seq1 = pF1KB6153.tfa, 1791 bp
seq2 = pF1KB6153/gi568815581r_31763362.tfa (gi568815581r:31763362_32001627), 238266 bp

>pF1KB6153 1791
>gi568815581r:31763362_32001627 (Chr17)

(complement)

1-92  (100001-100092)   100% ->
93-177  (101898-101982)   100% ->
178-219  (106617-106658)   100% ->
220-312  (106891-106983)   100% ->
313-360  (108834-108881)   100% ->
361-424  (109305-109368)   100% ->
425-543  (112225-112343)   100% ->
544-621  (114315-114392)   100% ->
622-703  (115567-115648)   100% ->
704-785  (117123-117204)   100% ->
786-967  (120874-121055)   100% ->
968-1047  (122847-122926)   100% ->
1048-1125  (123301-123378)   100% ->
1126-1305  (126215-126394)   100% ->
1306-1386  (127875-127955)   100% ->
1387-1496  (128141-128250)   100% ->
1497-1563  (133516-133582)   100% ->
1564-1636  (136190-136262)   100% ->
1637-1791  (138112-138266)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAGATAATTCAGGAACGCATAGAAGATCGGCTCCCGGAATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGAGATAATTCAGGAACGCATAGAAGATCGGCTCCCGGAATTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAGCTGGAGCGCATTGGACTGTTCAGTCATGCGGAGATTAA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100051 ACAGCTGGAGCGCATTGGACTGTTCAGTCATGCGGAGATTAAGTG...CA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     93  GGCTATCATTAAGAAGGCTTCCGATCTAGAGTACAAAATCCAGAGAAGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101897 GGGCTATCATTAAGAAGGCTTCCGATCTAGAGTACAAAATCCAGAGAAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCCTTTTCAAGGAAGACTTTATCAATTATGTTCAA         TATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101947 ACCCTTTTCAAGGAAGACTTTATCAATTATGTTCAAGTA...TAGTATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AATTAATCTTTTGGAGCTGATCCAGAGAAGAAGAACA         CGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 106622 AATTAATCTTTTGGAGCTGATCCAGAGAAGAAGAACAGTA...TAGCGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TTGGATATTCATTTAAGAAGGATGAGATTGAGAATTCTATTGTACACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106895 TTGGATATTCATTTAAGAAGGATGAGATTGAGAATTCTATTGTACACCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTACAAGGTGTTTTCCAGCGTGCCTCAGCAAAATGGAAA         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 106945 GTACAAGGTGTTTTCCAGCGTGCCTCAGCAAAATGGAAAGTG...CAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CGATGTTCAACTTTGGCTCTCCTATGTGGCTTTTTGTAAGAAGTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 108836 CGATGTTCAACTTTGGCTCTCCTATGTGGCTTTTTGTAAGAAGTGGGTG.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    361      GCTACTAAAACTCGACTTAGCAAGGTATTCTCTGCCATGTTGGCG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108886 ..CAGGCTACTAAAACTCGACTTAGCAAGGTATTCTCTGCCATGTTGGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 ATTCATTCCAACAAACCAG         CTTTGTGGATTATGGCAGCCAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 109350 ATTCATTCCAACAAACCAGGTA...CAGCTTTGTGGATTATGGCAGCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 ATGGGAAATGGAAGATCGATTGTCTTCAGAAAGCGCAAGGCAACTATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112247 ATGGGAAATGGAAGATCGATTGTCTTCAGAAAGCGCAAGGCAACTATTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TTCGCGCACTGCGCTTTCATCCAGAGTGCCCAAAACTTTATAAAGAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 112297 TTCGCGCACTGCGCTTTCATCCAGAGTGCCCAAAACTTTATAAAGAAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    544       TACTTTAGGATGGAGCTGATGCATGCTGAAAAACTGAGGAAGGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112347 ...TAGTACTTTAGGATGGAGCTGATGCATGCTGAAAAACTGAGGAAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GAAGGAAGAATTTGAAAAAGCCAGTATGGATGTG         GAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 114359 GAAGGAAGAATTTGAAAAAGCCAGTATGGATGTGGTA...TAGGAGAATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 CTGATTATTCTGAAGAAATCCTTAAGGGCGAGTTGGCATGGATCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115574 CTGATTATTCTGAAGAAATCCTTAAGGGCGAGTTGGCATGGATCATCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 AAAAATTCTGTAAGCATAATTAAAG         GTGCAGAATTTCACGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 115624 AAAAATTCTGTAAGCATAATTAAAGGTA...TAGGTGCAGAATTTCACGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 GTCACTGCTTTCGATTGCACAGCTATTTGACTTTGCCAAAGATCTACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117139 GTCACTGCTTTCGATTGCACAGCTATTTGACTTTGCCAAAGATCTACAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 AAGAGATTTATGATGA         CCTTCAGGCTCTACACACAGATGAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 117189 AAGAGATTTATGATGAGTA...CAGCCTTCAGGCTCTACACACAGATGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811 CCTCTCACTTGGGATTATGTGGCAAGGCGAGAATTAGAGATTGAGTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120899 CCTCTCACTTGGGATTATGTGGCAAGGCGAGAATTAGAGATTGAGTCACA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 GACAGAAGAGCAGCCTACAACGAAACAAGCCAAAGCAGTGGAGGTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120949 GACAGAAGAGCAGCCTACAACGAAACAAGCCAAAGCAGTGGAGGTCGGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 GGAAGGAGGAGAGGTGCTGTGCTGTGTATGAAGAGGCAGTGAAGACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120999 GGAAGGAGGAGAGGTGCTGTGCTGTGTATGAAGAGGCAGTGAAGACTCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 CCAACAG         AGGCCATGTGGAAGTGTTACATCACCTTTTGCTT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121049 CCAACAGGTG...CAGAGGCCATGTGGAAGTGTTACATCACCTTTTGCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 GGAAAGATTTACTAAGAAGTCAAATAGTGGGTTCCTTAGAGGGAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 122881 GGAAAGATTTACTAAGAAGTCAAATAGTGGGTTCCTTAGAGGGAAGGTG.

