seq1 = pF1KB6117.tfa, 1863 bp
seq2 = pF1KB6117/gi568815580r_46712436.tfa (gi568815580r:46712436_46991055), 278620 bp

>pF1KB6117 1863
>gi568815580r:46712436_46991055 (Chr18)

(complement)

1-24  (73711-73734)   100% ->
25-499  (100002-100476)   100% ->
500-584  (126808-126892)   100% ->
585-635  (135441-135491)   100% ->
636-726  (135621-135711)   100% ->
727-861  (144215-144349)   100% ->
862-967  (146217-146322)   100% ->
968-1041  (146929-147002)   100% ->
1042-1202  (154539-154699)   100% ->
1203-1336  (161189-161322)   100% ->
1337-1508  (162926-163097)   100% ->
1509-1648  (169984-170123)   100% ->
1649-1686  (175707-175744)   100% ->
1687-1863  (178444-178620)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGATTTCGAAGAGTTGAGG         AATATGGTTTCTAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  73711 ATGGCGGATTTCGAAGAGTTGAGGGTA...TAGAATATGGTTTCTAGTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TAGGGTTTCTGAACTACAAGTATTACTAGGCTTTGCTGGACGGAATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 TAGGGTTTCTGAACTACAAGTATTACTAGGCTTTGCTGGACGGAATAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGGACGCAAGCATGACCTCCTGATGAGGGCGCTGCATTTATTGAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100069 GTGGACGCAAGCATGACCTCCTGATGAGGGCGCTGCATTTATTGAAGAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCTGCAGCCCTGCGGTTCAGATTAAAATCCGAGAATTGTATAGACGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100119 GGCTGCAGCCCTGCGGTTCAGATTAAAATCCGAGAATTGTATAGACGCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATATCCACGAACTCTTGAAGGACTTTCTGATTTATCCACAATCAAATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100169 ATATCCACGAACTCTTGAAGGACTTTCTGATTTATCCACAATCAAATCAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGGTTTTCAGTTTGGATGGTGGCTCATCACCTGTAGAACCTGACTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100219 CGGTTTTCAGTTTGGATGGTGGCTCATCACCTGTAGAACCTGACTTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGGCTGGAATCCACTCGTTGCCTTCCACTTCAGTTACACCTCACTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100269 GTGGCTGGAATCCACTCGTTGCCTTCCACTTCAGTTACACCTCACTCACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ATCCTCTCCTGTTGGTTCTGTGCTGCTTCAAGATACTAAGCCCACATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100319 ATCCTCTCCTGTTGGTTCTGTGCTGCTTCAAGATACTAAGCCCACATTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGATGCAGCAGCCATCTCCCCCAATTCCTCCTGTCCATCCTGATGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100369 AGATGCAGCAGCCATCTCCCCCAATTCCTCCTGTCCATCCTGATGTGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTAAAAAATCTGCCCTTTTATGATGTCCTTGATGTTCTCATCAAGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100419 TTAAAAAATCTGCCCTTTTATGATGTCCTTGATGTTCTCATCAAGCCCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GAGTTTAG         TTCAAAGCAGTATTCAGCGATTTCAAGAGAAGT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100469 GAGTTTAGGTA...CAGTTCAAAGCAGTATTCAGCGATTTCAAGAGAAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTTTTATTTTTGCTTTGACACCTCAACAAGTTAGAGAGATATGCATATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126841 TTTTTATTTTTGCTTTGACACCTCAACAAGTTAGAGAGATATGCATATCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AG         GGATTTTTTGCCAGGTGGTAGGAGAGATTATACAGTCCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126891 AGGTA...CAGGGATTTTTTGCCAGGTGGTAGGAGAGATTATACAGTCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGTTCAGTTGAG         ACTTTGCCTGGCAGAGACAAGTTGCCCTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 135480 AGTTCAGTTGAGGTG...CAGACTTTGCCTGGCAGAGACAAGTTGCCCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAGAAGATAACTATCCAAATAGTCTATGTATAAAAGTAAATGGGAAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135650 AAGAAGATAACTATCCAAATAGTCTATGTATAAAAGTAAATGGGAAGCTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTTCCTTTGCCT         GGCTATGCACCACCGCCTAAAAATGGGAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 135700 TTTCCTTTGCCTGTA...TAGGGCTATGCACCACCGCCTAAAAATGGGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGAACAGAAGCGCCCTGGACGCCCCTTGAATATTACATCTTTAGTTAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144244 TGAACAGAAGCGCCCTGGACGCCCCTTGAATATTACATCTTTAGTTAGGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TATCTTCAGCTGTGCCAAACCAAATTTCCATTTCTTGGGCATCAGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144294 TATCTTCAGCTGTGCCAAACCAAATTTCCATTTCTTGGGCATCAGAAATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GGGAAG         