seq1 = pF1KB6157.tfa, 1794 bp
seq2 = pF1KB6157/gi568815587f_65162293.tfa (gi568815587f:65162293_65397266), 234974 bp

>pF1KB6157 1794
>gi568815587f:65162293_65397266 (Chr11)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-204  (104290-104414)   100% ->
205-296  (105185-105276)   100% ->
297-354  (106380-106437)   100% ->
355-461  (113600-113706)   100% ->
462-655  (116438-116631)   100% ->
656-744  (117246-117334)   100% ->
745-900  (118700-118855)   100% ->
901-963  (119378-119440)   100% ->
964-1006  (120187-120229)   100% ->
1007-1131  (125424-125548)   100% ->
1132-1170  (126758-126796)   100% ->
1171-1244  (127507-127580)   100% ->
1245-1353  (131861-131969)   100% ->
1354-1460  (132254-132360)   100% ->
1461-1520  (133248-133307)   100% ->
1521-1647  (133572-133698)   100% ->
1648-1794  (134828-134974)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGCATCCGCCCAGCAGCTGGCGGAGGAGCTGCAGATCTTCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCGCATCCGCCCAGCAGCTGGCGGAGGAGCTGCAGATCTTCGGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGACTGCGAGGAGGCTCTAATTGAGAAAT         TGGTAGAGCTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 AGACTGCGAGGAGGCTCTAATTGAGAAATGTG...CAGTGGTAGAGCTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGTTCAGTATGGACAGAATGAGGAGGGAATGGTAGGCGAGCTTATAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104302 GTGTTCAGTATGGACAGAATGAGGAGGGAATGGTAGGCGAGCTTATAGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCTGCACCAGCACACATAAAGTTGGCCTTACCTCAGAGATCCTGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104352 TTCTGCACCAGCACACATAAAGTTGGCCTTACCTCAGAGATCCTGAACTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTTTGAGCATGAG         TTTCTGAGCAAAAGATTATCGAAAGCCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104402 TTTTGAGCATGAGGTA...CAGTTTCTGAGCAAAAGATTATCGAAAGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGCATAGTACCTGCAAGGACAGTGGCCATGCAGGAGCTAGAGACATTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105213 GGCATAGTACCTGCAAGGACAGTGGCCATGCAGGAGCTAGAGACATTGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCCATTCAAGAGCT         AATTGAAGTGGAAGAAGAAGAGGAAAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 105263 TCCATTCAAGAGCTGTA...TAGAATTGAAGTGGAAGAAGAAGAGGAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCTCTTGAACTCTTACACCACACCTTCAAAG         GGTTCTCAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 106407 CCTCTTGAACTCTTACACCACACCTTCAAAGGTA...TAGGGTTCTCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGCGAGCTATCTCTACCCCAGAAACCCCCCTAACAAAAAGGAGTGTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113610 AGCGAGCTATCTCTACCCCAGAAACCCCCCTAACAAAAAGGAGTGTGTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ACTCGTAGCCCCCATCAGCTACTCTCACCGTCAAGTTTCTCTCCAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 113660 ACTCGTAGCCCCCATCAGCTACTCTCACCGTCAAGTTTCTCTCCAAGGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    462       TGCTACTCCCTCCCAGAAATACAACTCACGAAGTAACCGAGGAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113710 ...TAGTGCTACTCCCTCCCAGAAATACAACTCACGAAGTAACCGAGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AAGTGGTTACCTCCTTCGGCTTAGCACAGGGAGTATCTTGGTCTGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116482 AAGTGGTTACCTCCTTCGGCTTAGCACAGGGAGTATCTTGGTCTGGGAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGAGGAGCTGGAAACATCAGCCTGAAGGTCTTGGGATGTCCAGAGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116532 GGAGGAGCTGGAAACATCAGCCTGAAGGTCTTGGGATGTCCAGAGGCACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AACTGGGAGCTACAAATCCATGTTTCAGAAGCTCCCAGACATTCGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116582 AACTGGGAGCTACAAATCCATGTTTCAGAAGCTCCCAGACATTCGAGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656          TTCTGACCTGTAAGATAGAAGAACTTGGCAGCGAACTCAAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116632 GTG...TAGTTCTGACCTGTAAGATAGAAGAACTTGGCAGCGAACTCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAACATTACAAGATTGAAGCTTTCACTCCTTTGCTAGCCCCAGCACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 117287 GAACATTACAAGATTGAAGCTTTCACTCCTTTGCTAGCCCCAGCACAGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    745        GAGCCTGTCACTCTGCTGGGCCAGATTGGCTGTGATAGCAACG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117337 A...TAGGAGCCTGTCACTCTGCTGGGCCAGATTGGCTGTGATAGCAACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GGAAGCTGAACAACAAGTCAGTGATTCTCGAGGGAGACCGGGAACATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118743 