seq1 = pF1KB6156.tfa, 1911 bp
seq2 = pF1KB6156/gi568815586r_52575196.tfa (gi568815586r:52575196_52780348), 205153 bp

>pF1KB6156 1911
>gi568815586r:52575196_52780348 (Chr12)

(complement)

1-591  (100001-100591)   100% ->
592-806  (101593-101807)   100% ->
807-867  (102126-102186)   100% ->
868-963  (102604-102699)   100% ->
964-1128  (102869-103033)   100% ->
1129-1254  (103165-103290)   100% ->
1255-1475  (103854-104074)   99% ->
1476-1510  (104605-104639)   100% ->
1511-1911  (104732-105153)   94%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTCGACAGTTTAGTTCCAGGTCTGGGTACCGAAGTGGAGGGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTCGACAGTTTAGTTCCAGGTCTGGGTACCGAAGTGGAGGGGGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCTCTGGCTCTGCTGGGATCATCAACTACCAGCGCAGGACCACCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCTCTGGCTCTGCTGGGATCATCAACTACCAGCGCAGGACCACCAGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTCCACACGCCGCAGTGGAGGAGGTGGTGGGAGATTTTCAAGCTGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTCCACACGCCGCAGTGGAGGAGGTGGTGGGAGATTTTCAAGCTGTGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGTGGTGGTGGTAGCTTTGGTGCTGGTGGTGGATTTGGAAGTCGGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTGGTGGTGGTAGCTTTGGTGCTGGTGGTGGATTTGGAAGTCGGAGTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTTAACCTTGGTGGCAGTAAAAGCATCTCCATAAGTGTGGCTAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGTTAACCTTGGTGGCAGTAAAAGCATCTCCATAAGTGTGGCTAGAGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTGGACGTGGTAGTGGCTTTGGTGGTGGTTATGGTGGTGGTGGCTTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTGGACGTGGTAGTGGCTTTGGTGGTGGTTATGGTGGTGGTGGCTTTGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGTGGTGGCTTTGGTGGTGGTGGCTTTGGTGGAGGTGGCATTGGGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGTGGTGGCTTTGGTGGTGGTGGCTTTGGTGGAGGTGGCATTGGGGGTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGGCTTTGGTGGTTTTGGCAGTGGTGGTGGTGGTTTTGGTGGAGGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGGCTTTGGTGGTTTTGGCAGTGGTGGTGGTGGTTTTGGTGGAGGTGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGGGGGTGGTGGATATGGGGGTGGTTATGGTCCTGTCTGCCCTCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTGGGGGTGGTGGATATGGGGGTGGTTATGGTCCTGTCTGCCCTCCTGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCATACAAGAAGTCACTATCAACCAGAGCCTTCTTCAGCCCCTCAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCATACAAGAAGTCACTATCAACCAGAGCCTTCTTCAGCCCCTCAATGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGAGATTGACCCTGAGATCCAAAAGGTGAAGTCTCGAGAAAGGGAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGAGATTGACCCTGAGATCCAAAAGGTGAAGTCTCGAGAAAGGGAGCAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAAGTCACTCAACAACCAATTTGCCTCCTTCATTGACAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100551 TCAAGTCACTCAACAACCAATTTGCCTCCTTCATTGACAAGGTG...TAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GTGAGGTTCCTGGAGCAGCAGAACCAGGTACTGCAAACAAAATGGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101593 GTGAGGTTCCTGGAGCAGCAGAACCAGGTACTGCAAACAAAATGGGAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCTGCAGCAGGTAGATACCTCCACTAGAACCCATAATTTAGAGCCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101643 GCTGCAGCAGGTAGATACCTCCACTAGAACCCATAATTTAGAGCCCTACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TTGAGTCATTCATCAACAATCTCCGAAGGAGAGTGGACCAACTGAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101693 TTGAGTCATTCATCAACAATCTCCGAAGGAGAGTGGACCAACTGAAGAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GATCAATCTCGGTTGGATTCGGAACTGAAGAACATGCAGGACATGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101743 GATCAATCTCGGTTGGATTCGGAACTGAAGAACATGCAGGACATGGTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGATTACCGGAACAA         GTATGAGGATGAAATCAACAAGCGGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101793 GGATTACCGGAACAAGTA...CAGGTATGAGGATGAAATCAACAAGCGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CAAATGCAGAGAATGAATTTGTGACCATCAAGAAG         GATGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 102152 CAAATGCAGAGAATGAATTTGTGACCATCAAGAAGGTA...TAGGATGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GATGGTGCTTATATGACCAAGGTGGACCTTCAGGCCAAACTTGACAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102610 GATGGTGCTTATATGACCAAGGTGGACCTTCAGGCCAAACTTGACAACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GCAGCAGGAAATTGATTTCCTTACAGCACTCTACCAAGCA         