seq1 = pF1KB6196.tfa, 2118 bp
seq2 = pF1KB6196/gi568815585r_71375141.tfa (gi568815585r:71375141_71966769), 591629 bp

>pF1KB6196 2118
>gi568815585r:71375141_71966769 (Chr13)

(complement)

1-848  (100001-100848)   100% ->
849-964  (284860-284975)   100% ->
965-1126  (336053-336214)   100% ->
1127-1299  (393758-393930)   100% ->
1300-1435  (406815-406950)   100% ->
1436-1570  (409612-409746)   100% ->
1571-1722  (477622-477773)   100% ->
1723-1870  (487454-487601)   100% ->
1871-2014  (490921-491064)   100% ->
2015-2083  (491561-491629)   100% ->
2084-2118  (526078-526112)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGTGCCGGCGGCTTTGATCCCTCCGACCCAGCTGGTCCCCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGTGCCGGCGGCTTTGATCCCTCCGACCCAGCTGGTCCCCCCTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCCCCAATCTCCACGTCTGCTTCCTCCTCTGGCACCACCACCTCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCCCCAATCTCCACGTCTGCTTCCTCCTCTGGCACCACCACCTCCACCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTCGGCGACTTCGTCTCCGGCTCCTTCCATCGGACCCCCGGCGTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTCGGCGACTTCGTCTCCGGCTCCTTCCATCGGACCCCCGGCGTCCTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGCCAACTCTGTTCCGCCCGGAGCCCATCGCTTCGGCGGCGGCGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGCCAACTCTGTTCCGCCCGGAGCCCATCGCTTCGGCGGCGGCGGCGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCCACAGTCACCTCTACCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCCACAGTCACCTCTACCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGGCGGCGGCAGCAGCGGCAACGGAGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGGCGGCGGCAGCAGCGGCAACGGAGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGCGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCAGCAACTGCAACCCCAACCTGGCGGCCGCGAGCAACGGCAGCGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCAGCAACTGCAACCCCAACCTGGCGGCCGCGAGCAACGGCAGCGGCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGCGGCGGCGGCATCAGCGCTGGCGGCGGCGTCGCTTCCAGCACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGGCGGCGGCGGCATCAGCGCTGGCGGCGGCGTCGCTTCCAGCACCCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCAACGCCAGCACCGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCAACGCCAGCACCGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCAGCAGTAGTAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCTGCGGCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCAGCAGTAGTAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCAGCTGCGGCCCCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCCCGGGAAACCCGTGTACTCAACCCCGTCCCCAGTGGAAAACACCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCCCGGGAAACCCGTGTACTCAACCCCGTCCCCAGTGGAAAACACCCCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGAATAATGAGTGCAAAATGGTGGATCTGAGGGGGGCCAAAGTGGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGAATAATGAGTGCAAAATGGTGGATCTGAGGGGGGCCAAAGTGGCTTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCACGGTGGAGGGCTGCGAGCTGATCTGCCTGCCCCAGGCTTTCGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCACGGTGGAGGGCTGCGAGCTGATCTGCCTGCCCCAGGCTTTCGACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTTCCTGAAGCACTTGGTGGGGGGCTTGCATACGGTCTACACCAAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTTCCTGAAGCACTTGGTGGGGGGCTTGCATACGGTCTACACCAAGCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCGGCTGGAGATCACGCCGGTGGTGTGCAATGTGGAACAAGTTCGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGCGGCTGGAGATCACGCCGGTGGTGTGCAATGTGGAACAAGTTCGCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGAGGGGACTGGGCGCCATCCAGCCAGGAGTGAACCGCTGCAAACTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGAGGGGACTGGGCGCCATCCAGCCAGGAGTGAACCGCTGCAAACTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTCCAGGAAGGACTTCGAGACCCTCTACAATGACTGCACCAACGCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100801 CTCCAGGAAGGACTTCGAGACCCTCTACAATGACTGCACCAACGCAAGGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    849        TTCTAGACCTGGAAGGCCTCCTAAGAGGACTCAAAGTGTCACC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 G...CAGTTCTAGACCTGGAAGGCCTCCTAAGAGGACTCAAAGTGTCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCCCCAGAGAACTCTCACATCATGCCGCATTCTGTCCCTGGTCTCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 284903 TCCCCAGAGAACTCTCACATCATGCCGCATTCTGTCCCTGGTCTCATGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TCCTGGGATAATTCCACCAACAG         GTCTGACAGCAGCCGCTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 284953 TCCTGGGATAATTCCACCAACAGGTA...AAGGTCTGACAGCAGCCGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 CAGCAGCTGCTGCTGCTACCAATGCAGCTATTGCTGAAGCAATGAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 336071 CAGCAGCTGCTGCTGCTACCAATGCAGCTATTGCTGAAGCAATGAAGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 AAAAAAATCAAATTAGAAGCCATGAGCAACTATCATGCCAGTAATAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 336121 AAAAAAATCAAATTAGAAGCCATGAGCAACTATCATGCCAGTAATAACCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 ACATGGAGCAGACTCTGAAAACGGGGACATGAATTCAAGTGTCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 336171 ACATGGAGCAGACTCTGAAAACGGGGACATGAATTCAAGTGTCGGTA...

