seq1 = pF1KB6159.tfa, 1797 bp
seq2 = pF1KB6159/gi568815578r_2383164.tfa (gi568815578r:2383164_2593895), 210732 bp

>pF1KB6159 1797
>gi568815578r:2383164_2593895 (Chr20)

(complement)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-177  (100319-100377)   100% ->
178-304  (101071-101197)   100% ->
305-1797  (109240-110732)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGTTGCCTTATCCTTCAGCACTGGGAGATCAATACTGGGAAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGTTGCCTTATCCTTCAGCACTGGGAGATCAATACTGGGAAGAGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTGCTTCCAAAGAATGGGGAAAATGTAGAGACTATGAAGAAATTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTGCTTCCAAAGAATGGGGAAAATGTAGAGACTATGAAGAAATTGACCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAAATCATAAAGCGAAAG         GCTTGCCTTCTAATGATACTGAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100101 AAAATCATAAAGCGAAAGGTG...TAGGCTTGCCTTCTAATGATACTGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCCCCCAGAAAAAGGAGGGAAAGGCCCAAATAGTG         GTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100342 TGCCCCCAGAAAAAGGAGGGAAAGGCCCAAATAGTGGTG...TAGGTACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGTTACATTCAGGGATGTGACTGTGATCTTCACAGAAGCAGAATGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101076 AGTTACATTCAGGGATGTGACTGTGATCTTCACAGAAGCAGAATGGAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GACTGAGTCCAGAGCAGAGGAATCTATACAAAGAAGTGATGCTGGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101126 GACTGAGTCCAGAGCAGAGGAATCTATACAAAGAAGTGATGCTGGAGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACAGGAATCTTCTCTCATTGG         CAGAACCAAAGCCAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101176 TACAGGAATCTTCTCTCATTGGGTA...CAGCAGAACCAAAGCCAGAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTACACTTGTTCCTCCTGCCTTCTGGCCTTCTCCTGTCAGCAGTTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109259 CTACACTTGTTCCTCCTGCCTTCTGGCCTTCTCCTGTCAGCAGTTCCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTCAACATGTACTTCAGATCTTCCTGGGCTTATGTGCAGAAAATCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109309 GTCAACATGTACTTCAGATCTTCCTGGGCTTATGTGCAGAAAATCACTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CATCCAGGGAATTCTAGCCCAGGGCATTGGAAACAGCAGGGGCAGCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109359 CATCCAGGGAATTCTAGCCCAGGGCATTGGAAACAGCAGGGGCAGCAGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TTCCCATGTAAGCTGTTGGTTTGAAAATGCAGAAGGTCAGGAGAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109409 TTCCCATGTAAGCTGTTGGTTTGAAAATGCAGAAGGTCAGGAGAGAGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GTGGCTCCAAACCCTGGTCTGCAAGGACAGAGGAGAGAGAAACCTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109459 GTGGCTCCAAACCCTGGTCTGCAAGGACAGAGGAGAGAGAAACCTCAAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCATTCCCCAGCCCACTCCAAAGACAGTCAGCAAGTCCTAGAAAAGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109509 GCATTCCCCAGCCCACTCCAAAGACAGTCAGCAAGTCCTAGAAAAGGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CATGGTGGTAGAAACAGAGCCCAGCTCAGCCCAAAGACCAAACCCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109559 CATGGTGGTAGAAACAGAGCCCAGCTCAGCCCAAAGACCAAACCCTGTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGCTAGACAAAGGCTTGAAGGAATTAGAAACCTTGAGATTTGGAGCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109609 AGCTAGACAAAGGCTTGAAGGAATTAGAAACCTTGAGATTTGGAGCAATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AACTGTAGAGAGTATGAACCGGACCATAACCTGGAATCAAACTTTATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109659 AACTGTAGAGAGTATGAACCGGACCATAACCTGGAATCAAACTTTATTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AAACCCGAGGACCCTCTTAGGGAAGAAGCCCTACATTTGCAGTGATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109709 AAACCCGAGGACCCTCTTAGGGAAGAAGCCCTACATTTGCAGTGATTGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GGCGAAGCTTTAAAGATAGATCAACCCTCATCAGACACCATCGTATACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109759 