seq1 = pF1KB6225.tfa, 2013 bp
seq2 = pF1KB6225/gi568815590f_22454507.tfa (gi568815590f:22454507_22674725), 220219 bp

>pF1KB6225 2013
>gi568815590f:22454507_22674725 (Chr8)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-220  (100357-100474)   100% ->
221-414  (102209-102402)   100% ->
415-478  (103623-103686)   100% ->
479-517  (106829-106867)   100% ->
518-584  (107359-107425)   100% ->
585-675  (109481-109571)   100% ->
676-762  (109777-109863)   100% ->
763-816  (109962-110015)   100% ->
817-903  (110762-110848)   100% ->
904-950  (111320-111366)   100% ->
951-1090  (111839-111978)   100% ->
1091-1143  (112155-112207)   100% ->
1144-1190  (112316-112362)   100% ->
1191-1305  (112555-112669)   100% ->
1306-1431  (114642-114767)   100% ->
1432-1743  (116404-116715)   99% ->
1744-1847  (117212-117315)   100% ->
1848-1954  (117834-117940)   100% ->
1955-2013  (120161-120219)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGGCCCACCCCGCAGCCTCCGCGCTGGGCTCAGCCTGGACGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGGCCCACCCCGCAGCCTCCGCGCTGGGCTCAGCCTGGACGACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCCCTGGCCACCTCCAGTCCCACATAGGGTCTTCCTCCCGGGGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCCCTGGCCACCTCCAGTCCCACATAGGGTCTTCCTCCCGGGGGACAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GG         GTGCCCGTGATCCGGAATGGTGGCTCCAACACCCTTAAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGTG...CAGGTGCCCGTGATCCGGAATGGTGGCTCCAACACCCTTAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCCAGTTCCACGACCCCGCGCCCAGGACTGTGTGCAATGGGGGCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100396 TTCCAGTTCCACGACCCCGCGCCCAGGACTGTGTGCAATGGGGGCTACAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACCAAGACGAGATGCTTCCCAGCACCCGG         ACCCTGCGTGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100446 ACCAAGACGAGATGCTTCCCAGCACCCGGGTA...CAGACCCTGCGTGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATCAGACCTGGCCAGGCCCTGGGAGCAAGCCCTCTGCAAGCACAAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102221 ATCAGACCTGGCCAGGCCCTGGGAGCAAGCCCTCTGCAAGCACAAAGATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCTGCCTCCCAGCACACCCAGAACTGGTCAGCCACGTGGACCAAGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102271 CCTGCCTCCCAGCACACCCAGAACTGGTCAGCCACGTGGACCAAGGACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAGCGTCGGGACAAGCGCTGGGTCAAGTACGAGGGAATCGGGCCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102321 CAAGCGTCGGGACAAGCGCTGGGTCAAGTACGAGGGAATCGGGCCCGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACGAGAGCGGCATGCCCATTGCCCCCCGATCC         AGCGTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 102371 ACGAGAGCGGCATGCCCATTGCCCCCCGATCCGTG...CAGAGCGTTGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGACCCAGAGACTGGTACCGGAGAATGTTCCAGCAGATTCACCGGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103632 AGACCCAGAGACTGGTACCGGAGAATGTTCCAGCAGATTCACCGGAAAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCCAG         ACTTGCAGCTGGACTGGACCTTCGAGGAGCCACCCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103682 GCCAGGTA...CAGACTTGCAGCTGGACTGGACCTTCGAGGAGCCACCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GAG         ACCCCAGGCATCTAGGAGCCCAGCAAAGACCTGCCCAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106865 GAGGTG...CAGACCCCAGGCATCTAGGAGCCCAGCAAAGACCTGCCCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGGCCCGGCCCGGCAACATCTTCCAGTGG         AAGAAGCTGGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 107397 AGGCCCGGCCCGGCAACATCTTCCAGTGGGTG...TAGAAGAAGCTGGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CCACTCTGAAGAGTTACCTAGAAGCACCTTCAACTACAGACCTGGAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109493 CCACTCTGAAGAGTTACCTAGAAGCACCTTCAACTACAGACCTGGAGCAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TCTCCACTGTGCTGCAGCCCTCAAATCAG         GTGCTCAGACGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 109543 TCTCCACTGTGCTGCAGCCCTCAAATCAGGTA...CAGGTGCTCAGACGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CGGGAAAAAGTAGACAATGTCTGGACGGAAGAGTCCTGGAACCAGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109789 CGGGAAAAAGTAGACAATGTCTGGACGGAAGAGTCCTGGAACCAGTTTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GCAGGAACTAGAGACTGGGCAGAGG         CCCAAGAAACCGCTGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 109839 GCAGGAACTAGAGACTGGGCAGAGGGTG...CAGCCCAAGAAACCGCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TGGACGACCCTGGTGAGAAGCCCTCCCAGCCCATTGAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 109978 TGGACGACCCTGGTGAGAAGCCCTCCCAGCCCATTGAGGTG...CAGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 CTGCTGGAGAGAGAGCTGGCCGAGCTGAGCGCCGAGCTGGACAAGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110765 CTGCTGGAGAGAGAGCTGGCCGAGCTGAGCGCCGAGCTGGACAAGGACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GCGGGCAATTGAGACCCGACTGCCGTCCCCCAAG         AGCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 110815 GCGGGCAATTGAGACCCGACTGCCGTCCCCCAAGGTA...CAGAGCTCGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 