GGAAGCTGAACAACAAGTCAGTGATTCTCGAGGGAGACCGGGAACATTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TCGGGTGCTCAAATTCCAGTGGATTTATCTGAGCTTAAGGAATATTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118793 TCGGGTGCTCAAATTCCAGTGGATTTATCTGAGCTTAAGGAATATTCTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GTTTCCTGGACAG         GTTGTAATTATGGAAGGAATCAACACCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 118843 GTTTCCTGGACAGGTG...CAGGTTGTAATTATGGAAGGAATCAACACCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CTGGTAGGAAACTTGTTGCCACCAAACTCTACGAG         GGTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 119406 CTGGTAGGAAACTTGTTGCCACCAAACTCTACGAGGTA...TAGGGTGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CCACTTCCATTTTATCAGCCCACTGAAGAGGATGCAG         ACTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 120193 CCACTTCCATTTTATCAGCCCACTGAAGAGGATGCAGGTG...TAGACTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 TGAGCAAAGCATGGTCCTGGTTGCCTGTGGACCATACACCACATCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125428 TGAGCAAAGCATGGTCCTGGTTGCCTGTGGACCATACACCACATCTGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 GCATCACGTATGACCCCCTGCTTGACCTGATTGCTGTCATCAACCATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125478 GCATCACGTATGACCCCCTGCTTGACCTGATTGCTGTCATCAACCATGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CGGCCAGATGTCTGCATCCTG         TTTGGCCCTTTCCTGGATGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 125528 CGGCCAGATGTCTGCATCCTGGTA...CAGTTTGGCCCTTTCCTGGATGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 TAAGCATGAACAGGTGGAG         AATTGTCTACTGACAAGTCCAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 126778 TAAGCATGAACAGGTGGAGGTG...CAGAATTGTCTACTGACAAGTCCAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 TTGAAGACATTTTCAAGCAGTGTCTACGAACAATTATTGAAGGCACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127529 TTGAAGACATTTTCAAGCAGTGTCTACGAACAATTATTGAAGGCACAAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 AG         CTCCGGCTCCCACCTTGTCTTTGTCCCGTCATTGAGAGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127579 AGGTC...TAGCTCCGGCTCCCACCTTGTCTTTGTCCCGTCATTGAGAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 TGTGCACCATGAGCCTGTGTACCCCCAGCCGCCTTTCAGCTACTCCGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131900 TGTGCACCATGAGCCTGTGTACCCCCAGCCGCCTTTCAGCTACTCCGATC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 TGTCTCGAGAGGACAAAAAG         CAAGTACAGTTTGTGTCCGAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 131950 TGTCTCGAGAGGACAAAAAGGTA...TAGCAAGTACAGTTTGTGTCCGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 CCCTGCAGCCTCTCCATAAACGGAGTGATCTTCGGCTTGACATCCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132275 CCCTGCAGCCTCTCCATAAACGGAGTGATCTTCGGCTTGACATCCACAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 TCTGCTTTTCCACCTGGGGGCCGAGGAGATCAGTAG         TTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 132325 TCTGCTTTTCCACCTGGGGGCCGAGGAGATCAGTAGGTA...CAGTTCTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 CCGGAACTTCAGACAGATTCAGCCGAATACTCAAGCACATCTTGACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133253 CCGGAACTTCAGACAGATTCAGCCGAATACTCAAGCACATCTTGACCCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 AGGAG         CTACTACCCACTCTACCCGCCCCAAGAAGACATGGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133303 AGGAGGTG...TAGCTACTACCCACTCTACCCGCCCCAAGAAGACATGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 CATTGACTATGAGTCGTTCTATGTTTACGCACAGCTGCCTGTCACCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133608 CATTGACTATGAGTCGTTCTATGTTTACGCACAGCTGCCTGTCACCCCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 ATGTCCTCATCATCCCGTCAGAGCTGAGGTACTTCGTGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 133658 ATGTCCTCATCATCCCGTCAGAGCTGAGGTACTTCGTGAAGGTA...CAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1648 GATGTCCTCGGCTGTGTCTGTGTGAACCCTGGGCGCCTTACCAAAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134828 GATGTCCTCGGCTGTGTCTGTGTGAACCCTGGGCGCCTTACCAAAGGGCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 GGTGGGAGGCACCTTCGCCCGACTCTACCTTAGGAGGCCGGCAGCGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 134878 GGTGGGAGGCACCTTCGCCCGACTCTACCTTAGGAGGCCGGCAGCGGACG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1748 GGGCAGAGAGGCAGAGCCCATGCATTGCTGTGCAGGTCGTCAGGATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134928 GGGCAGAGAGGCAGAGCCCATGCATTGCTGTGCAGGTCGTCAGGATC