GGCGAAGCTTTAAAGATAGATCAACCCTCATCAGACACCATCGTATACAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TCGATGGAGAAGCCTTATGTGTGCAGTGAGTGCGGGCGAGGTTTTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109809 TCGATGGAGAAGCCTTATGTGTGCAGTGAGTGCGGGCGAGGTTTTAGCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GAAGTCCAACCTCAGCAGACACCAGAGAACACATTCAGAAGAGAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109859 GAAGTCCAACCTCAGCAGACACCAGAGAACACATTCAGAAGAGAAGCCTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 ATTTGTGCAGGGAGTGTGGGCAAAGCTTTAGAAGTAAGTCCATCCTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109909 ATTTGTGCAGGGAGTGTGGGCAAAGCTTTAGAAGTAAGTCCATCCTCAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AGACATCAGTGGACTCACTCAGAGGAGAAGCCCTATGTTTGCAGCGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109959 AGACATCAGTGGACTCACTCAGAGGAGAAGCCCTATGTTTGCAGCGAGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TGGGCGAGGCTTTAGCGAGAAGTCATCCTTCATCAGACACCAGAGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110009 TGGGCGAGGCTTTAGCGAGAAGTCATCCTTCATCAGACACCAGAGGACAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 ACTCCGGTGAGAAACCCTATGTGTGCCTGGAGTGTGGACGAAGCTTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110059 ACTCCGGTGAGAAACCCTATGTGTGCCTGGAGTGTGGACGAAGCTTTTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GATAAGTCAACCCTCAGAAAACACCAGAGGATACACTCAGGGGAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110109 GATAAGTCAACCCTCAGAAAACACCAGAGGATACACTCAGGGGAGAAGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TTATGTTTGCAGGGAGTGTGGGCGAGGCTTTAGCCAGAACTCAGATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110159 TTATGTTTGCAGGGAGTGTGGGCGAGGCTTTAGCCAGAACTCAGATCTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TCAAACACCAGAGGACACACTTGGATGAGAAGCCTTATGTTTGCAGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110209 TCAAACACCAGAGGACACACTTGGATGAGAAGCCTTATGTTTGCAGGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 TGTGGGCGAGGCTTTTGTGACAAGTCAACCCTCATCATACACGAGCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110259 TGTGGGCGAGGCTTTTGTGACAAGTCAACCCTCATCATACACGAGCGGAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GCACTCTGGAGAGAAGCCTTATGTGTGTGGTGAGTGTGGCCGAGGCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110309 GCACTCTGGAGAGAAGCCTTATGTGTGTGGTGAGTGTGGCCGAGGCTTTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 GTCGGAAATCACTCCTCCTTGTCCACCAGAGGACACACTCAGGGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110359 GTCGGAAATCACTCCTCCTTGTCCACCAGAGGACACACTCAGGGGAGAAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 CATTATGTCTGCAGGGAGTGTAGGCGAGGTTTTAGCCAGAAGTCAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110409 CATTATGTCTGCAGGGAGTGTAGGCGAGGTTTTAGCCAGAAGTCAAATCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 CATCAGACACCAGAGGACGCACTCAAATGAGAAGCCTTATATTTGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110459 CATCAGACACCAGAGGACGCACTCAAATGAGAAGCCTTATATTTGCAGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 AATGTGGGCGAGGCTTTTGTGACAAGTCAACCCTCATTGTACATGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110509 AATGTGGGCGAGGCTTTTGTGACAAGTCAACCCTCATTGTACATGAGAGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 ACACACTCAGGAGAGAAGCCTTACGTGTGCAGTGAGTGTGGCCGAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110559 ACACACTCAGGAGAGAAGCCTTACGTGTGCAGTGAGTGTGGCCGAGGCTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 TAGCCGGAAATCACTCCTCCTTGTCCACCAGAGGACACACTCAGGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110609 TAGCCGGAAATCACTCCTCCTTGTCCACCAGAGGACACACTCAGGGGAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 AGCATTATGTTTGTAGGGAGTGTGGGCGAGGCTTTAGTCATAAGTCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110659 AGCATTATGTTTGTAGGGAGTGTGGGCGAGGCTTTAGTCATAAGTCAAAT

   1800     .    :    .    :
   1774 CTCATCAGACACCAGAGGACACAC
        ||||||||||||||||||||||||
 110709 CTCATCAGACACCAGAGGACACAC