seq1 = pF1KB6151.tfa, 1788 bp
seq2 = pF1KB6151/gi568815586r_122132249.tfa (gi568815586r:122132249_122366408), 234160 bp

>pF1KB6151 1788
>gi568815586r:122132249_122366408 (Chr12)

(complement)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-168  (102210-102275)   100% ->
169-296  (102710-102837)   100% ->
297-483  (104962-105148)   100% ->
484-600  (115310-115426)   100% ->
601-775  (116364-116538)   100% ->
776-969  (121647-121840)   100% ->
970-1096  (123901-124027)   100% ->
1097-1164  (126464-126531)   100% ->
1165-1302  (127685-127822)   100% ->
1303-1440  (130486-130623)   100% ->
1441-1609  (133441-133609)   100% ->
1610-1788  (133982-134160)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCTCATCTGTCCTACGGCCGAGTGAACCTAAACGTGTTGCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCTCATCTGTCCTACGGCCGAGTGAACCTAAACGTGTTGCGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGGTGCGTCGCGAGCTGCGCGAGTTCCTGGACAAGTGCGCAGGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGGTGCGTCGCGAGCTGCGCGAGTTCCTGGACAAGTGCGCAGGAAGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AG         GCAATAGTTTGGGATGAATACCTAACTGGACCCTTTGGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGTG...CAGGCAATAGTTTGGGATGAATACCTAACTGGACCCTTTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGATTGCACAGTATTCACTATTGAAG         GAACATGAAGTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102249 CTGATTGCACAGTATTCACTATTGAAGGTA...TAGGAACATGAAGTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AAAAATGTTCACACTTAAAGGAAATCGTTTGCCGGCAGCTGATGTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102724 AAAAATGTTCACACTTAAAGGAAATCGTTTGCCGGCAGCTGATGTGAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATATAATTTTTTTTGTCAGACCCAGGCTAGAGTTGATGGATATAATCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102774 ATATAATTTTTTTTGTCAGACCCAGGCTAGAGTTGATGGATATAATCGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAAACGTGCTCAG         TGAAGATAGACGAGGCCCAACGAGAGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102824 GAAAACGTGCTCAGGTA...CAGTGAAGATAGACGAGGCCCAACGAGAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTTTCATATTCTGTTTGTGCCACGCCGTAGCCTGTTGTGCGAACAGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104989 TTTTCATATTCTGTTTGTGCCACGCCGTAGCCTGTTGTGCGAACAGCGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGAAGGATCTGGGTGTCTTGGGATCCTTTATTCACAGGGAGGAGTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105039 TGAAGGATCTGGGTGTCTTGGGATCCTTTATTCACAGGGAGGAGTACAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTAGATCTCATTCCATTCGATGGGGATCTCTTATCCATGGAATCAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105089 TTAGATCTCATTCCATTCGATGGGGATCTCTTATCCATGGAATCAGAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCATTCAAA         GAGTGCTACCTGGAGGGTGACCAGACGAGCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 105139 TGCATTCAAAGTA...CAGGAGTGCTACCTGGAGGGTGACCAGACGAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGTACCACGCAGCCAAGGGGCTGATGACCCTGCAAGCTCTGTATGGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115341 TGTACCACGCAGCCAAGGGGCTGATGACCCTGCAAGCTCTGTATGGAACG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATCCCCCAGATCTTTGGGAAAGGAGAATGCGCTCGG         CAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 115391 ATCCCCCAGATCTTTGGGAAAGGAGAATGCGCTCGGGTG...CAGCAAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGCCAATATGATGATCAGGATGAAGAGAGAGTTTACAGGAAGCCAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116369 GGCCAATATGATGATCAGGATGAAGAGAGAGTTTACAGGAAGCCAGAATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CAATATTTCCTGTTTTTGATAATCTCTTGTTGCTTGATCGGAATGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116419 CAATATTTCCTGTTTTTGATAATCTCTTGTTGCTTGATCGGAATGTGGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TTATTAACACCTCTTGCCACTCAGCTGACATATGAAGGACTCATTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116469 TTATTAACACCTCTTGCCACTCAGCTGACATATGAAGGACTCATTGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AATTTATGGCATTCAGAACA         GTTATGTGAAATTACCTCCAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 116519 AATTTATGGCATTCAGAACAGTA...CAGGTTATGTGAAATTACCTCCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGAAATTTGCACCTAAGAAACAGGGCGATGGTGGTAAGGACCTCCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121668 