seq1 = pF1KB6140.tfa, 1902 bp
seq2 = pF1KB6140/gi568815579f_19365346.tfa (gi568815579f:19365346_19605471), 240126 bp

>pF1KB6140 1902
>gi568815579f:19365346_19605471 (Chr19)

1-269  (100001-100269)   100% ->
270-402  (126961-127093)   100% ->
403-534  (127236-127367)   100% ->
535-624  (128949-129038)   100% ->
625-756  (130409-130540)   100% ->
757-924  (130707-130874)   100% ->
925-1204  (133098-133377)   100% ->
1205-1503  (135773-136071)   100% ->
1504-1578  (136624-136698)   100% ->
1579-1774  (136986-137181)   100% ->
1775-1902  (139999-140126)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCGAAGAAGCATGCCGAACACGGAGTCAGAAACGAGCGCTTGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCGAAGAAGCATGCCGAACACGGAGTCAGAAACGAGCGCTTGAACG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACCCAACAGAGGACGATGTGGAGAGCAAGAAAATAAAAATGGAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGACCCAACAGAGGACGATGTGGAGAGCAAGAAAATAAAAATGGAGAGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GATTGTTGGCTTCAGATTTAAACACTGACGGAGACATGAGGGTGACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GATTGTTGGCTTCAGATTTAAACACTGACGGAGACATGAGGGTGACACCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGCCGGGAGCAGGTCCAACCCAAGGATTGCTGAGGGCAACAGAGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGCCGGGAGCAGGTCCAACCCAAGGATTGCTGAGGGCAACAGAGGCCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCCATGGCCATGGGCAGAGGCGAAGGGCTGGTGGGCGATGGGCCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCCATGGCCATGGGCAGAGGCGAAGGGCTGGTGGGCGATGGGCCCGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACATGCGCACCTCACACAG         TGACATGAAGTCCGAGAGGAGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100251 ACATGCGCACCTCACACAGGTG...CAGTGACATGAAGTCCGAGAGGAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCCCCCTCACCTGACGTGATTGTGCTCTCCGACAACGAGCAGCCCTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126983 CCCCCCTCACCTGACGTGATTGTGCTCTCCGACAACGAGCAGCCCTCGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCCGAGAGTGAATGGGCTGACCACGGTGGCCTTGAAGGAGACTAGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127033 CCCGAGAGTGAATGGGCTGACCACGGTGGCCTTGAAGGAGACTAGCACCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGGCCCTCATG         AAAAGCAGTCCTGAAGAACGAGAAAGGATG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 127083 AGGCCCTCATGGTG...CAGAAAAGCAGTCCTGAAGAACGAGAAAGGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATCAAGCAGCTGAAGGAAGAATTGAGGTTAGAAGAAGCAAAACTCGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127266 ATCAAGCAGCTGAAGGAAGAATTGAGGTTAGAAGAAGCAAAACTCGTGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTTGAAAAAGTTGCGGCAGAGTCAAATACAAAAGGAAGCCACCGCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127316 GTTGAAAAAGTTGCGGCAGAGTCAAATACAAAAGGAAGCCACCGCCCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AG         CCCACAGGTTCTGTTGGGAGCACCGTGACCACCCCTCCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127366 AGGTG...CAGCCCACAGGTTCTGTTGGGAGCACCGTGACCACCCCTCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CCGCTTGTTCGGGGCACTCAGAACATTCCTGCTGGCAAGCCATCACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128988 CCGCTTGTTCGGGGCACTCAGAACATTCCTGCTGGCAAGCCATCACTCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 G         ACCTCTTCAGCTCGGATGCCCGGCAGTGTCATACCCCCGC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129038 GGTC...CAGACCTCTTCAGCTCGGATGCCCGGCAGTGTCATACCCCCGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCCTGGTCCGAGGTGGGCAGCAGGCGTCCTCGAAGCTGGGGCCACAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130449 CCCTGGTCCGAGGTGGGCAGCAGGCGTCCTCGAAGCTGGGGCCACAGGCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AGCTCACAGGTCGTCATGCCCCCACTCGTCAGGGGGGCTCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 130499 AGCTCACAGGTCGTCATGCCCCCACTCGTCAGGGGGGCTCAGGTA...CA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    757  CAAATCCACAGCATTAGGCAACATTCCAGCACAGGGCCACCGCCCCTCC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130706 GCAAATCCACAGCATTAGGCAACATTCCAGCACAGGGCCACCGCCCCTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCCTGGCCCCCCGGGCGTCGGTGCCCAGTGTGCAGATTCAGGGACAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130756 TCCTGGCCCCCCGGGCGTCGGTGCCCAGTGTGCAGATTCAGGGACAGAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ATCATCCAGCAGGGCCTCATCCGCGTCGCCAATGTTCCCAACACCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130806 