seq1 = pF1KB6223.tfa, 2010 bp
seq2 = pF1KB6223/gi568815579f_57582164.tfa (gi568815579f:57582164_57788285), 206122 bp

>pF1KB6223 2010
>gi568815579f:57582164_57788285 (Chr19)

1-81  (100001-100081)   100% ->
82-205  (103099-103222)   100% ->
206-2010  (104318-106122)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGCCCCGGTCGGCCGCCGCTCCCCGCCTAGTCCACGGAGCTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGCCCCGGTCGGCCGCCGCTCCCCGCCTAGTCCACGGAGCTCAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGGCAGTCGCGCTGAGGGACTCGGCTCAG         GGTATGACCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100051 GGCGGCAGTCGCGCTGAGGGACTCGGCTCAGGTG...CAGGGTATGACCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGAGGATGTGGCCATTTATTTCTCCCAAGAAGAGTGGGAGCTCCTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103109 TTGAGGATGTGGCCATTTATTTCTCCCAAGAAGAGTGGGAGCTCCTTGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGTCTCAGAGGTTCCTGTACTGCGATGTGATGCTGGAGAACTTTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103159 GAGTCTCAGAGGTTCCTGTACTGCGATGTGATGCTGGAGAACTTTGCACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTAACATCCCTGG         GTTATTGCCATGGAATGGAGAATGAGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103209 TGTAACATCCCTGGGTA...CAGGTTATTGCCATGGAATGGAGAATGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CGATAGCTTCTGAGCAGAGTGTATCTATACAGGTCAGGACTTCTAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104345 CGATAGCTTCTGAGCAGAGTGTATCTATACAGGTCAGGACTTCTAAGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATACACCCACCCAGAAAACTCACCTCAGTGAGATTAAGATGTGTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104395 AATACACCCACCCAGAAAACTCACCTCAGTGAGATTAAGATGTGTGTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGTCTTGAAAGACATTTTGCCTGCGGCTGAGCACCAAACCACATCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104445 AGTCTTGAAAGACATTTTGCCTGCGGCTGAGCACCAAACCACATCCCCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCAAAAGTCATACTTGGGTAGCACAAGCATGAGAGGCTTCTGCTTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104495 TGCAAAAGTCATACTTGGGTAGCACAAGCATGAGAGGCTTCTGCTTCAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCTGACCTTCACCAGCATCAAAAGCATTACAATGAAGAAGAGCCCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104545 GCTGACCTTCACCAGCATCAAAAGCATTACAATGAAGAAGAGCCCTGGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AAGGAAGGTGGATGAGGCTACATTTGTGACCGGCTGCAGATTCCATGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104595 AAGGAAGGTGGATGAGGCTACATTTGTGACCGGCTGCAGATTCCATGTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGAATTATTTCACCTGTGGGGAGGCCTTCCCAGCCCCCACGGACCTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104645 TGAATTATTTCACCTGTGGGGAGGCCTTCCCAGCCCCCACGGACCTACTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CAACACGAAGCCACTCCCAGTGGTGAGGAGCCACACAGTAGCAGCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104695 CAACACGAAGCCACTCCCAGTGGTGAGGAGCCACACAGTAGCAGCAGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCATATACAGGCATTTTTCAATGCAAAAAGTTATTACAAGTGGGGTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104745 GCATATACAGGCATTTTTCAATGCAAAAAGTTATTACAAGTGGGGTGAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACAGAAAAGCTTCAAGCCACAAACACACACTTGTTCAGCATCAGAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104795 ACAGAAAAGCTTCAAGCCACAAACACACACTTGTTCAGCATCAGAGTGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TGTTCTGAAGGAGGGCTTTATGAGTGTAGCAAATGTGAGAAAGCCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104845 TGTTCTGAAGGAGGGCTTTATGAGTGTAGCAAATGTGAGAAAGCCTTCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TTGCAAGAACACACTTGTTCAGCACCAGCAAATTCACACTGGACAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104895 TTGCAAGAACACACTTGTTCAGCACCAGCAAATTCACACTGGACAAAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TGTTTGAGTGTAGTGAATGTGAGGAATCCTTTAGCAAAAAGTGCCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104945 TGTTTGAGTGTAGTGAATGTGAGGAATCCTTTAGCAAAAAGTGCCACCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 ATCTTACACAAGATAATTCACACTGGAGAAAGGCCTTATGAATGCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104995 ATCTTACACAAGATAATTCACACTGGAGAAAGGCCTTATGAATGCAGTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TCGTGAGAAAGCCTTTATCCATAAATCTGAATTCATTCACCACCAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105045 