AATTACTCTATGTCTGTATATCTTGTACGGCAGCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144344 GGGAAGGTA...TAGAATTACTCTATGTCTGTATATCTTGTACGGCAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TACATCAGCCATGTTATTACAGAGATTAAAAATGAAAGGTATTAGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146252 TACATCAGCCATGTTATTACAGAGATTAAAAATGAAAGGTATTAGAAACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTGATCATTCCAGAGCACTAA         TTAAAGAAAAACTTACTGCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 146302 CTGATCATTCCAGAGCACTAAGTA...AAGTTAAAGAAAAACTTACTGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GATCCTGATAGTGAAATTGCTACAACTAGCCTTCGGGTATCCTTGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146949 GATCCTGATAGTGAAATTGCTACAACTAGCCTTCGGGTATCCTTGATGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CCCT         TTAGGAAAAATGAGGCTGACAATCCCATGCCGTGCAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146999 CCCTGTA...TAGTTAGGAAAAATGAGGCTGACAATCCCATGCCGTGCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGACTTGTACACATCTGCAGTGTTTTGATGCTGCCCTCTATCTACAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154576 TGACTTGTACACATCTGCAGTGTTTTGATGCTGCCCTCTATCTACAAATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AATGAGAAAAAGCCCACCTGGATTTGTCCTGTGTGTGACAAAAAAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154626 AATGAGAAAAAGCCCACCTGGATTTGTCCTGTGTGTGACAAAAAAGCTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CTATGAAAGTCTAATATTAGATGG         GCTTTTTATGGAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 154676 CTATGAAAGTCTAATATTAGATGGGTA...TAGGCTTTTTATGGAAATTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TCAATGACTGTTCTGATGTAGATGAGATCAAATTCCAAGAAGATGGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161206 TCAATGACTGTTCTGATGTAGATGAGATCAAATTCCAAGAAGATGGTTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TGGTGTCCAATGAGACCGAAGAAAGAAGCTATGAAAGTATCCAGCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161256 TGGTGTCCAATGAGACCGAAGAAAGAAGCTATGAAAGTATCCAGCCAACC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GTGTACAAAAATAGAAA         GTTCAAGCGTCCTCAGTAAGCCTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 161306 GTGTACAAAAATAGAAAGTA...CAGGTTCAAGCGTCCTCAGTAAGCCTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GTTCAGTGACTGTAGCCAGTGAGGCAAGCAAGAAGAAAGTAGATGTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162950 GTTCAGTGACTGTAGCCAGTGAGGCAAGCAAGAAGAAAGTAGATGTTATT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GATCTTACAATAGAAAGCTCTTCTGACGAAGAGGAAGACCCTCCTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163000 GATCTTACAATAGAAAGCTCTTCTGACGAAGAGGAAGACCCTCCTGCCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AAGGAAATGCATCTTTATGTCAGAAACACAAAGCAGCCCAACCAAAGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 163050 AAGGAAATGCATCTTTATGTCAGAAACACAAAGCAGCCCAACCAAAGGGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1509        GGTTCTCATGTATCAGCCATCTTCTGTAAGGGTGCCCAGTGTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163100 T...CAGGGTTCTCATGTATCAGCCATCTTCTGTAAGGGTGCCCAGTGTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 ACTTCGGTTGATCCTGCTGCTATTCCGCCTTCATTAACAGACTACTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170027 ACTTCGGTTGATCCTGCTGCTATTCCGCCTTCATTAACAGACTACTCAGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 ACCATTCCACCATACGCCAATATCAAGCATGTCATCAGATTTGCCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 170077 ACCATTCCACCATACGCCAATATCAAGCATGTCATCAGATTTGCCAGGTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1649       GTTTGGATTTTCTTTCCCTTATTCCAGTTGATCCCCAG      
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 170127 ...TAGGTTTGGATTTTCTTTCCCTTATTCCAGTTGATCCCCAGGTA...

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1687    TACTGTCCTCCTATGTTTTTGGATAGTCTCACCTCACCCTTAACAGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178441 CAGTACTGTCCTCCTATGTTTTTGGATAGTCTCACCTCACCCTTAACAGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 AAGCAGTACGTCTGTCACCACCACCAGCTCCCATGAAAGCAGTACTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178491 AAGCAGTACGTCTGTCACCACCACCAGCTCCCATGAAAGCAGTACTCATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TTAGTTCATCCAGCAGCAGGAGTGAGACAGGGGTCATAACCAGCAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178541 TTAGTTCATCCAGCAGCAGGAGTGAGACAGGGGTCATAACCAGCAGTGGA

   1950     .    :    .    :    .    :
   1834 AGTAACATTCCTGACATCATCTCATTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 178591 AGTAACATTCCTGACATCATCTCATTGGAC