ATCATCCAGCAGGGCCTCATCCGCGTCGCCAATGTTCCCAACACCAGCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCTCGTCAACATCCCACAG         CCCACCCCAGCATCACTGAAGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 130856 GCTCGTCAACATCCCACAGGTG...AAGCCCACCCCAGCATCACTGAAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GGACAACAGCCACCTCCGCTCAGGCCAACTCCACCCCCACTAGTGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133120 GGACAACAGCCACCTCCGCTCAGGCCAACTCCACCCCCACTAGTGTGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TCTGTGGTCACCTCTGCCGAGTCTCCAGCAAGCCGACAGGCGGCCGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133170 TCTGTGGTCACCTCTGCCGAGTCTCCAGCAAGCCGACAGGCGGCCGCCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GCTGGCGCTGCGCAAACAGCTGGAGAAGACGCTACTCGAGATCCCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133220 GCTGGCGCTGCGCAAACAGCTGGAGAAGACGCTACTCGAGATCCCCCCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CCAAGCCCCCAGCCCCAGAGATGAACTTCCTGCCCAGCGCCGCCAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133270 CCAAGCCCCCAGCCCCAGAGATGAACTTCCTGCCCAGCGCCGCCAACAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GAGTTCATCTACCTGGTCGGCCTGGAGGAGGTGGTGCAGAACCTACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133320 GAGTTCATCTACCTGGTCGGCCTGGAGGAGGTGGTGCAGAACCTACTGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GACACAAG         CAGGCAGGATGTCGGCCGCCACTGTGCTGTCCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 133370 GACACAAGGTG...CAGCAGGCAGGATGTCGGCCGCCACTGTGCTGTCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GGGAGCCCTACATGTGTGCACAGTGCAAGACGGACTTCACGTGCCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135806 GGGAGCCCTACATGTGTGCACAGTGCAAGACGGACTTCACGTGCCGCTGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CGGGAGGAGAAGAGCGGCGCCATCATGTGTGAGAACTGCATGACAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135856 CGGGAGGAGAAGAGCGGCGCCATCATGTGTGAGAACTGCATGACAACCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CCAGAAGAAGGCGCTCAAGGTGGAGCACACCAGCCGGCTGAAGGCCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135906 CCAGAAGAAGGCGCTCAAGGTGGAGCACACCAGCCGGCTGAAGGCCGCCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TTGTGAAGGCGCTGCAGCAGGAACAGGAGATTGAGCAGCGGCTCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135956 TTGTGAAGGCGCTGCAGCAGGAACAGGAGATTGAGCAGCGGCTCCTGCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 CAGGGCACGGCCCCTGCACAGGCCAAGGCCGAGCCCACCGCTGCCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136006 CAGGGCACGGCCCCTGCACAGGCCAAGGCCGAGCCCACCGCTGCCCCACA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CCCCGTGCTGAAGCAG         GTCATAAAACCCCGGCGTAAGTTGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 136056 CCCCGTGCTGAAGCAGGTG...TAGGTCATAAAACCCCGGCGTAAGTTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 CGTTCCGCTCAGGAGAGGCCCGCGACTGGAGTAACGGGGCTGTGCTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136649 CGTTCCGCTCAGGAGAGGCCCGCGACTGGAGTAACGGGGCTGTGCTACAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579          GCCTCCAGCCAGCTGTCCCGGGGTTCGGCCACGACGCCCCG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136699 GTC...CAGGCCTCCAGCCAGCTGTCCCGGGGTTCGGCCACGACGCCCCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 AGGTGTCCTGCACACGTTCAGTCCGTCACCCAAACTGCAGAACTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137027 AGGTGTCCTGCACACGTTCAGTCCGTCACCCAAACTGCAGAACTCAGCCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 CGGCCACAGCCCTGGTCAGCAGGACCGGCAGACATTCTGAGAGAACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137077 CGGCCACAGCCCTGGTCAGCAGGACCGGCAGACATTCTGAGAGAACCGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 AGCGCCGGCAAGGGCAGCGCCACCTCCAACTGGAAGAAGACGCCCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137127 AGCGCCGGCAAGGGCAGCGCCACCTCCAACTGGAAGAAGACGCCCCTCAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 CACAG         GCGGGACCCTTGCGTTTGTCAGCCCAAGCCTGGCGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137177 CACAGGTG...CAGGCGGGACCCTTGCGTTTGTCAGCCCAAGCCTGGCGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 TGCACAAGAGCTCCTCGGCCGTGGACCGCCAGCGAGAGTACCTCCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140035 TGCACAAGAGCTCCTCGGCCGTGGACCGCCAGCGAGAGTACCTCCTGGAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 ATGATCCCACCCCGCTCCATCCCCCAGTCAGCCACGTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140085 ATGATCCCACCCCGCTCCATCCCCCAGTCAGCCACGTGGAAA