TCGTGAGAAAGCCTTTATCCATAAATCTGAATTCATTCACCACCAGAGAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GTCACACTGGAGGAGTGCGTCATGAGTGTGGTGAATGTAGGAAAACCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105095 GTCACACTGGAGGAGTGCGTCATGAGTGTGGTGAATGTAGGAAAACCTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 AGCTACAAATCTAACCTCATTGAACACCAGAGAGTTCACACTGGAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105145 AGCTACAAATCTAACCTCATTGAACACCAGAGAGTTCACACTGGAGAAAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GCCTTATGAATGTGGCGAGTGCGGGAAATCCTTTAGACAAAGCTCTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105195 GCCTTATGAATGTGGCGAGTGCGGGAAATCCTTTAGACAAAGCTCTAGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TTTTTCGACACCAGAGAGTTCACTCTGGAGAAAGGCCTTATCAGTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105245 TTTTTCGACACCAGAGAGTTCACTCTGGAGAAAGGCCTTATCAGTGCTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GAGTGTGGGAAATCCTTTAGACAAATCTTCAATCTCATTCGACATAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105295 GAGTGTGGGAAATCCTTTAGACAAATCTTCAATCTCATTCGACATAGAAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 AGTTCACACTGGAGAAATGCCTTATCAGTGCAGTGATTGTGGGAAATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105345 AGTTCACACTGGAGAAATGCCTTATCAGTGCAGTGATTGTGGGAAATCTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 TTAGCTGCAAATCGGAACTCATTCAACACCAGAGAATTCACAGTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105395 TTAGCTGCAAATCGGAACTCATTCAACACCAGAGAATTCACAGTGGAGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 AGACCTTATGAATGCAGAGAATGTGGGAAATCCTTTAGACAATTCTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105445 AGACCTTATGAATGCAGAGAATGTGGGAAATCCTTTAGACAATTCTCTAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 CCTCATTCGACACCGCAGCATTCACACTGGTGATAGGCCTTATGAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105495 CCTCATTCGACACCGCAGCATTCACACTGGTGATAGGCCTTATGAGTGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 GTGAATGTGAGAAATCCTTTAGCCGCAAATTTATCCTGATTCAACACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105545 GTGAATGTGAGAAATCCTTTAGCCGCAAATTTATCCTGATTCAACACCAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 AGAGTTCACACTGGAGAAAGACCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105595 AGAGTTCACACTGGAGAAAGACCTTATGAATGCAGTGAATGTGGAAAATC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 CTTTACCCGCAAATCTGACCTCATTCAACACCGGAGAATTCATACTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105645 CTTTACCCGCAAATCTGACCTCATTCAACACCGGAGAATTCATACTGGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 CAAGACCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGCAAATCTTTTAGACAGCGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105695 CAAGACCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGCAAATCTTTTAGACAGCGCTCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 GGCCTCATTCAGCACCGGAGACTTCATACTGGAGAAAGGCCTTATGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105745 GGCCTCATTCAGCACCGGAGACTTCATACTGGAGAAAGGCCTTATGAATG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 TAGTGAATGTGGAAAGTCTTTTAGCCAAAGTGCTAGCCTCATTCAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105795 TAGTGAATGTGGAAAGTCTTTTAGCCAAAGTGCTAGCCTCATTCAACACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 AGAGAGTTCACACTGGAGAAAGGCCTTATGAATGTAGTGAATGTGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105845 AGAGAGTTCACACTGGAGAAAGGCCTTATGAATGTAGTGAATGTGGGAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1783 TCCTTTAGCCAGAGCTCTAGCCTCATTCAACACCAGAGAGGTCACACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105895 TCCTTTAGCCAGAGCTCTAGCCTCATTCAACACCAGAGAGGTCACACTGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1833 AGAAAGACCTTATGAGTGCAGTCAATGTGGGAAACCCTTTACCCACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105945 AGAAAGACCTTATGAGTGCAGTCAATGTGGGAAACCCTTTACCCACAAAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1883 CAGACCTTATTCAGCACCAAAGAGTTCACACTGGAGAAAGGCCTTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105995 CAGACCTTATTCAGCACCAAAGAGTTCACACTGGAGAAAGGCCTTATGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1933 TGCAGTGAATGTGGGAAATCCTTTAGCCGCAAATCTAACCTCATTCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106045 TGCAGTGAATGTGGGAAATCCTTTAGCCGCAAATCTAACCTCATTCGACA

   2000     .    :    .    :    .
   1983 TCGGAGAGTTCACACTGAAGAAAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||
 106095 TCGGAGAGTTCACACTGAAGAAAGGCCT