seq1 = pF1KB6115.tfa, 1860 bp
seq2 = pF1KB6115/gi568815593r_1300915.tfa (gi568815593r:1300915_1543197), 242283 bp

>pF1KB6115 1860
>gi568815593r:1300915_1543197 (Chr5)

(complement)

1-286  (100001-100286)   100% ->
287-418  (101708-101839)   100% ->
419-653  (110500-110734)   100% ->
654-792  (121184-121322)   100% ->
793-927  (122495-122629)   100% ->
928-1031  (126997-127100)   100% ->
1032-1156  (128383-128507)   100% ->
1157-1269  (131843-131955)   100% ->
1270-1398  (133349-133477)   100% ->
1399-1498  (134073-134172)   100% ->
1499-1599  (136910-137010)   100% ->
1600-1767  (140109-140276)   100% ->
1768-1839  (142212-142283)   100% ->
1840-1860  (148440-148460)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTAAGAGCAAATGCTCCGTGGGACTCATGTCTTCCGTGGTGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTAAGAGCAAATGCTCCGTGGGACTCATGTCTTCCGTGGTGGCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTAAGGAGCCCAATGCCGTGGGCCCGAAGGAGGTGGAGCTCATCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTAAGGAGCCCAATGCCGTGGGCCCGAAGGAGGTGGAGCTCATCCTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAAGGAGCAGAACGGAGTGCAGCTCACCAGCTCCACCCTCACCAACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCAAGGAGCAGAACGGAGTGCAGCTCACCAGCTCCACCCTCACCAACCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGCAGAGCCCCGTGGAGGCCCAGGATCGGGAGACCTGGGGCAAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGCAGAGCCCCGTGGAGGCCCAGGATCGGGAGACCTGGGGCAAGAAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGACTTTCTCCTGTCCGTCATTGGCTTTGCTGTGGACCTGGCCAACGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGACTTTCTCCTGTCCGTCATTGGCTTTGCTGTGGACCTGGCCAACGTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCGGTTCCCCTACCTGTGCTACAAAAATGGTGGCG         GTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100251 GGCGGTTCCCCTACCTGTGCTACAAAAATGGTGGCGGTA...CAGGTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCCTGGTCCCCTACCTGCTCTTCATGGTCATTGCTGGGATGCCACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101713 TTCCTGGTCCCCTACCTGCTCTTCATGGTCATTGCTGGGATGCCACTTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTACATGGAGCTGGCCCTCGGCCAGTTCAACAGGGAAGGGGCCGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101763 CTACATGGAGCTGGCCCTCGGCCAGTTCAACAGGGAAGGGGCCGCTGGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCTGGAAGATCTGCCCCATACTGAAAG         GTGTGGGCTTCACG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101813 TCTGGAAGATCTGCCCCATACTGAAAGGTA...TAGGTGTGGGCTTCACG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTCATCCTCATCTCACTGTATGTCGGCTTCTTCTACAACGTCATCATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110514 GTCATCCTCATCTCACTGTATGTCGGCTTCTTCTACAACGTCATCATCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTGGGCGCTGCACTATCTCTTCTCCTCCTTCACCACGGAGCTCCCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110564 CTGGGCGCTGCACTATCTCTTCTCCTCCTTCACCACGGAGCTCCCCTGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCCACTGCAACAACTCCTGGAACAGCCCCAACTGCTCGGATGCCCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110614 TCCACTGCAACAACTCCTGGAACAGCCCCAACTGCTCGGATGCCCATCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGTGACTCCAGTGGAGACAGCTCGGGCCTCAACGACACTTTTGGGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110664 GGTGACTCCAGTGGAGACAGCTCGGGCCTCAACGACACTTTTGGGACCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 ACCTGCTGCCGAGTACTTTGA         ACGTGGCGTGCTGCACCTCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 110714 ACCTGCTGCCGAGTACTTTGAGTA...CAGACGTGGCGTGCTGCACCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACCAGAGCCATGGCATCGACGACCTGGGGCCTCCGCGGTGGCAGCTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121204 ACCAGAGCCATGGCATCGACGACCTGGGGCCTCCGCGGTGGCAGCTCACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GCCTGCCTGGTGCTGGTCATCGTGCTGCTCTACTTCAGCCTCTGGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121254 GCCTGCCTGGTGCTGGTCATCGTGCTGCTCTACTTCAGCCTCTGGAAGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CGTGAAGACCTCAGGGAAG         GTGGTATGGATCACAGCCACCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 121304 CGTGAAGACCTCAGGGAAGGTG...CAGGTGGTATGGATCACAGCCACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGCCATACGTGGTCCTCACTGCCCTGCTCCTGCGTGGGGTCACCCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122517 TGCCATACGTGGTCCTCACTGCCCTGCTCCTGCGTGGGGTCACCCTCCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GGAGCCATAGACGGCATCAGAGCATACCTGAGCGTTGACTTCTACCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122567 