seq1 = pF1KB6174.tfa, 1890 bp
seq2 = pF1KB6174/gi568815580r_50171504.tfa (gi568815580r:50171504_50379992), 208489 bp

>pF1KB6174 1890
>gi568815580r:50171504_50379992 (Chr18)

(complement)

1-110  (100001-100110)   100% ->
111-225  (102789-102903)   100% ->
226-392  (102995-103161)   100% ->
393-475  (103249-103331)   100% ->
476-516  (103575-103615)   100% ->
517-663  (104012-104158)   100% ->
664-792  (104265-104393)   100% ->
793-867  (104549-104623)   98% ->
868-984  (104748-104864)   100% ->
985-1053  (104948-105016)   100% ->
1054-1221  (105640-105807)   100% ->
1222-1521  (106130-106429)   100% ->
1522-1659  (106522-106659)   100% ->
1660-1791  (107038-107169)   100% ->
1792-1853  (107255-107316)   100% ->
1854-1890  (108453-108489)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAGGACTGGCTGGACTGCCCGGCCCTGGGCCCTGGCTGGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGAGGACTGGCTGGACTGCCCGGCCCTGGGCCCTGGCTGGAAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCGAAGTCTTTCGCAAGTCAGGGGCCACCTGTGGACGCTCAGACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCGAAGTCTTTCGCAAGTCAGGGGCCACCTGTGGACGCTCAGACACCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATTACCAGAG         CCCCACAGGAGACAGGATCCGAAGCAAAGTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATTACCAGAGGTA...TAGCCCCACAGGAGACAGGATCCGAAGCAAAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGCTGACTCGATACCTGGGCCCTGCGTGTGATCTCACCCTCTTCGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102820 GAGCTGACTCGATACCTGGGCCCTGCGTGTGATCTCACCCTCTTCGACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAACAAGGCATCTTGTGCTATCCAGCCCCCAAG         GCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 102870 CAAACAAGGCATCTTGTGCTATCCAGCCCCCAAGGTA...CAGGCCCATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCGTGGCGGTTGCCAGCAAGAAGCGAAAGAAGCCTTCAAGGCCAGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103002 CCGTGGCGGTTGCCAGCAAGAAGCGAAAGAAGCCTTCAAGGCCAGCCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACTCGGAAACGTCAGGTTGGACCCCAGAGTGGTGAGGTCAGGAAGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103052 ACTCGGAAACGTCAGGTTGGACCCCAGAGTGGTGAGGTCAGGAAGGAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCGAGGGATGAGACCAAGGCTGACACTGACACAGCCCCAGCTTCATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103102 CCCGAGGGATGAGACCAAGGCTGACACTGACACAGCCCCAGCTTCATTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGCTCCTGG         GTGCTGTGAGAACTGTGGAATCAGCTTCTCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 103152 CTGCTCCTGGGTG...CAGGTGCTGTGAGAACTGTGGAATCAGCTTCTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGGGATGGCACCCAAAGGCAGCGGCTCAAAACGTTGTGCAAAGACTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103280 GGGGATGGCACCCAAAGGCAGCGGCTCAAAACGTTGTGCAAAGACTGTCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AG         CACAGAGAATTGCCTTCAACCGGGAACAGAGAATGTTTA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103330 AGGTG...CAGCACAGAGAATTGCCTTCAACCGGGAACAGAGAATGTTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AG         CGTGTGGGCTGTGGGGAGTGTGCAGCCTGCCAGGTAACA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103614 AGGTA...CAGCGTGTGGGCTGTGGGGAGTGTGCAGCCTGCCAGGTAACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAAGACTGTGGGGCCTGCTCCACCTGCCTCCTGCAGCTGCCCCATGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104051 GAAGACTGTGGGGCCTGCTCCACCTGCCTCCTGCAGCTGCCCCATGATGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGCATCGGGGCTGTTCTGCAAGTGTGAACGGAGACGCTGCCTCCGGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104101 GGCATCGGGGCTGTTCTGCAAGTGTGAACGGAGACGCTGCCTCCGGATTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGAAAGG         AGCCGAGGGTGTGGAGTATGCCGGGGCTGTCAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104151 TGGAAAGGGTG...CAGAGCCGAGGGTGTGGAGTATGCCGGGGCTGTCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ACCCAAGAGGATTGTGGCCATTGCCCCATCTGCCTTCGCCCTCCCCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104298 ACCCAAGAGGATTGTGGCCATTGCCCCATCTGCCTTCGCCCTCCCCGCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGGTCTCAGGCGCCAGTGGAAATGTGTCCAGCGACGTTGCCTACGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 104348 TGGTCTCAGGCGCCAGTGGAAATGTGTCCAGCGACGTTGCCTACGGGTG.