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1127    GACTGGAACTTCCTTTTATGATGATGCCCCACCCTCTAATTCCTGTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 393755 TAGGACTGGAACTTCCTTTTATGATGATGCCCCACCCTCTAATTCCTGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AGCCTACCTCCAGCATCTGTCACCATGGCAATGAGCCAGATGAACCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 393805 AGCCTACCTCCAGCATCTGTCACCATGGCAATGAGCCAGATGAACCACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CAGCACCATTGCAAATATGGCAGCAGCAGCACAAGTTCAGAGTCCCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 393855 CAGCACCATTGCAAATATGGCAGCAGCAGCACAAGTTCAGAGTCCCCCAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 CCAGAGTTGAGACATCAGTTATTAAG         GAGCGTGTTCCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 393905 CCAGAGTTGAGACATCAGTTATTAAGGTA...CAGGAGCGTGTTCCTGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 AGCCCCTCACCTGCCCCCTCTCTGGAGGAGGGGAGAAGGCCTGGCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 406830 AGCCCCTCACCTGCCCCCTCTCTGGAGGAGGGGAGAAGGCCTGGCAGTCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CCCATCATCACATCGCAGCAGCAGCGTGTCCAGCTCCCCTGCTCGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 406880 CCCATCATCACATCGCAGCAGCAGCGTGTCCAGCTCCCCTGCTCGGACTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 AGAGCTCTTCTGACAGAATCC         CGGTCCATCAGAATGGGTTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 406930 AGAGCTCTTCTGACAGAATCCGTA...TAGCGGTCCATCAGAATGGGTTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 TCCATGAACCAGATGCTGATGGGCTTATCACCAAATGTACTTCCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 409632 TCCATGAACCAGATGCTGATGGGCTTATCACCAAATGTACTTCCTGGGCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CAAAGAGGGAGATTTGGCCGGTCATGACATGGGACATGAGTCAAAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 409682 CAAAGAGGGAGATTTGGCCGGTCATGACATGGGACATGAGTCAAAAAGGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 TGCATATTGAAAAAG         ATGAGACCCCGCTTTCTACACCAACC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 409732 TGCATATTGAAAAAGGTA...CAGATGAGACCCCGCTTTCTACACCAACC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GCAAGAGACAGCCTTGACAAACTCTCTCTAACTGGGCATGGACAACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 477648 GCAAGAGACAGCCTTGACAAACTCTCTCTAACTGGGCATGGACAACCACT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 GCCTCCAGGTTTTCCATCTCCTTTTCTGTTTCCTGATGGACTGTCTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 477698 GCCTCCAGGTTTTCCATCTCCTTTTCTGTTTCCTGATGGACTGTCTTCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 TCGAGACTCTTCTGACTAACATACAG         GGGCTGTTGAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 477748 TCGAGACTCTTCTGACTAACATACAGGTA...CAGGGGCTGTTGAAAGTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GCCATAGATAATGCCAGAGCTCAAGAGAAACAGGTCCAACTGGAAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 487469 GCCATAGATAATGCCAGAGCTCAAGAGAAACAGGTCCAACTGGAAAAAAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 TGAGCTGAAGATGGATTTTTTAAGGGAAAGAGAACTAAGGGAAACACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 487519 TGAGCTGAAGATGGATTTTTTAAGGGAAAGAGAACTAAGGGAAACACTTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 AGAAGCAGTTGGCTATGGAACAAAAGAATAGAG         CCATAGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 487569 AGAAGCAGTTGGCTATGGAACAAAAGAATAGAGGTA...TAGCCATAGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 CAAAAGAGGCTAAAGAAGGAGAAGAAGGCAAAGAGAAAATTGCAGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 490929 CAAAAGAGGCTAAAGAAGGAGAAGAAGGCAAAGAGAAAATTGCAGGAAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 ACTTGAGTTTGAGACGAAACGGCGTGAACAAGCAGAACAGACGCTAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 490979 ACTTGAGTTTGAGACGAAACGGCGTGAACAAGCAGAACAGACGCTAAAAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 AGGCAGCTTCAACAGATAGTCTCAGGGTCTTAAATG         ACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 491029 AGGCAGCTTCAACAGATAGTCTCAGGGTCTTAAATGGTA...TAGACTCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 CTGACCCCAGAGATAGAGGCTGACCGCAGTGGCGGCAGAACAGATGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 491566 CTGACCCCAGAGATAGAGGCTGACCGCAGTGGCGGCAGAACAGATGCTGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 AAGGACAATACAAG         ATGGAAGACTGTATTTGAAAACTACTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 491616 AAGGACAATACAAGGTA...TAGATGGAAGACTGTATTTGAAAACTACTG

   2200     .
   2111 TCATGTAC
        ||||||||
 526105 TCATGTAC