seq1 = pF1KB6129.tfa, 1761 bp
seq2 = pF1KB6129/gi568815578r_33259046.tfa (gi568815578r:33259046_33497064), 238019 bp

>pF1KB6129 1761
>gi568815578r:33259046_33497064 (Chr20)

(complement)

1-304  (100001-100304)   100% ->
305-408  (101949-102052)   100% ->
409-443  (102999-103033)   100% ->
444-544  (104823-104923)   100% ->
545-755  (109532-109742)   100% ->
756-876  (111295-111415)   100% ->
877-1107  (117374-117604)   100% ->
1108-1205  (122853-122950)   100% ->
1206-1261  (124368-124423)   100% ->
1262-1392  (126436-126566)   100% ->
1393-1542  (130057-130206)   100% ->
1543-1683  (136574-136714)   100% ->
1684-1761  (137942-138019)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACCCTTTACAGTGTGTCCTCCAAGTGCAGAGGTCTCTGGGGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACCCTTTACAGTGTGTCCTCCAAGTGCAGAGGTCTCTGGGGTGGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCATTGGCCTCTGTGTCTTGGCTGTCGCTGAGGATGTGCAGGGCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCATTGGCCTCTGTGTCTTGGCTGTCGCTGAGGATGTGCAGGGCACACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGTCTCTCTAGTACCATGTGTCCCAGTCCAGAGAGGCAGGAGGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAGTCTCTCTAGTACCATGTGTCCCAGTCCAGAGAGGCAGGAGGATGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTCGGAAGGATTTCAGCTCCAGGCTGGCTGCTGGACCGACTTTTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTCGGAAGGATTTCAGCTCCAGGCTGGCTGCTGGACCGACTTTTCAACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTTTTAAAAAGTGCCTCAGCTCCTCAGGAGAAGCTGTCTTCAGAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTTTTAAAAAGTGCCTCAGCTCCTCAGGAGAAGCTGTCTTCAGAAGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAGACCCACCTCCCTATCTCATGATGGATGAACTTCTTGGAAGGCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AAGACCCACCTCCCTATCTCATGATGGATGAACTTCTTGGAAGGCAGAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAAG         TCTACCTCGAGACCTATGGCTGCCAGATGAATGTGAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAAGGTT...CAGTCTACCTCGAGACCTATGGCTGCCAGATGAATGTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGACACAGAGATAGCCTGGTCCATCTTACAGAAGAGTGGCTACCTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101986 TGACACAGAGATAGCCTGGTCCATCTTACAGAAGAGTGGCTACCTGCGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCAGTAACCTCCAAGAG         GCAGATGTGATTCTCCTTGTCACA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102036 CCAGTAACCTCCAAGAGGTA...CAGGCAGATGTGATTCTCCTTGTCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGCTCTATCAG         GGAGAAGGCTGAGCAGACCATCTGGAACCG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 103023 TGCTCTATCAGGTG...TAGGGAGAAGGCTGAGCAGACCATCTGGAACCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TTTACATCAGCTTAAAGCCTTGAAGACAAGGCGGCCCCGCTCCCGGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104853 TTTACATCAGCTTAAAGCCTTGAAGACAAGGCGGCCCCGCTCCCGGGTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTCTGAGGATTGGAATTCTAG         GCTGCATGGCTGAGAGGTTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 104903 CTCTGAGGATTGGAATTCTAGGTA...CAGGCTGCATGGCTGAGAGGTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAGGAGGAGATTCTCAACAGAGAGAAAATGGTAGATATTTTGGCTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109552 AAGGAGGAGATTCTCAACAGAGAGAAAATGGTAGATATTTTGGCTGGTCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGATGCCTACCGGGACCTTCCCCGGCTGCTGGCTGTTGCTGAGTCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109602 TGATGCCTACCGGGACCTTCCCCGGCTGCTGGCTGTTGCTGAGTCGGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGCAAGCTGCCAACGTGCTGCTCTCTCTGGACGAGACCTATGCTGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109652 AGCAAGCTGCCAACGTGCTGCTCTCTCTGGACGAGACCTATGCTGATGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATGCCAGTCCAGACAAGCGCCAGTGCCACGTCTGCCTTTGT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 109702 ATGCCAGTCCAGACAAGCGCCAGTGCCACGTCTGCCTTTGTGTG...CAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GTCAATCATGCGAGGCTGTGACAACATGTGTAGCTACTGCATTGTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111295 GTCAATCATGCGAGGCTGTGACAACATGTGTAGCTACTGCATTGTTCCTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCACCCGGGGCAGGGAGAGGAGTCGGCCTATTGCCTCCATTCTAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111345 