seq1 = pF1KB6195.tfa, 1989 bp
seq2 = pF1KB6195/gi568815575r_129966724.tfa (gi568815575r:129966724_130181330), 214607 bp

>pF1KB6195 1989
>gi568815575r:129966724_130181330 (ChrX)

(complement)

1-75  (100001-100075)   100% ->
76-247  (106579-106750)   100% ->
248-340  (107190-107282)   100% ->
341-532  (108914-109105)   100% ->
533-616  (109912-109995)   100% ->
617-809  (110099-110291)   100% ->
810-1187  (111654-112031)   100% ->
1188-1989  (113806-114607)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTATTACCCTACAGCCCAGTGACCTGATCTTTGAGTTCGCAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTATTACCCTACAGCCCAGTGACCTGATCTTTGAGTTCGCAAGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGATGGATGATGATATCCACCAG         CTGGAAGACCCCTCTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100051 CGGGATGGATGATGATATCCACCAGGTA...TAGCTGGAAGACCCCTCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTTCCCAGCTGTGATCGTGGAGCAGGTACCCTACCCTGATTTACTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106595 TGTTCCCAGCTGTGATCGTGGAGCAGGTACCCTACCCTGATTTACTGCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGTACTCGGGACTGGAGTTGGACGACGTTCACAATGGCATCATAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106645 CTGTACTCGGGACTGGAGTTGGACGACGTTCACAATGGCATCATAACAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGGGACCTTGTGCATGACGCAGGATCAGATCCTGGAAGGCAGTTTTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106695 CGGGACCTTGTGCATGACGCAGGATCAGATCCTGGAAGGCAGTTTTTTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGACAG         ATGACAATGAGGCCACCTCGCACACCATGTCAACC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106745 TGACAGGTC...CAGATGACAATGAGGCCACCTCGCACACCATGTCAACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCGGAAGTCTTACTCAATATGGAGTCTCCCAGCGATATCCTGGATGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107225 GCGGAAGTCTTACTCAATATGGAGTCTCCCAGCGATATCCTGGATGAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAGATCT         TCAGTACCTCCGAAATGCTTCCAGACTCGGACC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 107275 GCAGATCTGTA...CAGTCAGTACCTCCGAAATGCTTCCAGACTCGGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTGCACCAGCTGTCACTCTGCCCAACTACCTGTTTCCTGCCTCTGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108947 CTGCACCAGCTGTCACTCTGCCCAACTACCTGTTTCCTGCCTCTGAGCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GATGCCCTGAACAGGGCGGGTGACACTAGTGACCAGGAGGGGCATTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108997 GATGCCCTGAACAGGGCGGGTGACACTAGTGACCAGGAGGGGCATTCTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGAGGAGAAGGCCTCCAGAGAGGAAAGTGCCAAGAAGACTGGGAAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109047 GGAGGAGAAGGCCTCCAGAGAGGAAAGTGCCAAGAAGACTGGGAAATCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGAAGAGAA         TCCGGAAGACCAAGGGCAACCGAAGTACCTCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 109097 AGAAGAGAAGTA...TAGTCCGGAAGACCAAGGGCAACCGAAGTACCTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCTGTCACTGACCCCAGCATCCCCATTAGGAAGAAATCAAAGGATGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109944 CCTGTCACTGACCCCAGCATCCCCATTAGGAAGAAATCAAAGGATGGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AG         GCAGCACCATCTATCTGTGGGAGTTCCTCCTGGCTCTTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109994 AGGTA...CAGGCAGCACCATCTATCTGTGGGAGTTCCTCCTGGCTCTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGCAAGACAGAAACACCTGTCCCAAGTACATCAAGTGGACCCAGCGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110138 TGCAAGACAGAAACACCTGTCCCAAGTACATCAAGTGGACCCAGCGAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAAGGCATCTTCAAACTGGTGGACTCCAAAGCTGTGTCCAAGCTGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110188 AAAGGCATCTTCAAACTGGTGGACTCCAAAGCTGTGTCCAAGCTGTGGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAAGCAGAAAAACAAGCCTGACATGAACTATGAGACAATGGGGCGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110238 GAAGCAGAAAAACAAGCCTGACATGAACTATGAGACAATGGGGCGGGCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TAAG         ATACTACTACCAAAGAGGCATACTGGCCAAAGTGGAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110288 TAAGGTA...TAGATACTACTACCAAAGAGGCATACTGGCCAAAGTGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGGCAGAGGCTGGTGTACCAGTTTAAGGAGATGCCCAAGGACCTGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111691 GGGCAGAGGCTGGTGTACCAGTTTAAGGAGATGCCCAAGGACCTGGTGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CATTGAAGATGAGGATGAGAGCAGCGAAGCCACAGCAGCCCCACCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111741 