seq1 = pF1KB6206.tfa, 2145 bp
seq2 = pF1KB6206/gi568815579f_58146298.tfa (gi568815579f:58146298_58362751), 216454 bp

>pF1KB6206 2145
>gi568815579f:58146298_58362751 (Chr19)

1-33  (97727-97759)   100% ->
34-160  (100004-100130)   100% ->
161-244  (100414-100497)   100% ->
245-2145  (114554-116454)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGCACGTTCTATGCTGGTTCCACCCCAG         GCATCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  97727 ATGGAAGCACGTTCTATGCTGGTTCCACCCCAGGTG...CAGGCATCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GTGCTTCGAGGATGTGGCTATGGCATTCACACAGGAGGAGTGGGAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 GTGCTTCGAGGATGTGGCTATGGCATTCACACAGGAGGAGTGGGAACAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGACCTGGCCCAGAGGACACTGTACCGAGAGGTGACACTGGAGACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 TGGACCTGGCCCAGAGGACACTGTACCGAGAGGTGACACTGGAGACCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGCATATTGTCTCCCTGG         GGCTTTTCCTTTCCAAATCTGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100112 GAGCATATTGTCTCCCTGGGTA...CAGGGCTTTTCCTTTCCAAATCTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGTGATCTCTCAGCTGGAGCAAGAAGAGGACCTGTGCAGGGCAGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100436 TGTGATCTCTCAGCTGGAGCAAGAAGAGGACCTGTGCAGGGCAGAGCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGCCCCCCGAG         ACTGGAAAGCTACCCTTGAGGAGAATAGG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100486 AGGCCCCCCGAGGTA...CAGACTGGAAAGCTACCCTTGAGGAGAATAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTGAATTCTGAAAAAGATCGAGCTAGGGAAGAACTATCCCACCACGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114583 TTGAATTCTGAAAAAGATCGAGCTAGGGAAGAACTATCCCACCACGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGTGTACAGGAGTGGACCGGAGGAGCCACCCTCTTTGGTATTAGGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114633 AGTGTACAGGAGTGGACCGGAGGAGCCACCCTCTTTGGTATTAGGAAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGCAAGATCAGAGCAACCAGTTAAGGGAACACCAGGAGAACTCCTTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114683 TGCAAGATCAGAGCAACCAGTTAAGGGAACACCAGGAGAACTCCTTGAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTCATGGTACTCACCTCAGAGAGACTGTTTGCTCAAAGGGAACATTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114733 TTCATGGTACTCACCTCAGAGAGACTGTTTGCTCAAAGGGAACATTGTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCTTGAACTTGGGGGAGGTTATTCTCTACCTTCTACTTTAAGCCTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114783 GCTTGAACTTGGGGGAGGTTATTCTCTACCTTCTACTTTAAGCCTTCTAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTACAACATTACCTACAAGTACAGGTTTCCCTAAGCCCAACTCACAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114833 CTACAACATTACCTACAAGTACAGGTTTCCCTAAGCCCAACTCACAAGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AAAGAGTTGAAACAAAATTCAGCTTTCATTAATCATGAGAAAAATGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114883 AAAGAGTTGAAACAAAATTCAGCTTTCATTAATCATGAGAAAAATGGAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGATGGGAAGCACTGTGAGAGTCATCAGTGTGCTAGAGCTTTCTGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114933 AGATGGGAAGCACTGTGAGAGTCATCAGTGTGCTAGAGCTTTCTGTCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GTATTTACTTGAGTAAACTTGGAAACGTTGAAACAGGAAAGAAAAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114983 GTATTTACTTGAGTAAACTTGGAAACGTTGAAACAGGAAAGAAAAACCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TATGAATATATTGTCAGTGGTGACTCTCTCAACTATGGTTCCTCCCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115033 TATGAATATATTGTCAGTGGTGACTCTCTCAACTATGGTTCCTCCCTTTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TTTTCATGGTAGAACTTTTTCAGTGAAGAAAAGTGATGACTGTAAGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115083 TTTTCATGGTAGAACTTTTTCAGTGAAGAAAAGTGATGACTGTAAGGATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ATGGAAACCTCTTCAGTCACAGTGTGTCTCTGAATGAACAGAAGCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115133 ATGGAAACCTCTTCAGTCACAGTGTGTCTCTGAATGAACAGAAGCCAGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CATTTTGGGAAAAGTCAGTATGAGTGTGATGAGTGCAGGGAAACCTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115183 CATTTTGGGAAAAGTCAGTATGAGTGTGATGAGTGCAGGGAAACCTGTTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TGAGAGTCTGTGCCTTGTACAAACAGAAAGAAGTGGCCCTGGAGAGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115233 TGAGAGTCTGTGCCTTGTACAAACAGAAAGAAGTGGCCCTGGAGAGACCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CCTTCAGATGTGAGGAACGCTGTGCTGCCTTCCCCATGGCCTCATCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115283 CCTTCAGATGTGAGGAACGCTGTGCTGCCTTCCCCATGGCCTCATCTTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TCTGACTGTAACATCATTCAGACTACAGAGAAGCCATCTGTGTGTAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115333 