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1048      AGGTTGGAAAGAACCATGACTGTATTCAGGAAGGCACATGAACTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122931 ..CAGAGGTTGGAAAGAACCATGACTGTATTCAGGAAGGCACATGAACTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 AAGCTTCTGTCAGAATGCCAATACAAGCAGTTG         AGTGTTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 123346 AAGCTTCTGTCAGAATGCCAATACAAGCAGTTGGTA...TAGAGTGTTTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1134 GTTGCTGTGTTATAACTTCCTGAGGGAAGCTCTGGAAGTGGCAGTAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126223 GTTGCTGTGTTATAACTTCCTGAGGGAAGCTCTGGAAGTGGCAGTAGCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 GAACTGAATTGTTTAGAGACTCTGGGACAATGTGGCAGCTGAAGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126273 GAACTGAATTGTTTAGAGACTCTGGGACAATGTGGCAGCTGAAGCTGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 GTGCTGATCGAGTCAAAGAGCCCTGACATAGCCATGCTTTTTGAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126323 GTGCTGATCGAGTCAAAGAGCCCTGACATAGCCATGCTTTTTGAAGAAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 CTTTGTGCACCTGAAACCCCAG         GTTTGTCTGCCATTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 126373 CTTTGTGCACCTGAAACCCCAGGTC...TAGGTTTGTCTGCCATTGTGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 TTTCCTGGGCAGAGTGGAGTGAAGGTGCCAAAAGCCAAGAAGACACTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127894 TTTCCTGGGCAGAGTGGAGTGAAGGTGCCAAAAGCCAAGAAGACACTGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 GCAGTCTTTAAG         AAAGCTCTCTTAGCTGTCATAGGTGCCGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 127944 GCAGTCTTTAAGGTA...TAGAAAGCTCTCTTAGCTGTCATAGGTGCCGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 CTCAGTAACCCTGAAGAATAAGTACCTGGATTGGGCTTATCGAAGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128170 CTCAGTAACCCTGAAGAATAAGTACCTGGATTGGGCTTATCGAAGTGGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 GCTACAAAAAGGCCAGAGCTGTGTTTAAAAG         TTTACAGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 128220 GCTACAAAAAGGCCAGAGCTGTGTTTAAAAGGTA...TAGTTTACAGGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507 AGCCGACCATTTTCAGTTGACTTTTTCAGGAAAATGATTCAGTTTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133526 AGCCGACCATTTTCAGTTGACTTTTTCAGGAAAATGATTCAGTTTGAAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 GGAGCAA         GAATCCTGCAATATGGCGAACATAAGAGAATATT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133576 GGAGCAAGTA...CAGGAATCCTGCAATATGGCGAACATAAGAGAATATT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1598 ATGAGAGAGCTTTGAGAGAGTTTGGATCCGCAGATTCTG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 136224 ATGAGAGAGCTTTGAGAGAGTTTGGATCCGCAGATTCTGGTA...AAGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1639 CTTTGGATGGATTATATGAAAGAAGAATTGAACCACCCCCTTGGTAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138114 CTTTGGATGGATTATATGAAAGAAGAATTGAACCACCCCCTTGGTAGACC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1689 TGAGAACTGTGGACAGATCTACTGGCGAGCGATGAAAATGTTGCAGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138164 TGAGAACTGTGGACAGATCTACTGGCGAGCGATGAAAATGTTGCAGGGAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1739 AGTCAGCAGAGGCATTTGTAGCTAAACATGCTATGCATCAGACTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138214 AGTCAGCAGAGGCATTTGTAGCTAAACATGCTATGCATCAGACTGGCCAT

   1950 
   1789 TTA
        |||
 138264 TTA