TCACCCGGGGCAGGGAGAGGAGTCGGCCTATTGCCTCCATTCTAGAGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GTGAAGAAGCTTTCTGAGCAG         GGGCTGAAAGAAGTGACACT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 111395 GTGAAGAAGCTTTCTGAGCAGGTG...TAGGGGCTGAAAGAAGTGACACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TCTTGGTCAGAATGTTAATAGTTTTCGGGACAATTCGGAGGTCCAGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117394 TCTTGGTCAGAATGTTAATAGTTTTCGGGACAATTCGGAGGTCCAGTTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACAGTGCAGTGCCTACCAATCTCAGTCGTGGCTTTACCACCAACTATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117444 ACAGTGCAGTGCCTACCAATCTCAGTCGTGGCTTTACCACCAACTATAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ACCAAGCAAGGAGGACTTCGTTTTGCTCATCTTCTGGATCAGGTCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117494 ACCAAGCAAGGAGGACTTCGTTTTGCTCATCTTCTGGATCAGGTCTCCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGTAGATCCTGAAATGAGGATCCGTTTTACCTCTCCCCACCCCAAGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117544 AGTAGATCCTGAAATGAGGATCCGTTTTACCTCTCCCCACCCCAAGGATT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TTCCTGATGAG         GTTCTGCAGCTGATTCATGAGAGAGATAAC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 117594 TTCCTGATGAGGTG...CAGGTTCTGCAGCTGATTCATGAGAGAGATAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ATCTGTAAACAGATCCACCTGCCAGCCCAGAGTGGAAGCAGCCGTGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122883 ATCTGTAAACAGATCCACCTGCCAGCCCAGAGTGGAAGCAGCCGTGTGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGAGGCCATGCGGAGGGG         ATATTCAAGAGAAGCTTATGTGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 122933 GGAGGCCATGCGGAGGGGGTC...CAGATATTCAAGAGAAGCTTATGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AGTTAGTTCACCATATTAGAGAATCTATTCCAG         GTGTGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 124391 AGTTAGTTCACCATATTAGAGAATCTATTCCAGGTA...CAGGTGTGAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CTCAGCAGCGATTTCATTGCTGGCTTTTGTGGTGAGACGGAGGAAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126444 CTCAGCAGCGATTTCATTGCTGGCTTTTGTGGTGAGACGGAGGAAGATCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CGTCCAGACAGTCTCTTTGCTCCGGGAAGTTCAGTACAACATGGGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126494 CGTCCAGACAGTCTCTTTGCTCCGGGAAGTTCAGTACAACATGGGCTTCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TCTTTGCCTACAGCATGAGACAG         AAGACACGGGCATATCAT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 126544 TCTTTGCCTACAGCATGAGACAGGTG...TAGAAGACACGGGCATATCAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AGGCTGAAGGATGATGTCCCGGAAGAGGTAAAATTAAGGCGTTTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130075 AGGCTGAAGGATGATGTCCCGGAAGAGGTAAAATTAAGGCGTTTGGAGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 ACTCATCACTATCTTCCGAGAAGAAGCAACAAAAGCCAATCAGACCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130125 ACTCATCACTATCTTCCGAGAAGAAGCAACAAAAGCCAATCAGACCTCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TGGGCTGTACCCAGTTGGTGCTAGTGGAAGGG         CTCAGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 130175 TGGGCTGTACCCAGTTGGTGCTAGTGGAAGGGGTG...CAGCTCAGTAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CGCTCTGCCACTGACCTGTGTGGCAGGAATGATGGAAACCTTAAGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136583 CGCTCTGCCACTGACCTGTGTGGCAGGAATGATGGAAACCTTAAGGTGAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CTTCCCTGATGCAGAGATGGAGGATGTCAATAACCCTGGGCTCAGGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136633 CTTCCCTGATGCAGAGATGGAGGATGTCAATAACCCTGGGCTCAGGGTCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 GAGCCCAGCCTGGGGACTATGTGCTGGTGAAG         ATCACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 136683 GAGCCCAGCCTGGGGACTATGTGCTGGTGAAGGTG...CAGATCACCTCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GCCAGTTCTCAGACACTTAGGGGACATGTTCTCTGCAGGACCACTCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137951 GCCAGTTCTCAGACACTTAGGGGACATGTTCTCTGCAGGACCACTCTGAG

   1850     .    :    .
   1743 GGACTCTTCTGCATATTGC
        |||||||||||||||||||
 138001 GGACTCTTCTGCATATTGC