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 102660 GCAGCAGGAAATTGATTTCCTTACAGCACTCTACCAAGCAGTA...CAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AGTTGTCTCAGATGCAGACTCAAATCAGTGAAACTAATGTCATCCTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102870 AGTTGTCTCAGATGCAGACTCAAATCAGTGAAACTAATGTCATCCTCTCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 ATGGACAACAACCGCAGTCTCGACCTGGACAGCATCATTGCTGAGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102920 ATGGACAACAACCGCAGTCTCGACCTGGACAGCATCATTGCTGAGGTCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GGCCCAGTACGAGGATATAGCCCAGAAGAGCAAAGCTGAGGCCGAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102970 GGCCCAGTACGAGGATATAGCCCAGAAGAGCAAAGCTGAGGCCGAGTCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TGTACCAGAGCAAG         TATGAAGAGCTGCAGATCACTGCTGGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103020 TGTACCAGAGCAAGGTG...TAGTATGAAGAGCTGCAGATCACTGCTGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 AGACATGGGGATAGTGTGAGAAATTCAAAGATAGAAATTTCTGAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103192 AGACATGGGGATAGTGTGAGAAATTCAAAGATAGAAATTTCTGAGCTGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TCGTGTGATCCAGAGACTTAGATCTGAAATCGACAATGTCAAGAAGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 103242 TCGTGTGATCCAGAGACTTAGATCTGAAATCGACAATGTCAAGAAGCAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1255         ATCTCCAACTTGCAGCAGTCCATCAGTGATGCAGAGCAGCGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103292 TA...CAGATCTCCAACTTGCAGCAGTCCATCAGTGATGCAGAGCAGCGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GGCGAGAATGCCCTCAAGGATGCCAAGAACAAGCTGAATGACCTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103896 GGCGAGAATGCCCTCAAGGATGCCAAGAACAAGCTGAATGACCTGGAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 TGCCCTGCAGCAGGCCAAGGAAGACCTGGCCCGCCTGCTGCGTGACTACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 103946 TGCCCTGCAGCAGGCCAAGGAAGACCTGGCCCGCCTGCTGCGCGACTACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 AGGAGCTGATGAACACCAAGCTGGCCCTGGATCTGGAGATTGCCACCTAC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 103996 AGGAGCTGATGAACACAAAGCTGGCCCTGGATCTGGAGATTGCCACCTAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 AGGACCCTCCTGGAGGGAGAAGAAAGCAG         GATGTCTGGAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104046 AGGACCCTCCTGGAGGGAGAAGAAAGCAGGTG...CAGGATGTCTGGAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 ATGTGCCCCGAACGTGAGTGTGT         CTGTGAGCACAAGCCACA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 104617 ATGTGCCCCGAACGTGAGTGTGTGTA...CAGCTGTGAGCACAAGCCACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 CCACCATTAGTGGAGGTGGCAGCCGAGGAGGTGGCGGCGGTGGCTACGGC
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104750 CCACCATCAGTGGAGGTGGCAGCCGAGGAGGTGGCGGCGGTGGCTACGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 TCTGGAGGTAGCAGCTATGGCTCCGGAGGTGGTAGCTATGGTTCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104800 TCTGGAGGTAGCAGCTATGGCTCCGGAGGTGGTAGCTATGGTTCTGGAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 TGGCGGCGGCGGCGGCCGTGGCAGC              T   A  T  G
        |||||||||||||||||||||||||--------------|---|--|--|
 104850 TGGCGGCGGCGGCGGCCGTGGCAGCTATGGCTCCGGAGGTAGCAGCTACG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1658 GCTCCGGAGGTGGCAGCTATGGCTCTGGAGGTGGCGGCGGCGGCCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104900 GCTCCGGAGGTGGCAGCTATGGCTCTGGAGGTGGCGGCGGCGGCCATGGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1708 AGCTACGGCTCCGGAAGCAGCAGTGGGGGCTACAGAGGTGGCTCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104950 AGCTACGGCTCCGGAAGCAGCAGTGGGGGCTACAGAGGTGGCTCTGGAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1758 CGGCGGCGGCGGCAGCTCTGGCGGCCGGGGCTCTGGCGGCGGGAGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105000 CGGCGGCGGCGGCAGCTCTGGCGGCCGGGGCTCTGGCGGCGGGAGCTCTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1808 GAGGCTCCATAGGAGGCCGGGGATCCAGCTCTGGGGGTGTCAAGTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105050 GAGGCTCCATAGGAGGCCGGGGATCCAGCTCTGGGGGTGTCAAGTCCTCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1858 GGTGGCAGTTCCAGCGTGAAGTTTGTTTCTACCACTTATTCCGGAGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105100 GGTGGCAGTTCCAGCGTGAAGTTTGTTTCTACCACTTATTCCGGAGTAAC

   2000 
   1908 CAGA
        ||||
 105150 CAGA