seq1 = pF1KB6205.tfa, 1992 bp
seq2 = pF1KB6205/gi568815586r_105074317.tfa (gi568815586r:105074317_105336012), 261696 bp

>pF1KB6205 1992
>gi568815586r:105074317_105336012 (Chr12)

(complement)

1-54  (100001-100054)   100% ->
55-153  (106790-106888)   100% ->
154-213  (118288-118347)   100% ->
214-285  (118873-118944)   100% ->
286-373  (124696-124783)   100% ->
374-415  (127814-127855)   100% ->
416-474  (127984-128042)   100% ->
475-621  (128806-128952)   100% ->
622-704  (132228-132310)   100% ->
705-863  (136482-136640)   100% ->
864-1052  (138060-138248)   100% ->
1053-1095  (140386-140428)   100% ->
1096-1152  (140512-140568)   100% ->
1153-1241  (140664-140752)   100% ->
1242-1406  (145858-146022)   100% ->
1407-1459  (146189-146241)   100% ->
1460-1634  (147566-147740)   100% ->
1635-1671  (158751-158787)   100% ->
1672-1812  (158997-159137)   100% ->
1813-1860  (159931-159978)   100% ->
1861-1992  (161565-161696)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGCCGTGGACAAGCTCCTGCTAGAGGAGGCGTTGCAGGACAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGCCGTGGACAAGCTCCTGCTAGAGGAGGCGTTGCAGGACAGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAG         ACTCGCTCTTTACTGAGCGTGTTTGAAGAAGATGCTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGGTA...CAGACTCGCTCTTTACTGAGCGTGTTTGAAGAAGATGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCACCCTCACAGACTATACCAACCAGCTGCTCCAGGCAATGCAGCGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106827 GCACCCTCACAGACTATACCAACCAGCTGCTCCAGGCAATGCAGCGCGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATGGAGCCCAG         AATGAGATGTGCCTGGCCACACAACAGCT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 106877 TATGGAGCCCAGGTA...CAGAATGAGATGTGCCTGGCCACACAACAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTCTAAGCAACTGCTGGCATATGAAAAACAG         AACTTTGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 118317 TTCTAAGCAACTGCTGGCATATGAAAAACAGGTA...TAGAACTTTGCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TTGGCAAAGGTGATGAAGAAGTAATTTCAACACTCCACTATTTTTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118883 TTGGCAAAGGTGATGAAGAAGTAATTTCAACACTCCACTATTTTTCCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTGGTGGATGAG         CTTAATCTTCTCCATACAGAGCTGGCTAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 118933 GTGGTGGATGAGGTA...CAGCTTAATCTTCTCCATACAGAGCTGGCTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 ACAGTTGGCAGACACAATGGTTCTACCTATCATACAATTCCGAGAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124725 ACAGTTGGCAGACACAATGGTTCTACCTATCATACAATTCCGAGAAAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATCTCACAG         AAGTAAGCACTTTAAAGGATCTATTTGGACTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 124775 ATCTCACAGGTA...CAGAAGTAAGCACTTTAAAGGATCTATTTGGACTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GCTAGCAATG         AGCATGACCTCTCAATGGCAAAATACAGCAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 127846 GCTAGCAATGGTA...TAGAGCATGACCTCTCAATGGCAAAATACAGCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 GCTGCCTAAGAAAAAGGAGAATGAGAAG         GTGAAGACCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 128015 GCTGCCTAAGAAAAAGGAGAATGAGAAGGTA...CAGGTGAAGACCGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488 TCGGAAAAGAGGTGGCCGCGGCCCGGCGGAAGCAGCACCTCTCCTCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128819 TCGGAAAAGAGGTGGCCGCGGCCCGGCGGAAGCAGCACCTCTCCTCCCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 CAGTACTACTGTGCCCTCAACGCGCTGCAGTACAGAAAGCAAATGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128869 CAGTACTACTGTGCCCTCAACGCGCTGCAGTACAGAAAGCAAATGGCCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GATGGAGCCCATGATAGGCTTTGCCCATGGACAG         ATTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 128919 GATGGAGCCCATGATAGGCTTTGCCCATGGACAGGTA...CAGATTAACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 TTTTTAAGAAGGGAGCAGAGATGTTTTCCAAACGTATGGACAGCTTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132235 TTTTTAAGAAGGGAGCAGAGATGTTTTCCAAACGTATGGACAGCTTTTTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 TCCTCCGTTGCAGACATGGTTCAAAG         CATTCAGGTAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 132285 TCCTCCGTTGCAGACATGGTTCAAAGGTA...AAGCATTCAGGTAGAACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 GGAAGCCGAGGCGGAAAAGATGCGGGTGTCCCAGCAAGAATTACTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136497 GGAAGCCGAGGCGGAAAAGATGCGGGTGTCCCAGCAAGAATTACTTTCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 TTGATGAATCTGTTTACACTCCAGACTCTGATGTGGCCGCACCACAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136547 TTGATGAATCTGTTTACACTCCAGACTCTGATGTGGCCGCACCACAGATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 AACAGGAACCTCATCCAGAAGGCTGGTTACCTTAATCTTAGAAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 136597 AACAGGAACCTCATCCAGAAGGCTGGTTACCTTAATCTTAGAAAGTG...

