Result of SIM4 for pF1KB6165

seq1 = pF1KB6165.tfa, 1944 bp
seq2 = pF1KB6165/gi568815581f_28423970.tfa (gi568815581f:28423970_28637433), 213464 bp

>pF1KB6165 1944
>gi568815581f:28423970_28637433 (Chr17)

1-123  (100001-100123)   100% ->
124-588  (100534-100998)   100% ->
589-699  (103282-103392)   100% ->
700-830  (105125-105255)   100% ->
831-927  (106780-106876)   100% ->
928-1135  (110362-110569)   100% ->
1136-1627  (110738-111229)   100% ->
1628-1944  (113148-113464)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGTCGCTACCCCCGCCGCAGTCTGACGTCACGCTGCCGGGCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGTCGCTACCCCCGCCGCAGTCTGACGTCACGCTGCCGGGCCCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGACTGGAGGGCGAGCGCCAAGGGGACCTCATGCAGGCACCGGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGACTGGAGGGCGAGCGCCAAGGGGACCTCATGCAGGCACCGGGCCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGGCTCCCCTGCCCCACAGAGT         AAGCATGCCGGCTTCAGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100101 CAGGCTCCCCTGCCCCACAGAGTGTA...CAGAAGCATGCCGGCTTCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCTCGTCATTTGTGTCCGACGGCCCTCCAGAGAGGACACCCTCACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100552 TGCTCGTCATTTGTGTCCGACGGCCCTCCAGAGAGGACACCCTCACTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCACACAGCCCCCGCATTGCGTCACCAGGGCCCGAGCAAGTCCAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100602 CCCACACAGCCCCCGCATTGCGTCACCAGGGCCCGAGCAAGTCCAGGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACTGCCCAGCCGGCCCCGGCCCTGGGCCCTTCAGGCTCTCACCCTCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100652 ACTGCCCAGCCGGCCCCGGCCCTGGGCCCTTCAGGCTCTCACCCTCAGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGTATCCTGGCTTTGGCTTTGAGGAGGCCGCAGCAAGCAGCCCTGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100702 AAGTATCCTGGCTTTGGCTTTGAGGAGGCCGCAGCAAGCAGCCCTGGGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ATTCCTCAAGGGCAGCCACGCGCCCTTCCACCCGTACAAGCGGCCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100752 ATTCCTCAAGGGCAGCCACGCGCCCTTCCACCCGTACAAGCGGCCTTTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATGAGGACGTCTTCCCAGAGGCCGAGACCACCCTGGCCCTCAAAGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100802 ATGAGGACGTCTTCCCAGAGGCCGAGACCACCCTGGCCCTCAAAGGACAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCCTTTAAGACCCCAGGGCCGCTGGAGGCCTTCGAGGAGATCCCAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100852 TCCTTTAAGACCCCAGGGCCGCTGGAGGCCTTCGAGGAGATCCCAGTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CGTGGCGGAGGCCGAGGCCTTCCTGCCTGGCTTCTCAGCAGAGGCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100902 CGTGGCGGAGGCCGAGGCCTTCCTGCCTGGCTTCTCAGCAGAGGCCTGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GTAACGGGCTCCCCTACCCCAGCCAGGAGCATGGCCCCCAAGTCCTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100952 GTAACGGGCTCCCCTACCCCAGCCAGGAGCATGGCCCCCAAGTCCTGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    589       GGTTCAGAGGTCAAAGTCAAGCCCCCAGTTCTGGAGAGTGGTGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101002 ...CAGGGTTCAGAGGTCAAAGTCAAGCCCCCAGTTCTGGAGAGTGGTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGGGATGTTCTGCTACCAGCCTCCCTTGCAGCATATGTACTGCTCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103326 TGGGATGTTCTGCTACCAGCCTCCCTTGCAGCATATGTACTGCTCCTCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGCCCCCCTTCCACCAG         TACTCGCCAGGTGGTGGCAGCTAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103376 AGCCCCCCTTCCACCAGGTG...CAGTACTCGCCAGGTGGTGGCAGCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CCCATACCCTACCTGGGCTCCTCACACTATCAGTACCAGCGAATGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105149 CCCATACCCTACCTGGGCTCCTCACACTATCAGTACCAGCGAATGGCACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCAGGCCAGCACCGATGGGCACCAGCCTCTCTTCCCAAAACCCATCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105199 CCAGGCCAGCACCGATGGGCACCAGCCTCTCTTCCCAAAACCCATCTATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCTACAG         CATCCTCATCTTCATGGCCCTTAAGAACAGTAAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105249 CCTACAGGTA...CAGCATCCTCATCTTCATGGCCCTTAAGAACAGTAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ACTGGGAGCCTTCCCGTCAGCGAGATCTACAATTTTATGACGGAGCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106814 ACTGGGAGCCTTCCCGTCAGCGAGATCTACAATTTTATGACGGAGCACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TCCTTACTTCAAG         