CATTGAAGATGAGGATGAGAGCAGCGAAGCCACAGCAGCCCCACCTCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCTCCACGGCCTCTGTGGCCTCTGCCAGTACCACCCGGCGAACCAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111791 CCTCCACGGCCTCTGTGGCCTCTGCCAGTACCACCCGGCGAACCAGCTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AGGGTCTCATCCAGATCTGCCCCCCAGGGCAAGGGCAGCTCTTCTTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111841 AGGGTCTCATCCAGATCTGCCCCCCAGGGCAAGGGCAGCTCTTCTTGGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GAAGCCAAAAATTCAGCATGTCGGTCTCCAGCCATCTGCGAGTCTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111891 GAAGCCAAAAATTCAGCATGTCGGTCTCCAGCCATCTGCGAGTCTGGAAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGGGACCGTCGCTAGACGAGGAGATCCCCACTACCTCCACCATGCTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111941 TGGGACCGTCGCTAGACGAGGAGATCCCCACTACCTCCACCATGCTCGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 TCTCCAGCAGAGGGCCAGGTCAAGCTCACCAAAGCTGTGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 111991 TCTCCAGCAGAGGGCCAGGTCAAGCTCACCAAAGCTGTGAGGTA...CAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TGCATCTTCAGTGCCCAGCAACATCCACCTAGGAGTGGCCCCCGTGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113806 TGCATCTTCAGTGCCCAGCAACATCCACCTAGGAGTGGCCCCCGTGGGGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CGGGCTCGGCCCTGACCCTGCAGACGATCCCACTGACCACGGTGCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113856 CGGGCTCGGCCCTGACCCTGCAGACGATCCCACTGACCACGGTGCTGACC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 AATGGGCCTCCTGCCAGTACTACTGCTCCCACTCAGCTCGTTCTCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113906 AATGGGCCTCCTGCCAGTACTACTGCTCCCACTCAGCTCGTTCTCCAGAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TGTTCCAGCGGCCTCTACTTTCAAGGACACCTTCACTTTGCAGGCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113956 TGTTCCAGCGGCCTCTACTTTCAAGGACACCTTCACTTTGCAGGCCTCTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TCCCCCTGAACGCCAGTTTCCAAGACAGCCAGGTGGCAGCCCCAGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114006 TCCCCCTGAACGCCAGTTTCCAAGACAGCCAGGTGGCAGCCCCAGGGGCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CCACTGATTCTCAGTGGCCTCCCCCAACTTCTGGCTGGGGCCAACCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114056 CCACTGATTCTCAGTGGCCTCCCCCAACTTCTGGCTGGGGCCAACCGTCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 GACCAACCCGGCGCCACCCACGGTCACAGGGGCTGGACCAGCAGGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114106 GACCAACCCGGCGCCACCCACGGTCACAGGGGCTGGACCAGCAGGGCCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 GCTCTCAGCCCCCTGGGACTGTCATTGCTGCCTTCATCAGGACTTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114156 GCTCTCAGCCCCCTGGGACTGTCATTGCTGCCTTCATCAGGACTTCTGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 ACTACAGCAGCCCCTAGGGTCAAGGAGGGGCCACTGAGGTCCTCCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114206 ACTACAGCAGCCCCTAGGGTCAAGGAGGGGCCACTGAGGTCCTCCTCCTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 TGTTCAGGGTATGGTGACGGGGGCCCCCATGGAGGGGCTGCTGGTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114256 TGTTCAGGGTATGGTGACGGGGGCCCCCATGGAGGGGCTGCTGGTTCCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 AAGAGACCCTGAGGGAGCTCCTGAGAGATCAGGCTCATCTTCAGCCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114306 AAGAGACCCTGAGGGAGCTCCTGAGAGATCAGGCTCATCTTCAGCCACTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 CCAACCCAGGTGGTTTCCAGGGGTTCCCACAATCCGAGCCTTCTGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114356 CCAACCCAGGTGGTTTCCAGGGGTTCCCACAATCCGAGCCTTCTGGGCAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 CCAGACTTTGTCTCCTCCCAGCCGCCCCACTGTTGGGCTGACCCCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114406 CCAGACTTTGTCTCCTCCCAGCCGCCCCACTGTTGGGCTGACCCCAGTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 CTGAACTTGAGCTCTCCTCAGGCTCAGGGTCCCTGCTGATGGCTGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114456 CTGAACTTGAGCTCTCCTCAGGCTCAGGGTCCCTGCTGATGGCTGAGCCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 AGTGTGACCACATCTGGGAGCCTTCTGACAAGATCCCCCACCCCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114506 AGTGTGACCACATCTGGGAGCCTTCTGACAAGATCCCCCACCCCAGCCCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 TTTCTCCCCATTCAACCCTACTTCCCTCATTAAGATGGAGCCCCATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114556 TTTCTCCCCATTCAACCCTACTTCCCTCATTAAGATGGAGCCCCATGACA

   2050 
   1988 TA
        ||
 114606 TA