CGGCGCCCCGACGGGCCCCGGAGCAGCGGCCCCCGGCCGG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 111327 CGGCGCCCCGACGGGCCCCGGAGCAGCGGCCCCCGGCCGGGTG...CAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 CCGGCCTCAGCCTGGAGCTCCAGCTACCCACATGCACCTTACCTGGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111840 CCGGCCTCAGCCTGGAGCTCCAGCTACCCACATGCACCTTACCTGGGTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 CGCCCGGTCCCTGAGTCCCCACAAAATGGCTGATGGAGGAAGCCCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111890 CGCCCGGTCCCTGAGTCCCCACAAAATGGCTGATGGAGGAAGCCCCTTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TAGGTCGGAGGGACTTTGTCTACCCTTCCTCAACCCGAG         AC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 111940 TAGGTCGGAGGGACTTTGTCTACCCTTCCTCAACCCGAGGTA...CAGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 CCTAGTGCCTCTAACGGAGGGGGCAGCCCAGCCAGGAGGGAAGAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112157 CCTAGTGCCTCTAACGGAGGGGGCAGCCCAGCCAGGAGGGAAGAGAAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 G         AGAAAGGCCGCCAGGCTCAAGTTTGACTTCCAGGCGCAGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112207 GGTA...TAGAGAAAGGCCGCCAGGCTCAAGTTTGACTTCCAGGCGCAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 CCCCCAA         GGAGCTGACTCTGCAGAAGGGTGACATTGTCTAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112356 CCCCCAAGTA...CAGGGAGCTGACTCTGCAGAAGGGTGACATTGTCTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1225 ATCCACAAGGAGGTGGACAAGAACTGGCTGGAGGGAGAGCACCACGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112589 ATCCACAAGGAGGTGGACAAGAACTGGCTGGAGGGAGAGCACCACGGCCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 CCTGGGCATCTTCCCTGCTAATTATGTGGAG         GTGCTGCCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 112639 CCTGGGCATCTTCCCTGCTAATTATGTGGAGGTG...CAGGTGCTGCCCG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1316 CAGATGAGATCCCTAAGCCCATCAAGCCCCCGACCTACCAGGTGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114652 CAGATGAGATCCCTAAGCCCATCAAGCCCCCGACCTACCAGGTGCTGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366 TATGGAGAGGCTGTGGCCCAGTACACCTTCAAGGGGGACCTGGAGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114702 TATGGAGAGGCTGTGGCCCAGTACACCTTCAAGGGGGACCTGGAGGTGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 GCTGTCCTTCCGCAAG         GGAGAGCACATCTGCCTGATCCGCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 114752 GCTGTCCTTCCGCAAGGTG...CAGGGAGAGCACATCTGCCTGATCCGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1457 AGGTGAACGAGAACTGGTACGAGGGACGCATCACGGGCACGGGGCGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116429 AGGTGAACGAGAACTGGTACGAGGGACGCATCACGGGCACGGGGCGCCAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507 GGCATATTCCCTGCCAGCTACGTGCAGGTGTCTCGTGAACCCCGGCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116479 GGCATATTCCCTGCCAGCTACGTGCAGGTGTCTCGTGAACCCCGGCTCCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 GCTCTGTGACGACGGCCCCCAGCTCCCCACGTCTCCCCGCCTGACCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116529 GCTCTGTGACGACGGCCCCCAGCTCCCCACGTCTCCCCGCCTGACCGCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 CCGCCCGCTCAGCCCGTCACCCCAGCTCCCCCTCAGCCCTGCGCAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116579 CCGCCCGCTCAGCCCGTCACCCCAGCTCCCCCTCAGCCCTGCGCAGCCCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GCTGACCCCACCGACTTGGGGGGACAGACCTCCCCCCGTCGCACTGGCTT
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116629 GCTGACCCCATCGACTTGGGGGGACAGACCTCCCCCCGTCGCACTGGCTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 CTCCTTCCCCACCCAGGAGCCTAGACCCCAGACCCAG         AATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 116679 CTCCTTCCCCACCCAGGAGCCTAGACCCCAGACCCAGGTG...CAGAATC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748 TTGGCACCCCTGGTCCAGCTCTGTCCCACTCTCGAGGTCCCAGCCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117216 TTGGCACCCCTGGTCCAGCTCTGTCCCACTCTCGAGGTCCCAGCCATCCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1798 CTGGACCTGGGGACCTCCTCTCCTAACACCTCTCAGATACACTGGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117266 CTGGACCTGGGGACCTCCTCTCCTAACACCTCTCAGATACACTGGACCCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1848          GTACCGGGCGATGTACCAGTACAGGCCCCAGAACGAAGACG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117316 GTG...CAGGTACCGGGCGATGTACCAGTACAGGCCCCAGAACGAAGACG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1889 AGCTGGAGCTGCGCGAGGGGGACAGGGTGGATGTCATGCAGCAGTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117875 AGCTGGAGCTGCGCGAGGGGGACAGGGTGGATGTCATGCAGCAGTGTGAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1939 GATGGCTGGTTTGTGG         GTGTCTCCCGGAGGACCCAGAAATT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 117925 GATGGCTGGTTTGTGGGTA...CAGGTGTCTCCCGGAGGACCCAGAAATT

   2150     .    :    .    :    .    :
   1980 CGGAACGTTCCCTGGAAATTACGTTGCCCCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120186 CGGAACGTTCCCTGGAAATTACGTTGCCCCGGTG