ACAGCACCCGATGGCTGGAAGAATTCTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 106864 TCCTTACTTCAAGGTG...CAGACAGCACCCGATGGCTGGAAGAATTCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TCCGGCACAACCTATCCCTCAACAAGTGCTTCGAGAAGGTGGAGAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110390 TCCGGCACAACCTATCCCTCAACAAGTGCTTCGAGAAGGTGGAGAACAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TCAGGAAGTTCCTCCCGCAAGGGCTGCCTGTGGGCCCTCAATCCGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110440 TCAGGAAGTTCCTCCCGCAAGGGCTGCCTGTGGGCCCTCAATCCGGCCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GATCGACAAGATGCAAGAGGAGCTGCAAAAATGGAAGAGGAAAGATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110490 GATCGACAAGATGCAAGAGGAGCTGCAAAAATGGAAGAGGAAAGATCCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TTGCTGTGCGCAAAAGCATGGCCAAGCCAG         AAGAGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 110540 TTGCTGTGCGCAAAAGCATGGCCAAGCCAGGTG...CAGAAGAGCTGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 AGCCTCATTGGAGACAAGAGAGAAAAGCTGGGCTCCCCACTCCTGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110749 AGCCTCATTGGAGACAAGAGAGAAAAGCTGGGCTCCCCACTCCTGGGCTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TCCGCCCCCTGGGCTGTCCGGCTCAGGCCCCATCCGGCCCCTGGCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110799 TCCGCCCCCTGGGCTGTCCGGCTCAGGCCCCATCCGGCCCCTGGCACCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CAGCTGGCCTCTCCCCACCACTGCACTCACTCCACCCAGCTCCAGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110849 CAGCTGGCCTCTCCCCACCACTGCACTCACTCCACCCAGCTCCAGGCCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 ATTCCTGGCAAGAACCCCCTGCAGGACCTACTTATGGGGCACACACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110899 ATTCCTGGCAAGAACCCCCTGCAGGACCTACTTATGGGGCACACACCCTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CTGCTATGGGCAGACATACTTGCACCTCTCACCAGGCCTGGCCCCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110949 CTGCTATGGGCAGACATACTTGCACCTCTCACCAGGCCTGGCCCCTCCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 GACCCCCGCAGCCATTGTTCCCACAGCCGGACGGGCACCTTGAGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110999 GACCCCCGCAGCCATTGTTCCCACAGCCGGACGGGCACCTTGAGCTGCGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 GCCCAGCCAGGCACCCCCCAGGACTCGCCTCTGCCTGCCCACACCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111049 GCCCAGCCAGGCACCCCCCAGGACTCGCCTCTGCCTGCCCACACCCCACC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 CAGCCACAGTGCCAAGCTACTGGCCGAGCCTTCCCCAGCCAGGACTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111099 CAGCCACAGTGCCAAGCTACTGGCCGAGCCTTCCCCAGCCAGGACTATGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 ACGACACCCTGCTGCCAGATGGAGACCTTGGCACTGACCTGGATGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111149 ACGACACCCTGCTGCCAGATGGAGACCTTGGCACTGACCTGGATGCCATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 AATCCCTCACTCACTGACTTCGACTTCCAGG         GAAACCTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 111199 AATCCCTCACTCACTGACTTCGACTTCCAGGGTG...TAGGAAACCTGTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 GGAACAGTTGAAGGATGATAGCTTGGCCCTCGACCCCCTGGTACTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113158 GGAACAGTTGAAGGATGATAGCTTGGCCCTCGACCCCCTGGTACTGGTGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 CCTCATCCCCGACATCATCTTCGATGCCACCACCCCAGCCACCACCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113208 CCTCATCCCCGACATCATCTTCGATGCCACCACCCCAGCCACCACCTCAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 TGCTTCCCCCCTGGGCCCTGTCTGACAGAGACAGGCAGTGGGGCAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113258 TGCTTCCCCCCTGGGCCCTGTCTGACAGAGACAGGCAGTGGGGCAGGTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 CTTGGCAGCCCCGGGCAGTGGTGGCTCCGGGGCACTGGGTGACCTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113308 CTTGGCAGCCCCGGGCAGTGGTGGCTCCGGGGCACTGGGTGACCTGCACC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 TCACCACCCTCTACTCTGCCTTTATGGAGCTGGAGCCCACGCCCCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113358 TCACCACCCTCTACTCTGCCTTTATGGAGCTGGAGCCCACGCCCCCCACG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 GCCCCTGCAGGCCCCTCTGTGTACCTCAGCCCCAGCTCCAAGCCCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113408 GCCCCTGCAGGCCCCTCTGTGTACCTCAGCCCCAGCTCCAAGCCCGTGGC

   2000     .
   1938 CCTGGCA
        |||||||
 113458 CCTGGCA

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