seq1 = pF1KB6202.tfa, 2133 bp
seq2 = pF1KB6202/gi568815579f_51473330.tfa (gi568815579f:51473330_51688464), 215135 bp

>pF1KB6202 2133
>gi568815579f:51473330_51688464 (Chr19)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-199  (108062-108188)   100% ->
200-295  (108458-108553)   100% ->
296-2133  (113298-115135)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTGCTGATGTGAATTTATCCCAGAAGCCTCAGGTCCTGGGTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTGCTGATGTGAATTTATCCCAGAAGCCTCAGGTCCTGGGTCCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAGCAGGATGGATCTTGCGAG         GCATCAGTGTCATTTGAGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 GAAGCAGGATGGATCTTGCGAGGTA...CAGGCATCAGTGTCATTTGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACGTGACCGTGGACTTCAGCAGGGAGGAGTGGCAGCAACTGGACCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108081 ACGTGACCGTGGACTTCAGCAGGGAGGAGTGGCAGCAACTGGACCCTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGAGATGCCTGTACCGGGATGTGATGCTGGAGCTCTATAGCCATCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108131 CAGAGATGCCTGTACCGGGATGTGATGCTGGAGCTCTATAGCCATCTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGCAGTGG         GGTATCACATTCCCAACCCAGAGGTCATCTTCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 108181 CGCAGTGGGTG...CAGGGTATCACATTCCCAACCCAGAGGTCATCTTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAATGCTAAAAGAAAAGGAGCCGCGTGTGGAGGAGGCTGAAGTCTCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108491 GAATGCTAAAAGAAAAGGAGCCGCGTGTGGAGGAGGCTGAAGTCTCACAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGAGGTGTCAAG         AAAGGGAGTTTGGGCTTGAAATCCCACA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 108541 CAGAGGTGTCAAGGTG...TAGAAAGGGAGTTTGGGCTTGAAATCCCACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AAAGGAGATTTCTAAGAAAGCTTCATTTCAAAAGGATATGGTAGGTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113326 AAAGGAGATTTCTAAGAAAGCTTCATTTCAAAAGGATATGGTAGGTGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCACAAGAGATGGTTCATGGTGTTCCATTTTAGAAGAACTGAGGCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113376 TCACAAGAGATGGTTCATGGTGTTCCATTTTAGAAGAACTGAGGCTGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCTGACCGCACAAAGAAAGATGAGCAAAATCAAATTCAACCCATGAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113426 GCTGACCGCACAAAGAAAGATGAGCAAAATCAAATTCAACCCATGAGTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAGTGCTTTCTTCAACAAGAAAACATTGAACACAGAAAGCAATTGTGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113476 CAGTGCTTTCTTCAACAAGAAAACATTGAACACAGAAAGCAATTGTGAAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATAAGGACCCTGGGAAAATGATTCGCACGAGGCCCCACCTTGCTTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113526 ATAAGGACCCTGGGAAAATGATTCGCACGAGGCCCCACCTTGCTTCTTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CAGAAACAACCTCAGAAATGTTGCTTATTTACAGAAAGTTTGAAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113576 CAGAAACAACCTCAGAAATGTTGCTTATTTACAGAAAGTTTGAAGCTGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCTAGAAGTGAACGGTCAGAATGAAAGCAATGACACAGAACAGCTTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113626 CCTAGAAGTGAACGGTCAGAATGAAAGCAATGACACAGAACAGCTTGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACGTTGTTGGGTCTGGTCAGCTATTCAGCCATAGCTCTTCTGATGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113676 ACGTTGTTGGGTCTGGTCAGCTATTCAGCCATAGCTCTTCTGATGCCTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AGCAAGAATATTCATACAGGAGAGACATTTTGCAAAGGTAACCAGTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113726 AGCAAGAATATTCATACAGGAGAGACATTTTGCAAAGGTAACCAGTGTAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AAAAGTCTGTGGCCATAAACAGTCACTCAAGCAACATCAAATTCATACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113776 AAAAGTCTGTGGCCATAAACAGTCACTCAAGCAACATCAAATTCATACTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AGAAGAAACCAGATGGATGTTCTGAATGTGGGGGGAGCTTCACCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113826 AGAAGAAACCAGATGGATGTTCTGAATGTGGGGGGAGCTTCACCCAGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TCACACCTCTTTGCCCAACAGAGAATTCATAGTGTAGGAAACCTCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113876 TCACACCTCTTTGCCCAACAGAGAATTCATAGTGTAGGAAACCTCCATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 ATGTGGCAAATGTGGAAAAGCCTTCATGCCACAACTAAAACTCAGTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113926 ATGTGGCAAATGTGGAAAAGCCTTCATGCCACAACTAAAACTCAGTGTAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 ATCTGACAGATCATACAGGTGATATACCCTGTATATGCAAGGAATGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113976 