seq1 = pF1KB6194.tfa, 2118 bp
seq2 = pF1KB6194/gi568815588r_6328210.tfa (gi568815588r:6328210_6615135), 286926 bp

>pF1KB6194 2118
>gi568815588r:6328210_6615135 (Chr10)

(complement)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-318  (103942-104141)   100% ->
319-379  (107640-107700)   100% ->
380-542  (116578-116740)   100% ->
543-574  (117885-117916)   100% ->
575-660  (118016-118101)   100% ->
661-790  (123324-123453)   100% ->
791-900  (128992-129101)   100% ->
901-1018  (129867-129984)   100% ->
1019-1179  (131536-131696)   100% ->
1180-1353  (135971-136144)   100% ->
1354-1445  (150732-150823)   98% ->
1446-1508  (152771-152833)   100% ->
1509-1647  (158324-158462)   99% ->
1648-1836  (173055-173243)   100% ->
1837-1965  (184198-184326)   99% ->
1966-2118  (186774-186926)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGCCATTTCTTCGGATTGGCTTGTCCAACTTTGACTGCGGGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGCCATTTCTTCGGATTGGCTTGTCCAACTTTGACTGCGGGTCCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGTCTTGTCAGGGCGAGGCTGTTAACCCTTACTGTGCTGTGCTCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGTCTTGTCAGGGCGAGGCTGTTAACCCTTACTGTGCTGTGCTCGTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGAGTATGTCGAATCAG         AGAACGGGCAGATGTATATCCAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100101 AAGAGTATGTCGAATCAGGTA...TAGAGAACGGGCAGATGTATATCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAAAGCCTACCATGTACCCACCCTGGGACAGCACTTTTGATGCCCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103965 AAAAAGCCTACCATGTACCCACCCTGGGACAGCACTTTTGATGCCCATAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACAAGGGAAGAGTCATGCAGATCATTGTGAAAGGCAAAAACGTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104015 CAACAAGGGAAGAGTCATGCAGATCATTGTGAAAGGCAAAAACGTGGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCATCTCTGAAACCACCGTGGAGCTCTACTCGCTGGCTGAGAGGTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104065 TCATCTCTGAAACCACCGTGGAGCTCTACTCGCTGGCTGAGAGGTGCAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGAACAACGGGAAGACAGAAATATGG         TTAGAGCTGAAACC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 104115 AAGAACAACGGGAAGACAGAAATATGGGTA...CAGTTAGAGCTGAAACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCAAGGCCGAATGCTAATGAATGCAAGATACTTTCTGGAAATGAGTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 107654 TCAAGGCCGAATGCTAATGAATGCAAGATACTTTCTGGAAATGAGTGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    380       ACACAAAGGACATGAATGAATTTGAGACGGAAGGCTTCTTTGCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107704 ...TAGACACAAAGGACATGAATGAATTTGAGACGGAAGGCTTCTTTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTGCATCAGCGCCGGGGTGCCATCAAGCAGGCAAAGGTCCACCACGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116622 TTGCATCAGCGCCGGGGTGCCATCAAGCAGGCAAAGGTCCACCACGTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTGCCACGAGTTCACTGCCACCTTCTTCCCACAGCCCACATTTTGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116672 GTGCCACGAGTTCACTGCCACCTTCTTCCCACAGCCCACATTTTGCTCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCTGCCACGAGTTTGTCTG         GGGCCTGAACAAACAGGGCTAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 116722 TCTGCCACGAGTTTGTCTGGTA...CAGGGGCCTGAACAAACAGGGCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGTGCCGAC         AATGCAATGCAGCAATTCACAAGAAGTGTAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 117907 CAGTGCCGACGTA...CAGAATGCAATGCAGCAATTCACAAGAAGTGTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGATAAAGTTATAGCAAAGTGCACAGGATCAGCTATCAATAGCCGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118047 TGATAAAGTTATAGCAAAGTGCACAGGATCAGCTATCAATAGCCGAGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCATG         TTCCACAAGGAGAGATTCAAAATTGACATGCCACAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118097 CCATGGTG...CAGTTCCACAAGGAGAGATTCAAAATTGACATGCCACAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AGATTTAAAGTCTACAATTACAAGAGCCCGACCTTCTGTGAACACTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123360 AGATTTAAAGTCTACAATTACAAGAGCCCGACCTTCTGTGAACACTGTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GACCCTGCTGTGGGGACTGGCACGGCAAGGACTCAAGTGTGATG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 123410 GACCCTGCTGTGGGGACTGGCACGGCAAGGACTCAAGTGTGATGGTG...