AGAAATTTGCACCTAAGAAACAGGGCGATGGTGGTAAGGACCTCCCCACG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAAGCAAAGAAGCTGCAGCTGAATTCTGCAGAGGAGCTCTATGCTGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121718 GAAGCAAAGAAGCTGCAGCTGAATTCTGCAGAGGAGCTCTATGCTGAGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CCGAGATAAGAACTTCAACGCAGTTGGCTCTGTGCTCAGCAAGAAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121768 CCGAGATAAGAACTTCAACGCAGTTGGCTCTGTGCTCAGCAAGAAAGCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGATCATCTCTGCAGCATTCGAG         GAAAGACACAATGCTAAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 121818 AGATCATCTCTGCAGCATTCGAGGTG...CAGGAAAGACACAATGCTAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACCGTGGGGGAGATCAAGCAGTTTGTTTCCCAGTTGCCCCACATGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123919 ACCGTGGGGGAGATCAAGCAGTTTGTTTCCCAGTTGCCCCACATGCAGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AGCAAGGGGCTCGCTTGCAAACCATACCTCAATTGCAGAATTGATCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123969 AGCAAGGGGCTCGCTTGCAAACCATACCTCAATTGCAGAATTGATCAAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATGTCACTA         CTTCTGAAGACTTTTTTGATAAATTAACCGTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 124019 ATGTCACTAGTG...TAGCTTCTGAAGACTTTTTTGATAAATTAACCGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GAACAGGAGTTTATGTCTGGAATAGACACTGATAAG         GTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 126496 GAACAGGAGTTTATGTCTGGAATAGACACTGATAAGGTA...CAGGTCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CAATTACATTGAGGATTGTATCGCCCAAAAGCACTCGTTGATCAAGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127690 CAATTACATTGAGGATTGTATCGCCCAAAAGCACTCGTTGATCAAGGTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TAAGACTAGTTTGCCTCCAATCCGTGTGTAATAGTGGGCTCAAACAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127740 TAAGACTAGTTTGCCTCCAATCCGTGTGTAATAGTGGGCTCAAACAAAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GTTTTGGATTATTACAAAAGAGAGATTCTCCAG         ACATACGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 127790 GTTTTGGATTATTACAAAAGAGAGATTCTCCAGGTG...CAGACATACGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CTATGAGCACATATTGACCTTACACAACCTGGAGAAGGCCGGCCTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130494 CTATGAGCACATATTGACCTTACACAACCTGGAGAAGGCCGGCCTGCTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 AACCGCAGACGGGGGGCAGAAACAATTACCCAACTATACGGAAAACATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130544 AACCGCAGACGGGGGGCAGAAACAATTACCCAACTATACGGAAAACATTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CGCCTCTGGATGGATGATGTTAATGAGCAA         AACCCCACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 130594 CGCCTCTGGATGGATGATGTTAATGAGCAAGTA...CAGAACCCCACGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CATATCGTATGTGTACAGTGGGTATGCCCCGCTCAGTGTGCGGCTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133452 CATATCGTATGTGTACAGTGGGTATGCCCCGCTCAGTGTGCGGCTGGCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AGCTGCTTTCCCGGCCTGGCTGGCGGAGCATCGAGGAGGTCCTCCGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133502 AGCTGCTTTCCCGGCCTGGCTGGCGGAGCATCGAGGAGGTCCTCCGCATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CTCCCAGGGCCCCACTTTGAGGAGCGGCAGCCACTGCCCACAGGACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133552 CTCCCAGGGCCCCACTTTGAGGAGCGGCAGCCACTGCCCACAGGACTGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GAAGAAAC         GTCAACCGGGAGAAAACCGAGTGACTCTGATAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 133602 GAAGAAACGTA...TAGGTCAACCGGGAGAAAACCGAGTGACTCTGATAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TTTTCCTTGGGGGCGTAACCTTCGCTGAAATTGCTGCCCTGCGATTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134015 TTTTCCTTGGGGGCGTAACCTTCGCTGAAATTGCTGCCCTGCGATTTCTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 TCCCAGTTGGAAGATGGAGGTACAGAATATGTCATTGCCACCACTAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134065 TCCCAGTTGGAAGATGGAGGTACAGAATATGTCATTGCCACCACTAAACT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1743 AATGAATGGAACCAGTTGGATAGAGGCTCTGATGGAAAAACCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134115 AATGAATGGAACCAGTTGGATAGAGGCTCTGATGGAAAAACCTTTC