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    864    CAAAACAGGGCTGGTCACCACCACCTGGGAGAGGCTTTATTTCTTCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138057 CAGCAAAACAGGGCTGGTCACCACCACCTGGGAGAGGCTTTATTTCTTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 CCCAAGGCGGGAATCTCATGTGTCAGCCCAGGGGAGCCGTGGCTGGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138107 CCCAAGGCGGGAATCTCATGTGTCAGCCCAGGGGAGCCGTGGCTGGAGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 TTGATCCAGGACCTGGACAACTGCTCAGTGATGGCCGTGGATTGCGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138157 TTGATCCAGGACCTGGACAACTGCTCAGTGATGGCCGTGGATTGCGAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CCGGCGCTACTGCTTCCAGATCACCACGCCCAATGGAAAATC        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 138207 CCGGCGCTACTGCTTCCAGATCACCACGCCCAATGGAAAATCGTA...CA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1053  GGGAATAATCCTCCAGGCTGAGAGCAGAAAGGAAAATGAAGAG      
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 140385 GGGGAATAATCCTCCAGGCTGAGAGCAGAAAGGAAAATGAAGAGGTA...

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1096    TGGATATGTGCAATAAACAACATCTCCAGACAGATCTACCTGACCGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140509 CAGTGGATATGTGCAATAAACAACATCTCCAGACAGATCTACCTGACCGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 CAACCCTGAG         GCAGTCGCGATCAAGTTGAATCAGACCGCTC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 140559 CAACCCTGAGGTA...TAGGCAGTCGCGATCAAGTTGAATCAGACCGCTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 TGCAAGCAGTGACTCCCATTACAAGTTTTGGAAAAAAACAAGAAAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140695 TGCAAGCAGTGACTCCCATTACAAGTTTTGGAAAAAAACAAGAAAGCTCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 TGCCCCAG         CCAGAACCTGAAAAATTCAGAGATGGAAAATGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 140745 TGCCCCAGGTA...CAGCCAGAACCTGAAAAATTCAGAGATGGAAAATGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 AAATGACAAGATTGTTCCCAAAGCAACAGCCAGTCTACCTGAAGCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145891 AAATGACAAGATTGTTCCCAAAGCAACAGCCAGTCTACCTGAAGCAGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 AGCTGATCGCGCCTGGAACGCCGATTCAATTCGATATTGTGCTTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145941 AGCTGATCGCGCCTGGAACGCCGATTCAATTCGATATTGTGCTTCCTGCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 ACAGAATTCCTTGATCAGAACAGAGGGAGCAG         GCGTACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 145991 ACAGAATTCCTTGATCAGAACAGAGGGAGCAGGTA...TAGGCGTACCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 CCCTTTTGGTGAAACTGAGGATGAATCATTTCCAGAAGCAGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 146198 CCCTTTTGGTGAAACTGAGGATGAATCATTTCCAGAAGCAGAAGGTA...

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1460    ATTCTCTTTTGCAGCAGATGTTTATAGTTCGGTTTTTGGGATCAATG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147563 CAGATTCTCTTTTGCAGCAGATGTTTATAGTTCGGTTTTTGGGATCAATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507 GCAGTTAAAACAGACAGCACTACTGAAGTGATTTATGAAGCGATGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147613 GCAGTTAAAACAGACAGCACTACTGAAGTGATTTATGAAGCGATGAGACA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 AGTATTGGCTGCTCGGGCTATTCATAACATCTTCCGCATGACAGAATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147663 AGTATTGGCTGCTCGGGCTATTCATAACATCTTCCGCATGACAGAATCCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 ATCTGATGGTCACCAGTCAATCTTTGAG         GTTGATAGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 147713 ATCTGATGGTCACCAGTCAATCTTTGAGGTA...CAGGTTGATAGATCCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1648 CAGACTCAAGTATCAAGGGCCAAT         TTTGAACTTACCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 158764 CAGACTCAAGTATCAAGGGCCAATGTA...CAGTTTGAACTTACCAGTGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1689 CACACAATTTGCTGCTCATCAAGAAAACAAGAGACTGGTTGGTTTTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159014 CACACAATTTGCTGCTCATCAAGAAAACAAGAGACTGGTTGGTTTTGTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1739 TCCGTGTTCCTGAATCCACTGGAGAAGAATCTCTGAGTACATACATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159064 TCCGTGTTCCTGAATCCACTGGAGAAGAATCTCTGAGTACATACATTTTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789 GAAAGCAACTCAGAAGGCGAAAAG         ATATGTTATGCTATTAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 159114 GAAAGCAACTCAGAAGGCGAAAAGGTC...CAGATATGTTATGCTATTAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1830 TTTGGGAAAAGAAATTATTGAGGTTCAGAAG         GATCCAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 159948 TTTGGGAAAAGAAATTATTGAGGTTCAGAAGGTA...CAGGATCCAGAAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1871 CACTGGCTCAATTAATGCTGTCCATACCACTAACCAATGATGGAAAATAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 161575 CACTGGCTCAATTAATGCTGTCCATACCACTAACCAATGACGGAAAATAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1921 GTACTGTTAAACGATCAACCAGATGACGATGATGGAAATCCAAATGAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 161625 GTACTGTTAAACGATCAACCAGATGACGATGATGGAAATCCAAACGAACA

   2150     .    :    .    :
   1971 TAGAGGCGCAGAATCCGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||
 161675 TAGAGGCGCAGAATCCGAAGCA