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    793      CACCTTGCTCACCGTCTGCGTCGCCGTCATCAGAGATGTCAGCGA
        ..>>>|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 104398 ..CAGCACCTTGCTCACCGCCTGCGTCGCCGTCATCAGAGATGTCAGCGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CGCACTCCCCTGGCTGTGGCTCCCCCAACT         GGTAAACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 104594 CGCACTCCCCTGGCTGTGGCTCCCCCAACTGTG...CAGGGTAAACATGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CCGCCGCAAGGGAGGCTGTGACTCCAAGATGGCTGCCAGGCGGCGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104759 CCGCCGCAAGGGAGGCTGTGACTCCAAGATGGCTGCCAGGCGGCGCCCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GAGCCCAGCCACTGCCTCCACCACCCCCATCACAGTCCCCAGAGCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104809 GAGCCCAGCCACTGCCTCCACCACCCCCATCACAGTCCCCAGAGCCCACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAGCCG         CACCCCAGAGCCCTGGCCCCCTCGCCACCTGCCGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104859 GAGCCGGTG...CAGCACCCCAGAGCCCTGGCCCCCTCGCCACCTGCCGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GTTCATCTATTACTGTGTAGACGAGGACGAGCTA         CAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 104983 GTTCATCTATTACTGTGTAGACGAGGACGAGCTAGTG...CAGCAGCCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 ACACGAACCGCCGGCAGAACCGCAAGTGCGGGGCCTGTGCAGCCTGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105647 ACACGAACCGCCGGCAGAACCGCAAGTGCGGGGCCTGTGCAGCCTGCCTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CGGCGGATGGACTGTGGCCGCTGCGACTTCTGCTGCGACAAGCCCAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105697 CGGCGGATGGACTGTGGCCGCTGCGACTTCTGCTGCGACAAGCCCAAATT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CGGGGGCAGCAACCAGAAGCGCCAGAAGTGTCGTTGGCGCCAATGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105747 CGGGGGCAGCAACCAGAAGCGCCAGAAGTGTCGTTGGCGCCAATGCCTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 AGTTTGCCATG         AAGCGGCTGCTGCCCAGTGTCTGGTCAGAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105797 AGTTTGCCATGGTG...TAGAAGCGGCTGCTGCCCAGTGTCTGGTCAGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TCTGAGGATGGGGCAGGATCGCCCCCACCTTACCGTCGTCGAAAGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106160 TCTGAGGATGGGGCAGGATCGCCCCCACCTTACCGTCGTCGAAAGAGGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CAGCTCTGCCCGACGGCACCATCTTGGCCCTACCTTGAAGCCCACCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106210 CAGCTCTGCCCGACGGCACCATCTTGGCCCTACCTTGAAGCCCACCTTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CTACACGCACAGCCCAACCAGACCATACCCAGGCTCCAACGAAGCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106260 CTACACGCACAGCCCAACCAGACCATACCCAGGCTCCAACGAAGCAGGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GCAGGTGGTGGCTTTGTGCTGCCCCCGCCTGGCACTGACCTTGTGTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106310 GCAGGTGGTGGCTTTGTGCTGCCCCCGCCTGGCACTGACCTTGTGTTTTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 ACGGGAAGGCGCAAGCAGTCCTGTGCAGGTGCCGGGCCCTGTTGCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106360 ACGGGAAGGCGCAAGCAGTCCTGTGCAGGTGCCGGGCCCTGTTGCAGCTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CCACAGAAGCCCTGTTGCAG         GAGGCCCAGTGCTCTGGCCTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 106410 CCACAGAAGCCCTGTTGCAGGTG...CAGGAGGCCCAGTGCTCTGGCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 AGTTGGGTTGTGGCCTTACCCCAGGTGAAGCAAGAGAAGGCGGATACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106543 AGTTGGGTTGTGGCCTTACCCCAGGTGAAGCAAGAGAAGGCGGATACCCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 GGACGAGTGGACACCAGGCACAGCTGTCCTGACTTCTCCCGTATTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106593 GGACGAGTGGACACCAGGCACAGCTGTCCTGACTTCTCCCGTATTGGTGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CTGGCTGCCCTAGCAAG         GCAGTAGACCCAGGCCTGCCTTCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 106643 CTGGCTGCCCTAGCAAGGTG...CAGGCAGTAGACCCAGGCCTGCCTTCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GTGAAGCAAGAGCCACCTGACCCAGAGGAGGACAAGGAGGAGAACAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107062 GTGAAGCAAGAGCCACCTGACCCAGAGGAGGACAAGGAGGAGAACAAGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 TGATTCTGCCTCCAAATTGGCCCCAGAGGAAGAGGCAGGAGGGGCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107112 TGATTCTGCCTCCAAATTGGCCCCAGAGGAAGAGGCAGGAGGGGCTGGCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 CACCCGTG         ATCACGGAGATTTTCAGCCTGGGTGGAACCCGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 107162 CACCCGTGGTC...TAGATCACGGAGATTTTCAGCCTGGGTGGAACCCGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TTCCGAGATACAGCAGTCTGGTTGCCAAG         GTCCAAAGACCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 107288 TTCCGAGATACAGCAGTCTGGTTGCCAAGGTG...TAGGTCCAAAGACCT

   2000     .    :    .    :    .
   1866 TAAAAAACCTGGAGCTAGAAAGCAG
        |||||||||||||||||||||||||
 108465 TAAAAAACCTGGAGCTAGAAAGCAG