seq1 = pF1KB6217.tfa, 2184 bp
seq2 = pF1KB6217/gi568815586r_6247886.tfa (gi568815586r:6247886_6474960), 227075 bp

>pF1KB6217 2184
>gi568815586r:6247886_6474960 (Chr12)

(complement)

1-593  (100001-100593)   100% ->
594-861  (111251-111518)   100% ->
862-1052  (112720-112910)   100% ->
1053-1156  (119081-119184)   100% ->
1157-1320  (119526-119689)   100% ->
1321-1419  (120113-120211)   100% ->
1420-1537  (120406-120523)   100% ->
1538-1616  (125556-125634)   100% ->
1617-1674  (125740-125797)   100% ->
1675-1730  (125956-126011)   100% ->
1731-1806  (126159-126234)   100% ->
1807-2184  (126708-127085)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCATGGCCAGGGGCAGCCTCACTCGGGTTCCAGGGGTGATGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCATGGCCAGGGGCAGCCTCACTCGGGTTCCAGGGGTGATGGGAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCACTCAGGGCCCAGAGCTCAGCCTTGACCCTGACCCTTGCTCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCACTCAGGGCCCAGAGCTCAGCCTTGACCCTGACCCTTGCTCTCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AATCCACTCCGGGGCTCATGAAGGGGAACAAGCTGGAGGAGCAGGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AATCCACTCCGGGGCTCATGAAGGGGAACAAGCTGGAGGAGCAGGACCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGACCTCTGCAGCCCATACCAGGTCTCATGGAGGGGAACAAGCTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGACCTCTGCAGCCCATACCAGGTCTCATGGAGGGGAACAAGCTGGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCAGGACTCTAGCCCTCCACAGTCCACTCCAGGGCTCATGAAGGGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCAGGACTCTAGCCCTCCACAGTCCACTCCAGGGCTCATGAAGGGGAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCGTGAGGAGCAGGGGCTGGGCCCCGAACCTGCGGCGCCCCAGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCGTGAGGAGCAGGGGCTGGGCCCCGAACCTGCGGCGCCCCAGCAGCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACGGCGGAGGAGGAGGCCCTGATCGAGTTCCACCGCTCCTACCGAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACGGCGGAGGAGGAGGCCCTGATCGAGTTCCACCGCTCCTACCGAGAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTCGAGTTCTTCTGCAACAACACCACCATCCACGGCGCCATCCGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTCGAGTTCTTCTGCAACAACACCACCATCCACGGCGCCATCCGCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGTGCTCCCAGCACAACCGCATGAAGACGGCCTTCTGGGCAGTGCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGTGCTCCCAGCACAACCGCATGAAGACGGCCTTCTGGGCAGTGCTGTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCTGCACCTTTGGCATGATGTACTGGCAATTCGGCCTGCTTTTCGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCTGCACCTTTGGCATGATGTACTGGCAATTCGGCCTGCTTTTCGGAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTACTTCAGCTACCCCGTCAGCCTCAACATCAACCTCAACTCGGACAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTACTTCAGCTACCCCGTCAGCCTCAACATCAACCTCAACTCGGACAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCGTCTTCCCCGCAGTGACCATCTGCACCCTCAATCCCTACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100551 TCGTCTTCCCCGCAGTGACCATCTGCACCCTCAATCCCTACAGGTC...C

