seq1 = pF1KB6120.tfa, 1749 bp
seq2 = pF1KB6120/gi568815587r_110131872.tfa (gi568815587r:110131872_110372619), 240748 bp

>pF1KB6120 1749
>gi568815587r:110131872_110372619 (Chr11)

(complement)

13-96  (100001-100084)   100% ->
97-192  (107746-107841)   100% ->
193-467  (108386-108660)   100% ->
468-551  (114431-114514)   100% ->
552-698  (114707-114853)   100% ->
699-795  (117235-117331)   100% ->
796-959  (118511-118674)   100% ->
960-1090  (124787-124917)   100% ->
1091-1251  (134968-135128)   100% ->
1252-1344  (136429-136521)   100% ->
1345-1587  (139141-139383)   100% ->
1588-1749  (140587-140748)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     13 ATCAACGTAAGAGTAACTACAATGGATGCTGAGCTGGAATTTGCCATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATCAACGTAAGAGTAACTACAATGGATGCTGAGCTGGAATTTGCCATTCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     63 GCCCAATACAACTGGCAAACAACTTTTTGACCAG         GTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100051 GCCCAATACAACTGGCAAACAACTTTTTGACCAGGTA...TAGGTGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    104 AAACAGTTGGTTTGCGTGAGGTCTGGTTTTTTGGGCTGCAGTATGTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107753 AAACAGTTGGTTTGCGTGAGGTCTGGTTTTTTGGGCTGCAGTATGTAGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    154 AGCAAAGGTTATTCTACATGGCTTAAACTAAATAAAAAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 107803 AGCAAAGGTTATTCTACATGGCTTAAACTAAATAAAAAGGTA...CAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    195 AACACAGCAGGATGTTAAAAAAGAGAATCCTTTACAGTTCAAGTTTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108388 AACACAGCAGGATGTTAAAAAAGAGAATCCTTTACAGTTCAAGTTTAGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    245 CTAAATTCTTTCCTGAAGATGTTTCTGAGGAATTAATTCAAGAAATAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108438 CTAAATTCTTTCCTGAAGATGTTTCTGAGGAATTAATTCAAGAAATAACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    295 CAGAGACTCTTCTTCTTGCAAGTTAAAGAAGCCATCTTAAATGATGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108488 CAGAGACTCTTCTTCTTGCAAGTTAAAGAAGCCATCTTAAATGATGAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    345 ATATTGCCCGCCAGAAACTGCAGTTCTTTTGGCTTCCTATGCTGTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108538 ATATTGCCCGCCAGAAACTGCAGTTCTTTTGGCTTCCTATGCTGTCCAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    395 CCAAGTATGGAGATTACAATAAAGAGATTCATAAGCCAGGCTACCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108588 CCAAGTATGGAGATTACAATAAAGAGATTCATAAGCCAGGCTACCTGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    445 AATGATAGACTCCTACCCCAGCG         TGTATTGGAACAACACAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 108638 AATGATAGACTCCTACCCCAGCGGTA...TAGTGTATTGGAACAACACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    486 ACTAACAAAAGAACAGTGGGAAGAAAGAATACAGAACTGGCATGAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114449 ACTAACAAAAGAACAGTGGGAAGAAAGAATACAGAACTGGCATGAAGAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    536 ATAGAGGAATGTTAAG         GGAGGATTCTATGATGGAATACCTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 114499 ATAGAGGAATGTTAAGGTA...CAGGGAGGATTCTATGATGGAATACCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    577 AAGATTGCACAAGATCTAGAAATGTATGGAGTCAACTATTTTGAAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114732 AAGATTGCACAAGATCTAGAAATGTATGGAGTCAACTATTTTGAAATAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    627 AAATAAAAAAGGAACTGAATTGTGGCTAGGTGTTGATGCTTTGGGTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114782 AAATAAAAAAGGAACTGAATTGTGGCTAGGTGTTGATGCTTTGGGTCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    677 ATATTTATGAGCATGACGACAA         GTTAACACCTAAAATTGGT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 114832 ATATTTATGAGCATGACGACAAGTA...AAGGTTAACACCTAAAATTGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    718 TTTCCCTGGAGTGAAATCAGAAATATTTCATTTAATGACAAAAAATTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117254 TTTCCCTGGAGTGAAATCAGAAATATTTCATTTAATGACAAAAAATTTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    768 TATAAAGCCAATCGACAAAAAGGCACCT         GATTTTGTGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 117304 