ATCTGACAGATCATACAGGTGATATACCCTGTATATGCAAGGAATGTGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AAGGTCTTTATTCAGAGATCAGAATTGCTTACGCACCAGAAAACACACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114026 AAGGTCTTTATTCAGAGATCAGAATTGCTTACGCACCAGAAAACACACAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TAGAAAGAAGCCCTATAAATGCCATGACTGTGGAAAAGCCTTTTTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114076 TAGAAAGAAGCCCTATAAATGCCATGACTGTGGAAAAGCCTTTTTCCAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TGTTATCTCTCTTCAGACATCAGAGAACTCACAGTAGAGAAAAACTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114126 TGTTATCTCTCTTCAGACATCAGAGAACTCACAGTAGAGAAAAACTCTAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GAATGCAGTGAATGTGGCAAAGGCTTCTCCCAAAACTCAACCCTCATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114176 GAATGCAGTGAATGTGGCAAAGGCTTCTCCCAAAACTCAACCCTCATTAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 ACATCAGAAAATTCATACTGGTGAGAGACAGTATGCATGCAGTGAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114226 ACATCAGAAAATTCATACTGGTGAGAGACAGTATGCATGCAGTGAATGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 GGAAAGCCTTTACCCAGAAGTCAACACTCAGCTTGCACCAGAGAATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114276 GGAAAGCCTTTACCCAGAAGTCAACACTCAGCTTGCACCAGAGAATCCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 TCAGGGCAGAAGTCCTATGTGTGTATCGAATGCGGGCAGGCCTTCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114326 TCAGGGCAGAAGTCCTATGTGTGTATCGAATGCGGGCAGGCCTTCATCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GAAGGCACACCTGATTGTCCATCAAAGAAGCCACACAGGAGAAAAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114376 GAAGGCACACCTGATTGTCCATCAAAGAAGCCACACAGGAGAAAAACCTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 ATCAGTGCCACAACTGTGGGAAATCCTTCATTTCCAAGTCACAGCTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114426 ATCAGTGCCACAACTGTGGGAAATCCTTCATTTCCAAGTCACAGCTTGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 ATACATCATCGAATTCATACAGGGGAGAAACCTTATGAATGCAGTGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114476 ATACATCATCGAATTCATACAGGGGAGAAACCTTATGAATGCAGTGACTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 TGGAAAAACCTTCACCCAAAAGTCACACCTGAATATACACCAGAAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114526 TGGAAAAACCTTCACCCAAAAGTCACACCTGAATATACACCAGAAAATTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 ATACTGGAGAAAGACACCATGTATGCAGTGAATGCGGGAAAGCCTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114576 ATACTGGAGAAAGACACCATGTATGCAGTGAATGCGGGAAAGCCTTCAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 CAGAAGTCAATACTCAGCATGCATCAGAGAATTCACACCGGAGAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114626 CAGAAGTCAATACTCAGCATGCATCAGAGAATTCACACCGGAGAGAAGCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 TTACAAATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTTCACTTCTAAGTCTCAATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114676 TTACAAATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTTCACTTCTAAGTCTCAATTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 AAGAGCATCAGCGAATTCACACGGGTGAGAAACCCTATGTGTGCACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114726 AAGAGCATCAGCGAATTCACACGGGTGAGAAACCCTATGTGTGCACTGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 TGTGGGAAGGCCTTCAACGGCAGGTCAAATTTCCATAAACATCAAATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114776 TGTGGGAAGGCCTTCAACGGCAGGTCAAATTTCCATAAACATCAAATAAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 TCACACTAGAGAGAGGCCTTTTGTCTGTTACAAATGTGGGAAGGCTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114826 TCACACTAGAGAGAGGCCTTTTGTCTGTTACAAATGTGGGAAGGCTTTTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 TCCAGAAATCAGAGTTGATTACCCATCAAAGAACTCACATGGGAGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114876 TCCAGAAATCAGAGTTGATTACCCATCAAAGAACTCACATGGGAGAGAAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1924 CCCTATGAATGCCTTGACTGTGGGAAATCGTTCAGTAAGAAACCACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114926 CCCTATGAATGCCTTGACTGTGGGAAATCGTTCAGTAAGAAACCACAACT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1974 CAAGGTGCATCAGCGAATTCACACGGGAGAAAGACCTTATGTGTGTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114976 CAAGGTGCATCAGCGAATTCACACGGGAGAAAGACCTTATGTGTGTTCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2024 AATGTGGAAAGGCCTTCAACAACAGGTCAAACTTCAATAAACACCAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115026 AATGTGGAAAGGCCTTCAACAACAGGTCAAACTTCAATAAACACCAAACA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2074 ACTCATACCAGAGACAAATCTTACAAATGCAGTTATTCTGTGAAAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115076 ACTCATACCAGAGACAAATCTTACAAATGCAGTTATTCTGTGAAAGGCTT

   2150     .    :
   2124 TACCAAGCAA
        ||||||||||
 115126 TACCAAGCAA