TCTGACTGTAACATCATTCAGACTACAGAGAAGCCATCTGTGTGTAATCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GTGTGGAAAATCTTTCAGCTGTTGTAAGCTCATACACCAGAGAACACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115383 GTGTGGAAAATCTTTCAGCTGTTGTAAGCTCATACACCAGAGAACACACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CTGGAGAAAAGCCCTTCGAATGTACTCAGTGTGGGAAATCTTTTAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115433 CTGGAGAAAAGCCCTTCGAATGTACTCAGTGTGGGAAATCTTTTAGCCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AGCTATGACCTTGTCATACATCAGAGGACACACACTGGAGAGAAGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115483 AGCTATGACCTTGTCATACATCAGAGGACACACACTGGAGAGAAGCCCTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TGAGTGTGACCTGTGTGGGAAATCCTTCACCCAGAGATCCAAACTTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115533 TGAGTGTGACCTGTGTGGGAAATCCTTCACCCAGAGATCCAAACTTATTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 CACATCAGCGAATTCACACTGGAGAAAAACCGTATCAGTGTATTGAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115583 CACATCAGCGAATTCACACTGGAGAAAAACCGTATCAGTGTATTGAATGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 AGAAAATCCTTCAGGTGGAACTCTAACCTCATTGTACATCAGAGAATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115633 AGAAAATCCTTCAGGTGGAACTCTAACCTCATTGTACATCAGAGAATTCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 TACTGGAGAGAAACCGTATGAGTGCACTCACTGTGGAAAGTCCTTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115683 TACTGGAGAGAAACCGTATGAGTGCACTCACTGTGGAAAGTCCTTCAGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 AAAGCTATGAGTTAGTTACACATAAAAGAACGCACACTGGAGAAAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115733 AAAGCTATGAGTTAGTTACACATAAAAGAACGCACACTGGAGAAAAACCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 TTCAAATGTACTCAGTGTGGGAAATCTTTCAGCCAGAAGTATGACCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115783 TTCAAATGTACTCAGTGTGGGAAATCTTTCAGCCAGAAGTATGACCTTGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 TGTACATCAGAGGACACACACTGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCAACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115833 TGTACATCAGAGGACACACACTGGAGAGAAGCCCTATGAGTGCAACCTGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 GTGGGAAATCCTTCTCCCAGAGTTCCAAACTTATTACGCATCAGCGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115883 GTGGGAAATCCTTCTCCCAGAGTTCCAAACTTATTACGCATCAGCGAATT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 CACACTGGAGAAAAACCGTATCAGTGTATTGAATGTGGGAAATCCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115933 CACACTGGAGAAAAACCGTATCAGTGTATTGAATGTGGGAAATCCTTCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 ATGGAACTCTAACCTCGTCATACATCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115983 ATGGAACTCTAACCTCGTCATACATCAGAGAATTCATACTGGAGAGAAAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 CGTACGATTGCACTCACTGTGGAAAGTCCTTCAGCCAAAGCTATCAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116033 CGTACGATTGCACTCACTGTGGAAAGTCCTTCAGCCAAAGCTATCAGTTA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 GTTGCACATAAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCCTATGAATGTAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116083 GTTGCACATAAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCCTATGAATGTAACGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 GTGTGGAAAAGCCTTCAATCGAAGCACTCAGCTCATCAGGCATCTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116133 GTGTGGAAAAGCCTTCAATCGAAGCACTCAGCTCATCAGGCATCTGCAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 TTCACACTGGGGAGAAGCCGTACAAATGCAATCAGTGCAATAAAGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116183 TTCACACTGGGGAGAAGCCGTACAAATGCAATCAGTGCAATAAAGCCTTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1924 GCAAGGAGCTCCTACCTTGTGATGCATCAGAGAACTCACACTGGTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116233 GCAAGGAGCTCCTACCTTGTGATGCATCAGAGAACTCACACTGGTGAGAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1974 ACCTTTTGAGTGTAGTCAGTGTGGGAAAGCCTTTTCAGGGAGCTCTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116283 ACCTTTTGAGTGTAGTCAGTGTGGGAAAGCCTTTTCAGGGAGCTCTAACC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2024 TTCTTTCCCATCACAGAATTCATTCTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116333 TTCTTTCCCATCACAGAATTCATTCTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2074 GACTGTGGGAAATCCTTCCGGCAGCGATCTCAACTTGTAGTGCATCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 116383 GACTGTGGGAAATCCTTCCGGCAGCAATCTCAACTTGTAGTGCATCGGCG

   2150     .    :    .    :
   2124 GACACATACTGGAGAGAAACCT
        ||||||||||||||||||||||
 116433 GACACATACTGGAGAGAAACCT