGA         GCTCCGGATAAAGCATGGCAATGACTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 116387 GAGAAGCTCAAGGAGTA...TAGGCTCCGGATAAAGCATGGCAATGACTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GGCAACAATAGGGGCGGCGCTAGGAAGAAGTGCATCTTCTGTCAAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117314 GGCAACAATAGGGGCGGCGCTAGGAAGAAGTGCATCTTCTGTCAAAGATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GGTGCCGACTGATGAAGGATACTTGCAACACAG         GGAAGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 117364 GGTGCCGACTGATGAAGGATACTTGCAACACAGGTA...CAGGGAAGTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 ACAGAAGAAGAAGAAAAGAGACTTGCAGAAGTGGTTCATGAGTTGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119464 ACAGAAGAAGAAGAAAAGAGACTTGCAGAAGTGGTTCATGAGTTGACAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CACTGAGCCAGGTGACATAGTCACACAGGGTGTGTCTTGGGCAGCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119514 CACTGAGCCAGGTGACATAGTCACACAGGGTGTGTCTTGGGCAGCTGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CTGAACGAGTGGGTACCCGCTCAGAAAAGCAATGTCGTTCTAAATGGCTC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119564 CTGAACGAGTCGGTACCCGCTCAGAAAAGCAATGTCGTTCTAAATGGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AACTACCTGAATTGGAAACAGAGTGGGGGTACTGAATGGACCAAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119614 AACTACCTGAATTGGAAACAGAGTGGGGGTACTGAATGGACCAAGGAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGAAATCAATCTCATCCTCAG         GATAGCAGAACTTGATGTAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 119664 TGAAATCAATCTCATCCTCAGGTT...TAGGATAGCAGAACTTGATGTAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CTGATGAAAATGACATTAACTGGGATCTGTTAGCTGAGGGATGGAGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120908 CTGATGAAAATGACATTAACTGGGATCTGTTAGCTGAGGGATGGAGTAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GTCCGTTCACCACAATGGCTACGAAGTAAATGGTGGACCATCAAAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120958 GTCCGTTCACCACAATGGCTACGAAGTAAATGGTGGACCATCAAAAGGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 AATTGCAAACCATAAGGATGTTTCGTTCCCTG         TCTTAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 121008 AATTGCAAACCATAAGGATGTTTCGTTCCCTGGTA...CAGTCTTAATAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AAGGTCTTAAACAGTTACATGAGAACCAAAAAAACAACCCAACGCTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123160 AAGGTCTTAAACAGTTACATGAGAACCAAAAAAACAACCCAACGCTTTTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GAGAATAAATCAGGATCTGGAGTTCCAAACAGTAATACCAATTCCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123210 GAGAATAAATCAGGATCTGGAGTTCCAAACAGTAATACCAATTCCAGTGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GCAGCATGTTCAGATAAGAGTTGCCCGCTTGGAAGATAATACAGCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123260 GCAGCATGTTCAGATAAGAGTTGCCCGCTTGGAAGATAATACAGCCATCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CTTCTAGTCCCATGGCAGCATTGCAGATTCCAGTCCAGATCACCCATGTT
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123310 CTTCTAGCCCCATGGCAGCATTGCAGATTCCAGTCCAGATCACCCATGTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 T         CTTCAGCAGACTCTCCTGCTACCGTTGACTCAGAAACAAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123360 TGTA...CAGCTTCAGCAGACTCTCCTGCTACCGTTGACTCAGAAACAAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 AACACTAAACAGTGGAACACTACAGACATTTGAGATTCTTCCC       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 126044 AACACTAAACAGTGGAACACTACAGACATTTGAGATTCTTCCCGTG...T

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1495   TCTTTCCATCTACAGCCCACTGGCACTCCAGGCACCTACCTACTTCAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128255 AGTCTTTCCATCTACAGCCCACTGGCACTCCAGGCACCTACCTACTTCAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 ACAAGCTCAAGCCAAGGCCTTCCCCTAACTCTGACTGCTAGTCCCACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128305 ACAAGCTCAAGCCAAGGCCTTCCCCTAACTCTGACTGCTAGTCCCACAGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 AACCCTGACAGCTGCTGCTCCTGCTTCTCCTGAACAGATTATTGTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128355 AACCCTGACAGCTGCTGCTCCTGCTTCTCCTGAACAGATTATTGTTCATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CTTTATCC         CCAGAACATTTGTTGAACACAAGTGATAATGTT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 128405 CTTTATCCGTA...TAGCCAGAACATTTGTTGAACACAAGTGATAATGTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 ACAGTGCAGTGTCACACACCAAGAGTCATCATTCAGACTGTTGCCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128817 ACAGTGCAGTGTCACACACCAAGAGTCATCATTCAGACTGTTGCCACAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GGACATCACTTCTTCCATATCCCAAGCAGAACTGACAGTCGATAGTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128867 GGACATCACTTCTTCCATATCCCAAGCAGAACTGACAGTCGATAGTGATA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TTCAGTCATCTGATTTTCCTGAGCCTCCAGACGCCCTAGAAGCAGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128917 TTCAGTCATCTGATTTTCCTGAGCCTCCAGACGCCCTAGAAGCAGACACT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 TTCCCAGATGAAATTCATCACCCTAAGATGACTGTGGAGCCATCATTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128967 TTCCCAGATGAAATTCATCACCCTAAGATGACTGTGGAGCCATCATTTAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 TGATGCTCATGTATCCAAATTCAGTGACCAAAATAGCACAGAACTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129017 TGATGCTCATGTATCCAAATTCAGTGACCAAAATAGCACAGAACTGATGA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 ATAGTGTTATGGTCAGAACAGAAGAAGAAATCTCTGACACCGACCTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129067 ATAGTGTTATGGTCAGAACAGAAGAAGAAATCTCTGACACCGACCTTAAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 CAAGAGGAATCACCCTCTGATTTAGCCAGTGCTTATGTTACCGAG     
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||>>>..
 129117 CAAGAGGAATCACCCTCTGATTTAGCCAGTGCTTATGTTACTGAGGTA..

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029     GGTTTAGAGTCTCCCACTATAGAAGAACAAGTTGATCAAACAATTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129167 .TAGGGTTTAGAGTCTCCCACTATAGAAGAACAAGTTGATCAAACAATTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 ATGATGAAACAATACTTATCGTTCCTTCACCACATGGCTTTATCCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129789 ATGATGAAACAATACTTATCGTTCCTTCACCACATGGCTTTATCCAGGCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 TCTGATGTTATAGATACTGAATCTGTCTTGCCTTTGACAACACTAACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 129839 TCTGATGTTATAGATACTGAATCTGTCTTGCCTTTGACAACACTAACAGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2174         ATCCCATACTCCAACATCATCAGGAAGAATCAAATATCATTG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129889 TA...CAGATCCCATACTCCAACATCATCAGGAAGAATCAAATATCATTG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 GATCATCCTTGGGCAGTCCTGTTTCAGAAGATTCAAAGGATGTCGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130132 GATCATCCTTGGGCAGTCCTGTTTCAGAAGATTCAAAGGATGTCGAAGAT

   2400     .    :    .
   2266 TTGGTAAACTGTCAT
        |||||||||||||||
 130182 TTGGTAAACTGTCAT