seq1 = pF1KB6163.tfa, 1803 bp
seq2 = pF1KB6163/gi568815595r_148885864.tfa (gi568815595r:148885864_149087666), 201803 bp

>pF1KB6163 1803
>gi568815595r:148885864_149087666 (Chr3)

(complement)

1-1803  (100001-101803)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGCCGAGCGGGGCCGAGACGAGGCCCCCCATTCGGGTCACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGCCGAGCGGGGCCGAGACGAGGCCCCCCATTCGGGTCACCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGACCCCCAAGGACAAGGAGGAAATTGTGATCTGCGATCGAGCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGACCCCCAAGGACAAGGAGGAAATTGTGATCTGCGATCGAGCCTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAAGGAGTTCAAAGAGGAAATCTCCCGGAGGTTTAAGGCTCAGCAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCAAGGAGTTCAAAGAGGAAATCTCCCGGAGGTTTAAGGCTCAGCAGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCTGGTCCTGATCTTCGCAGGCAAGATCCTCAAGGATGGGGACACACT
        |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCTGGTCCTGATCTTGTCAGGCAAGATCCTCAAGGATGGGGACACACT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAACCAGCACGGAATCAAGGACGGGCTCACTGTCCATCTGGTCATCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAACCAGCACGGAATCAAGGACGGGCTCACTGTCCATCTGGTCATCAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCCTCAGAAGGCTCAAGATCCAGCTGCTGCCACTGCTTCTTCCCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCCTCAGAAGGCTCAAGATCCAGCTGCTGCCACTGCTTCTTCCCCCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACACCTGACCCTGCCTCAGCACCCTCCACCACGCCTGCTTCACCCGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 100301 ACACCTGACCCTGCCTCAGCACCCTCCACCACGCCTGCTTCACCCACCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCTGCCCAGCCCTCCACCTCTGGCAGTGCCTCTTCAGATGCTGGCAGTG
        |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
 100351 CCCTACCCAGCCCTCCACCTCTGACAGTGCCTCTTCGGATGCTGGCAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GAAGCCGGAGGAGCAGTGGTGGGGGGCCCTCTCCGGGGGCTGGGGAGGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||
 100401 GAAGCCGGAGGAGCAGTGGTGGGGGGCCCTCTCCAGGGACTGGGGAGGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCCCCCAGTGCTACTGCGTCCATACTCTCTGGCTTTGGGGGCATCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCCCCCAGTGCTACTGCGTCCATACTCTCTGGCTTTGGGGGCATCCTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTGGGCAGCCTAGGCCTGGGCTCTGCCAACTTCATGGAGCTGCAGCAGC
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTGGGCAGCCTGGGCCTGGGCTCTGCCAACTTCATGGAGCTGCAGCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGATGCAGCGGCAGCTGATGTCCAATCCTGAGATGCTGTCACAGATCATG
        |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||
 100551 AGATGCAGAGGCAGCTGATGTCCAATCCTGAGATGCTGTTGCAGATCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGAACCCCCTGGTCCAGGATATGATGTCTAACCCTGATCTGATGCGTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100601 GAGAACCCCCTGGTCCAGGATATGATGTCTAACCCTGACCTGATGCGTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATGATTATGGCCAACCCCCAGATGCAGCAGTTGATGGAGCGGAACCCTG
        ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATGATTATTGCCAAACCCCAGATGCAGCAGTTGATGGAGCGGAACCCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGATCAGCCACATGCTCAATAACCCTGAACTCATGAGGCAGACAATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGATCAGCCACATGCTCAATAACCCTGAACTCATGAGGCAGACAATGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTTGCTCGGAATCCAGCCATGATGCAAGAGATGATGCGGAACCAGGACCG