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    594   GTACCCGGAAATTAAAGAGGAGCTGGAGGAGCTGGACCGCATCACAGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111249 AGGTACCCGGAAATTAAAGAGGAGCTGGAGGAGCTGGACCGCATCACAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCAGACGCTCTTTGACCTGTACAAATACAGCTCCTTCACCACTCTCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111299 GCAGACGCTCTTTGACCTGTACAAATACAGCTCCTTCACCACTCTCGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CCGGCTCCCGCAGCCGTCGCGACCTGCGGGGGACTCTGCCGCACCCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111349 CCGGCTCCCGCAGCCGTCGCGACCTGCGGGGGACTCTGCCGCACCCCTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CAGCGCCTGAGGGTCCCGCCCCCGCCTCACGGGGCCCGTCGAGCCCGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111399 CAGCGCCTGAGGGTCCCGCCCCCGCCTCACGGGGCCCGTCGAGCCCGTAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CGTGGCCTCCAGCTTGCGGGACAACAACCCCCAGGTGGACTGGAAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111449 CGTGGCCTCCAGCTTGCGGGACAACAACCCCCAGGTGGACTGGAAGGACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GGAAGATCGGCTTCCAGCTG         TGCAACCAGAACAAATCGGAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 111499 GGAAGATCGGCTTCCAGCTGGTG...CAGTGCAACCAGAACAAATCGGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TGCTTCTACCAGACATACTCATCAGGGGTGGATGCGGTGAGGGAGTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112741 TGCTTCTACCAGACATACTCATCAGGGGTGGATGCGGTGAGGGAGTGGTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CCGCTTCCACTACATCAACATCCTGTCGAGGCTGCCAGAGACTCTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112791 CCGCTTCCACTACATCAACATCCTGTCGAGGCTGCCAGAGACTCTGCCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 CCCTGGAGGAGGACACGCTGGGCAACTTCATCTTCGCCTGCCGCTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112841 CCCTGGAGGAGGACACGCTGGGCAACTTCATCTTCGCCTGCCGCTTCAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CAGGTCTCCTGCAACCAGGC         GAATTACTCTCACTTCCACCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 112891 CAGGTCTCCTGCAACCAGGCGTG...AAGGAATTACTCTCACTTCCACCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CCCGATGTATGGAAACTGCTATACTTTCAATGACAAGAACAACTCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119102 CCCGATGTATGGAAACTGCTATACTTTCAATGACAAGAACAACTCCAACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TCTGGATGTCTTCCATGCCTGGAATCAACAACG         GTCTGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 119152 TCTGGATGTCTTCCATGCCTGGAATCAACAACGGTG...TAGGTCTGTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CTGATGCTGCGCGCAGAGCAGAATGACTTCATTCCCCTGCTGTCCACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119534 CTGATGCTGCGCGCAGAGCAGAATGACTTCATTCCCCTGCTGTCCACAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GACTGGGGCCCGGGTAATGGTGCACGGGCAGGATGAACCTGCCTTTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119584 GACTGGGGCCCGGGTAATGGTGCACGGGCAGGATGAACCTGCCTTTATGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 ATGATGGTGGCTTTAACTTGCGGCCTGGCGTGGAGACCTCCATCAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119634 ATGATGGTGGCTTTAACTTGCGGCCTGGCGTGGAGACCTCCATCAGCATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 AGGAAG         GAAACCCTGGACAGACTTGGGGGCGATTATGGCGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119684 AGGAAGGCA...TAGGAAACCCTGGACAGACTTGGGGGCGATTATGGCGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CTGCACCAAGAATGGCAGTGATGTTCCTGTTGAGAACCTTTACCCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120148 CTGCACCAAGAATGGCAGTGATGTTCCTGTTGAGAACCTTTACCCTTCAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 AGTACACACAGCAG         GTGTGTATTCACTCCTGCTTCCAGGAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 120198 AGTACACACAGCAGGTG...CAGGTGTGTATTCACTCCTGCTTCCAGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 AGCATGATCAAGGAGTGTGGCTGTGCCTACATCTTCTATCCGCGGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120433 AGCATGATCAAGGAGTGTGGCTGTGCCTACATCTTCTATCCGCGGCCCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 GAACGTGGAGTACTGTGACTACAGAAAGCACAGTTCCTGGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 120483 GAACGTGGAGTACTGTGACTACAGAAAGCACAGTTCCTGGGGTG...CAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 GGTACTGCTACTATAAGCTCCAGGTTGACTTCTCCTCAGACCACCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125556 GGTACTGCTACTATAAGCTCCAGGTTGACTTCTCCTCAGACCACCTGGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 TGTTTCACCAAGTGCCGGAAGCCATGCAG         CGTGACCAGCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 125606 TGTTTCACCAAGTGCCGGAAGCCATGCAGGTT...CAGCGTGACCAGCTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 CCAGCTCTCTGCTGGTTACTCACGATGGCCCTCGGTGACATCCCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 125752 CCAGCTCTCTGCTGGTTACTCACGATGGCCCTCGGTGACATCCCAGGTA.

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675      GAATGGGTCTTCCAGATGCTATCGCGACAGAACAATTACACCGTC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125802 ..TAGGAATGGGTCTTCCAGATGCTATCGCGACAGAACAATTACACCGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 AACAACAAGAG         AAATGGAGTGGCCAAAGTCAACATCTTCTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 126001 AACAACAAGAGGTC...AAGAAATGGAGTGGCCAAAGTCAACATCTTCTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 CAAGGAGCTGAACTACAAAACCAATTCTGAGTCTCCCTCTGTCACG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 126189 CAAGGAGCTGAACTACAAAACCAATTCTGAGTCTCCCTCTGTCACGGTA.

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807      ATGGTCACCCTCCTGTCCAACCTGGGCAGCCAGTGGAGCCTGTGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126239 ..CAGATGGTCACCCTCCTGTCCAACCTGGGCAGCCAGTGGAGCCTGTGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 TTCGGCTCCTCGGTGTTGTCTGTGGTGGAGATGGCTGAGCTCGTCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126753 TTCGGCTCCTCGGTGTTGTCTGTGGTGGAGATGGCTGAGCTCGTCTTTGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CCTGCTGGTCATCATGTTCCTCATGCTGCTCCGAAGGTTCCGAAGCCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126803 CCTGCTGGTCATCATGTTCCTCATGCTGCTCCGAAGGTTCCGAAGCCGAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 ACTGGTCTCCAGGCCGAGGGGGCAGGGGTGCTCAGGAGGTAGCCTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126853 ACTGGTCTCCAGGCCGAGGGGGCAGGGGTGCTCAGGAGGTAGCCTCCACC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 CTGGCATCCTCCCCTCCTTCCCACTTCTGCCCCCACCCCATGTCTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126903 CTGGCATCCTCCCCTCCTTCCCACTTCTGCCCCCACCCCATGTCTCTGTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 CTTGTCCCAGCCAGGCCCTGCTCCCTCTCCAGCCTTGACAGCCCCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126953 CTTGTCCCAGCCAGGCCCTGCTCCCTCTCCAGCCTTGACAGCCCCTCCCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 CTGCCTATGCCACCCTGGGCCCCCGCCCATCTCCAGGGGGCTCTGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127003 CTGCCTATGCCACCCTGGGCCCCCGCCCATCTCCAGGGGGCTCTGCAGGG

   2250     .    :    .    :    .    :
   2152 GCCAGTTCCTCCGCCTGTCCTCTGGGGGGGCCC
        |||||||||||| ||||||||||||||||||||
 127053 GCCAGTTCCTCCACCTGTCCTCTGGGGGGGCCC