GGAGCCATAGACGGCATCAGAGCATACCTGAGCGTTGACTTCTACCGGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CTGCGAGGCGTCT         GTTTGGATTGACGCGGCCACCCAGGTGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 122617 CTGCGAGGCGTCTGTG...CAGGTTTGGATTGACGCGGCCACCCAGGTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GCTTCTCCCTGGGCGTGGGGTTCGGGGTGCTGATCGCCTTCTCCAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127025 GCTTCTCCCTGGGCGTGGGGTTCGGGGTGCTGATCGCCTTCTCCAGCTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 AACAAGTTCACCAACAACTGCTACAG         GGACGCGATTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 127075 AACAAGTTCACCAACAACTGCTACAGGTG...CAGGGACGCGATTGTCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CACCTCCATCAACTCCCTGACGAGCTTCTCCTCCGGCTTCGTCGTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128398 CACCTCCATCAACTCCCTGACGAGCTTCTCCTCCGGCTTCGTCGTCTTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CCTTCCTGGGGTACATGGCACAGAAGCACAGTGTGCCCATCGGGGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128448 CCTTCCTGGGGTACATGGCACAGAAGCACAGTGTGCCCATCGGGGACGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GCCAAGGACG         GGCCAGGGCTGATCTTCATCATCTACCCGGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 128498 GCCAAGGACGGTG...CAGGGCCAGGGCTGATCTTCATCATCTACCCGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AGCCATCGCCACGCTCCCTCTGTCCTCAGCCTGGGCCGTGGTCTTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131874 AGCCATCGCCACGCTCCCTCTGTCCTCAGCCTGGGCCGTGGTCTTCTTCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TCATGCTGCTCACCCTGGGTATCGACAGCGCC         ATGGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 131924 TCATGCTGCTCACCCTGGGTATCGACAGCGCCGTG...CAGATGGGTGGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ATGGAGTCAGTGATCACCGGGCTCATCGATGAGTTCCAGCTGCTGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133358 ATGGAGTCAGTGATCACCGGGCTCATCGATGAGTTCCAGCTGCTGCACAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 ACACCGTGAGCTCTTCACGCTCTTCATCGTCCTGGCGACCTTCCTCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133408 ACACCGTGAGCTCTTCACGCTCTTCATCGTCCTGGCGACCTTCCTCCTGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCCTGTTCTGCGTCACCAAC         GGTGGCATCTACGTCTTCACG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 133458 CCCTGTTCTGCGTCACCAACGTA...CAGGGTGGCATCTACGTCTTCACG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CTCCTGGACCATTTTGCAGCCGGCACGTCCATCCTCTTTGGAGTGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134094 CTCCTGGACCATTTTGCAGCCGGCACGTCCATCCTCTTTGGAGTGCTCAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CGAAGCCATCGGAGTGGCCTGGTTCTATG         GTGTTGGGCAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 134144 CGAAGCCATCGGAGTGGCCTGGTTCTATGGTG...CAGGTGTTGGGCAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TCAGCGACGACATCCAGCAGATGACCGGGCAGCGGCCCAGCCTGTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136922 TCAGCGACGACATCCAGCAGATGACCGGGCAGCGGCCCAGCCTGTACTGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CGGCTGTGCTGGAAGCTGGTCAGCCCCTGCTTTCTCCTG         TT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 136972 CGGCTGTGCTGGAAGCTGGTCAGCCCCTGCTTTCTCCTGGTA...CAGTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CGTGGTCGTGGTCAGCATTGTGACCTTCAGACCCCCCCACTACGGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140111 CGTGGTCGTGGTCAGCATTGTGACCTTCAGACCCCCCCACTACGGAGCCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 ACATCTTCCCCGACTGGGCCAACGCGCTGGGCTGGGTCATCGCCACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140161 ACATCTTCCCCGACTGGGCCAACGCGCTGGGCTGGGTCATCGCCACATCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 TCCATGGCCATGGTGCCCATCTATGCGGCCTACAAGTTCTGCAGCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140211 TCCATGGCCATGGTGCCCATCTATGCGGCCTACAAGTTCTGCAGCCTGCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 TGGGTCCTTTCGAGAG         AAACTGGCCTACGCCATTGCACCCG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 140261 TGGGTCCTTTCGAGAGGTG...CAGAAACTGGCCTACGCCATTGCACCCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AGAAGGACCGTGAGCTGGTGGACAGAGGGGAGGTGCGCCAGTTCACG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 142237 AGAAGGACCGTGAGCTGGTGGACAGAGGGGAGGTGCGCCAGTTCACGGTG

   1950     .    :    .    :    .
   1840       CTCCGCCACTGGCTCAAGGTG
        ...>>>|||||||||||||||||||||
 142287 ...CAGCTCCGCCACTGGCTCAAGGTG