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTTGCTCGGAATCCAGCCGTGATGCAAGAGATGATGCGGAACCAGGACCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCCCTGAGCAACCTTGAGAGCATCCCTGGAGGGTATAATGCCCTCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCCCTGAGCAACCTTGAGAGCATCCCTGGAGGGTATAATGCCCTCCGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCATGTACACGGACATCCAGGAGCCCATGTTCAGTGCTGCCCGGGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCATGTACACGGACATCCAGGAGCCCATGTTCAGTGCTGCCCGGGAACAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTTGGCAACAATCCCTTCTCTTCCCTGGCCGGGAACTCCGACAGCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTTGGCAACAATCCCTTCTCTTCCCTGGCCGGGAACTCCGACAGCTCATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTCCCAGCCTCTGCGGACTGAGAATCGAGAGCCCCTCCCTAACCCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTCCCAGCCTCTGCGGACTGAGAATCGAGAGCCCCTCCCTAACCCCTGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GCCCCTCGCCCCCCACCTCCCAGGCCCCCGGGTCCGGTGGGGAGGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCCCCTCGCCCCCCACCTCCCAGGCCCCCGGGTCCGGTGGGGAGGGCACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGAGGATCGGGGACCAGCCAGGTGCACCCGACAGTCTCGAACCCCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 101051 GGAGGATCGGGGACCAGCCAGGTGCACCCGACAGTCTTGAACCCCTTTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GATCAATGCGGCTAGCCTGGGGTCAGGGATGTTCAATAGCCCAGAAATGC
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GATCAATGCGGCTAGCCTGAGGTCAGGGATGTTCAATAGCCCAGAAATGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AAGCCCTCCTCCAGCAGATCTCTGAGAACCCCCAGCTGATGCAGAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AAGCCCTCCTCCAGCAGATCTCTGAGAACCCCCAGCTGATGCAGAATGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ATCTCAGCACCCTACATGCGCAGCATGATGCAGACGCTTGCCCAGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ATCTCAGCACCCTACATGCGCAGCATGATGCAGACGCTTGCCCAGAACCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CGACTTTGCTGCTCAGATGATGGTGAATGTGCCGCTCTTCGCGGGGAACC
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CGACTTCGCTGCTCAGATGATGGTGAATGTGCCGCTCTTCGCGGGGAACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCCAACTGCAGGAGCAGCTCCGCCTGCAGCTCCCAGTCTTCCTGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCCAACTGCAGGAGCAGCTCCGCCTGCAGCTCCCAGTCTTCCTGCAGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 ATGCAGAACCCAGAGTCACTCTCCATCCTTACCAATCCCCGAGCCATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 ATGCAGAACCCAGAGTCACTCTCCATCCTTACCAATCCCCGAGCCATGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GGCATTGCTGCAGATCCAGCAGGGACTACAGACCTTGCAGACCGAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GGCATTGCTGCAGATCCAGCAGGGACTACAGACCTTGCAGACCGAGGCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CTGGGCTGGTACCCAGCCTTGGCTCCTTTGGGATATCCCGGACCCCAGCA
        ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||
 101451 CTGGGCTGGTACCCAGCCTTGTCTCCTTCGGGATGTCCCGGACCCCAGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CCCTCAGCAGGCAGCAACGCAGGGTCTACGCCCGAGGCCCCCACTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CCCTCAGCAGGCAGCAACGCAGGGTCTACGCCCGAGGCCCCCACTTCCTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 ACCAGCCACGCCAGCCACATCTTCTCCAACAGGGGCTTCCAGCGCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 101551 ACCAGCCACGCCAGCCACATCTTCTCCAACAGGGGCTTCCAGCACCCAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 AGCAACTCATGCAGCAGATGATCCAGCTTTTGGCTGGAAGTGGAAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 AGCAACTCATGCAGCAGATGATCCAGCTTTTGGCTGGAAGTGGAAACTCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 CAGGTGCAGACGCCAGAAGTGAGATTTCAGCAGCAGCTGGAGCAGCTCAA
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 CAGGTGCAGACGTCAGAAGTGAGATTTCAGCAGCAGCTGGAGCAGCTCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CTCCATGGGCTTCATCAATCGTGAGGCTAACCTGCAGGCCCTGATTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 101701 CTCCATGGGCTTCATCAATCGTGAGGCCAACCTGCAGGCCCTGATTGCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CAGGAGGGGACATCAACGCAGCTATCGAGAGACTGCTGGGCTCCCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CAGGAGGGGACATCAACGCAGCTATCGAGAGACTGCTGGGCTCCCAGCTC

   1800 
   1801 TCC
        |||
 101801 TCC