TATAAAGCCAATCGACAAAAAGGCACCTGTA...TAGGATTTTGTGTTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    809 ATGCACCTCGTCTGAGAATCAATAAGCGGATTTTGGCCTTATGTATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118524 ATGCACCTCGTCTGAGAATCAATAAGCGGATTTTGGCCTTATGTATGGGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    859 AACCATGAACTATACATGCGAAGAAGGAAGCCTGATACTATTGAAGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118574 AACCATGAACTATACATGCGAAGAAGGAAGCCTGATACTATTGAAGTACA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    909 ACAGATGAAGGCTCAGGCTAGGGAGGAGAAACATCAGAAGCAGTTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118624 ACAGATGAAGGCTCAGGCTAGGGAGGAGAAACATCAGAAGCAGTTGGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    959 G         GGCACAATTAGAGAATGAAAAGAAGAAAAGAGAAATAGCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118674 GGTA...AAGGGCACAATTAGAGAATGAAAAGAAGAAAAGAGAAATAGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1000 GAAAAGGAAAAGGAAAGAATAGAACGTGAAAAGGAAGAGCTAATGGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124827 GAAAAGGAAAAGGAAAGAATAGAACGTGAAAAGGAAGAGCTAATGGAACG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1050 TCTAAAACAAATTGAAGAGCAGACAATTAAAGCTCAGAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 124877 TCTAAAACAAATTGAAGAGCAGACAATTAAAGCTCAGAAAGGTA...TAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1091 AACTAGAAGAACAGACTCGAAAAGCTCTAGAACTGGATCAAGAACGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134968 AACTAGAAGAACAGACTCGAAAAGCTCTAGAACTGGATCAAGAACGAAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1141 CGAGCAAAAGAAGAAGCAGAACGACTTGAAAAGGAGCGTCGAGCTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135018 CGAGCAAAAGAAGAAGCAGAACGACTTGAAAAGGAGCGTCGAGCTGCTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1191 AGAGGCAAAGTCTGCCATAGCAAAACAAGCTGCCGACCAGATGAAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135068 AGAGGCAAAGTCTGCCATAGCAAAACAAGCTGCCGACCAGATGAAGAATC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1241 AGGAGCAGCTA         GCAGCAGAACTTGCTGAATTCACTGCCAAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 135118 AGGAGCAGCTAGTA...TAGGCAGCAGAACTTGCTGAATTCACTGCCAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1282 ATTGCACTTCTAGAGGAAGCCAAGAAGAAAAAGGAAGAGGAAGCTACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136459 ATTGCACTTCTAGAGGAAGCCAAGAAGAAAAAGGAAGAGGAAGCTACTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1332 GTGGCAACACAAA         GCTTTTGCAGCCCAGGAAGACTTGGAAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 136509 GTGGCAACACAAAGTA...CAGGCTTTTGCAGCCCAGGAAGACTTGGAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1373 AGACCAAAGAAGAGTTAAAAACTGTGATGTCTGCCCCCCCTCCACCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139169 AGACCAAAGAAGAGTTAAAAACTGTGATGTCTGCCCCCCCTCCACCTCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1423 CCACCACCAGTCATTCCTCCAACAGAAAACGAACATGATGAACACGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139219 CCACCACCAGTCATTCCTCCAACAGAAAACGAACATGATGAACACGATGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1473 GAATAATGCTGAAGCTAGTGCTGAATTATCAAATGAAGGGGTAATGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139269 GAATAATGCTGAAGCTAGTGCTGAATTATCAAATGAAGGGGTAATGAACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1523 ATAGAAGCGAGGAAGAACGTGTAACCGAAACACAGAAAAATGAGCGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139319 ATAGAAGCGAGGAAGAACGTGTAACCGAAACACAGAAAAATGAGCGTGTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1573 AAGAAGCAACTTCAG         GCATTAAGTTCAGAATTAGCCCAAGC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 139369 AAGAAGCAACTTCAGGTA...TAGGCATTAAGTTCAGAATTAGCCCAAGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1614 CAGAGATGAAACCAAGAAAACACAAAATGATGTTCTTCATGCTGAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140613 CAGAGATGAAACCAAGAAAACACAAAATGATGTTCTTCATGCTGAGAATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1664 TTAAAGCAGGCCGTGATAAGTACAAGACTCTGCGACAGATTCGACAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140663 TTAAAGCAGGCCGTGATAAGTACAAGACTCTGCGACAGATTCGACAAGGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .
   1714 AATACAAAGCAGCGTATCGATGAGTTTGAAGCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140713 AATACAAAGCAGCGTATCGATGAGTTTGAAGCAATG