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    791    CATGTGGCATGAATGTGCATCATAGATGCCAGACAAAGGTGGCCAAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128989 CAGCATGTGGCATGAATGTGCATCATAGATGCCAGACAAAGGTGGCCAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CTTTGTGGCATAAACCAGAAGCTAATGGCTGAAGCGCTGGCCATGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129039 CTTTGTGGCATAAACCAGAAGCTAATGGCTGAAGCGCTGGCCATGATTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GAGCACTCAACAG         GCTCGCTGCTTAAGAGATACTGAACAGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 129089 GAGCACTCAACAGGTA...CAGGCTCGCTGCTTAAGAGATACTGAACAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TCTTCAGAGAAGGTCCGGTTGAAATTGGTCTCCCATGCTCCATCAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129895 TCTTCAGAGAAGGTCCGGTTGAAATTGGTCTCCCATGCTCCATCAAAAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAAGCAAGGCCGCCATGTTTACCGACACCGGGAAAAAGAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 129945 GAAGCAAGGCCGCCATGTTTACCGACACCGGGAAAAAGAGGTA...CAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GCCTCAGGGCATTTCCTGGGAGTCTCCGTTGGATGAGGTGGATAAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131537 GCCTCAGGGCATTTCCTGGGAGTCTCCGTTGGATGAGGTGGATAAAATGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GCCATCTTCCAGAACCTGAACTGAACAAAGAAAGACCATCTCTGCAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131587 GCCATCTTCCAGAACCTGAACTGAACAAAGAAAGACCATCTCTGCAGATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AAACTAAAAATTGAGGATTTTATCTTGCACAAAATGTTGGGGAAAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131637 AAACTAAAAATTGAGGATTTTATCTTGCACAAAATGTTGGGGAAAGGAAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TTTTGGCAAG         GTCTTCCTGGCAGAATTCAAGAAAACCAATC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 131687 TTTTGGCAAGGTA...TAGGTCTTCCTGGCAGAATTCAAGAAAACCAATC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AATTTTTCGCAATAAAGGCCTTAAAGAAAGATGTGGTCTTGATGGACGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136002 AATTTTTCGCAATAAAGGCCTTAAAGAAAGATGTGGTCTTGATGGACGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GATGTTGAGTGCACGATGGTAGAGAAGAGAGTTCTTTCCTTGGCCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136052 GATGTTGAGTGCACGATGGTAGAGAAGAGAGTTCTTTCCTTGGCCTGGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 GCATCCGTTTCTGACGCACATGTTTTGTACATTCCAGACCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 136102 GCATCCGTTTCTGACGCACATGTTTTGTACATTCCAGACCAAGGTA...C

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1354   GAAAACCTCTTTTTTGTGATGGAGTACCTCAACGGAGGGGACTTAATG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150730 AGGAAAACCTCTTTTTTGTGATGGAGTACCTCAACGGAGGGGACTTAATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 TACCACATCCAAAGCTGCCACAAGTTCGACCTTTCCAGGGCGAC      
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||>>>...
 150780 TACCACATCCAAAGCTGCCACAAGTTCGACCTTTCCAGAGCGACGTA...

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1446    GTTTTATGCTGCTGAAATCATTCTTGGTCTGCAGTTCCTTCATTCCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152768 CAGGTTTTATGCTGCTGAAATCATTCTTGGTCTGCAGTTCCTTCATTCCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 AAGGAATAGTCTACAG         GGACCTGAAGCTAGATAACATCCTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 152818 AAGGAATAGTCTACAGGTA...CAGGGACCTGAAGCTAGATAACATCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 TTAGACAAAGATGGACATATCAAGATTGCGGATTTTGGAATGTGCAAGGA
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 158349 TTAGACAAAGATGGACATATCAAGATCGCGGATTTTGGAATGTGCAAGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GAACATGTTAGGAGATGCCAAGACGAATACCTTCTGTGGGACACCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158399 GAACATGTTAGGAGATGCCAAGACGAATACCTTCTGTGGGACACCTGACT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 ACATCGCCCCAGAG         ATCTTGCTGGGTCAGAAATACAACCAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 158449 ACATCGCCCCAGAGGTA...CAGATCTTGCTGGGTCAGAAATACAACCAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 TCTGTGGACTGGTGGTCCTTCGGGGTTCTCCTTTATGAAATGCTGATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173082 TCTGTGGACTGGTGGTCCTTCGGGGTTCTCCTTTATGAAATGCTGATTGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 TCAGTCGCCTTTCCACGGGCAGGATGAGGAGGAGCTCTTCCACTCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173132 TCAGTCGCCTTTCCACGGGCAGGATGAGGAGGAGCTCTTCCACTCCATCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 GCATGGACAATCCCTTTTACCCACGGTGGCTGGAGAAGGAAGCAAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173182 GCATGGACAATCCCTTTTACCCACGGTGGCTGGAGAAGGAAGCAAAGGAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CTTCTGGTGAAG         CTCTTCGTGAGAGAACCTGAGAAGAGGCT
        ||||||||||||>>>...>>>||||||||| |||||||||||||||||||
 173232 CTTCTGGTGAAGGTA...CAGCTCTTCGTGCGAGAACCTGAGAAGAGGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 GGGCGTGAGGGGAGACATCCGCCAGCACCCTTTGTTTCGGGAGATCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184227 GGGCGTGAGGGGAGACATCCGCCAGCACCCTTTGTTTCGGGAGATCAACT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 GGGAGGAACTTGAACGGAAGGAGATTGACCCACCGTTCCGGCCGAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184277 GGGAGGAACTTGAACGGAAGGAGATTGACCCACCGTTCCGGCCGAAAGTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966          AAATCACCATTTGACTGCAGCAATTTCGACAAAGAATTCTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184327 GTA...AAGAAATCACCATTTGACTGCAGCAATTTCGACAAAGAATTCTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 AAACGAGAAGCCCCGGCTGTCATTTGCCGACAGAGCACTGATCAACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186815 AAACGAGAAGCCCCGGCTGTCATTTGCCGACAGAGCACTGATCAACAGCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 TGGACCAGAATATGTTCAGGAACTTTTCCTTCATGAACCCCGGGATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186865 TGGACCAGAATATGTTCAGGAACTTTTCCTTCATGAACCCCGGGATGGAG

   2250     .    :
   2107 CGGCTGATATCC
        ||||||||||||
 186915 CGGCTGATATCC