seq1 = pF1KB6112.tfa, 1857 bp
seq2 = pF1KB6112/gi568815587r_62692479.tfa (gi568815587r:62692479_62903979), 211501 bp

>pF1KB6112 1857
>gi568815587r:62692479_62903979 (Chr11)

(complement)

1-28  (98624-98651)   100% ->
29-215  (100002-100188)   100% ->
216-369  (100408-100561)   100% ->
370-453  (101720-101803)   100% ->
454-558  (101934-102038)   100% ->
559-639  (102161-102241)   100% ->
640-709  (102349-102418)   100% ->
710-798  (102563-102651)   100% ->
799-906  (102779-102886)   100% ->
907-1016  (103494-103603)   100% ->
1017-1053  (105405-105441)   100% ->
1054-1122  (106594-106662)   100% ->
1123-1178  (106742-106797)   100% ->
1179-1286  (107413-107520)   100% ->
1287-1345  (107635-107693)   100% ->
1346-1461  (107799-107914)   100% ->
1462-1504  (108037-108079)   100% ->
1505-1577  (108973-109045)   100% ->
1578-1760  (109540-109722)   100% ->
1761-1821  (111279-111339)   100% ->
1822-1857  (111466-111501)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGACGAGGGGAAGTCGTACAGCG         AACACGATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  98624 ATGGCGGACGAGGGGAAGTCGTACAGCGGTA...TAGAACACGATGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ACGCGTTAATTTCCCTCAAAGAAAGAAGAAAGGCCGGGGTCCCTTCCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100015 ACGCGTTAATTTCCCTCAAAGAAAGAAGAAAGGCCGGGGTCCCTTCCGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGAAATATGGTGAAGGAAACCGTAGGTCTGGAAGAGGCGGTTCTGGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100065 GGAAATATGGTGAAGGAAACCGTAGGTCTGGAAGAGGCGGTTCTGGTATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGTCTTCCCGCCTTGAGGAAGATGATGGAGATGTGGCAATGAGTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100115 CGGTCTTCCCGCCTTGAGGAAGATGATGGAGATGTGGCAATGAGTGATGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCAGGATGGTCCCCGAGTACGATA         CAACCCCTATACCACCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100165 CCAGGATGGTCCCCGAGTACGATAGTG...CAGCAACCCCTATACCACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GACCTAACCGTCGGGGTGATACTTGGCATGATCGAGATCGCATTCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100425 GACCTAACCGTCGGGGTGATACTTGGCATGATCGAGATCGCATTCATGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACTGTGCGGAGAGACAGAGCTCCTCCAGAGAGAGGAGGGGCTGGCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100475 ACTGTGCGGAGAGACAGAGCTCCTCCAGAGAGAGGAGGGGCTGGCACCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCAGGATGGGACCTCAAAGAACTGGTTCAAGATTACA         ATTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100525 CCAGGATGGGACCTCAAAGAACTGGTTCAAGATTACAGTG...TAGATTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTTATGGCAGAAAGTATGACAAGGCATGGCTCCTGAGCATGATTCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101724 CTTATGGCAGAAAGTATGACAAGGCATGGCTCCTGAGCATGATTCAGAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGTGCAGTGTGCCCTTCACCCCTATTGAG         TTTCACTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101774 AAGTGCAGTGTGCCCTTCACCCCTATTGAGGTA...TAGTTTCACTATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAATACACGGGCCCAGTTCTTCGTTGAAGACGCCAGTACTGCCTCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101945 GAATACACGGGCCCAGTTCTTCGTTGAAGACGCCAGTACTGCCTCTGCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGAAGGCTGTCAACTATAAGATTTTGGATCGGGAGAACCGAAGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 101995 TGAAGGCTGTCAACTATAAGATTTTGGATCGGGAGAACCGAAGGGTG...

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    559    ATATCTATCATCATCAACTCTTCTGCTCCACCCCACACTATACTGAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102158 CAGATATCTATCATCATCAACTCTTCTGCTCCACCCCACACTATACTGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGAACTGAAGCCAGAACAAGTAGAACAGCTAAAG         CTGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 102208 TGAACTGAAGCCAGAACAAGTAGAACAGCTAAAGGTG...TAGCTGATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TGAGCAAACGATACGATGGCTCCCAACAAGCCCTTGACCTCAAAGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102356 TGAGCAAACGATACGATGGCTCCCAACAAGCCCTTGACCTCAAAGGCCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CGTTCAGACCCAG         ATTTGGTGGCCCAGAACATTGACGTTGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 102406 CGTTCAGACCCAGGTA...AAGATTTGGTGGCCCAGAACATTGACGTTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCTGAATCGCAGAAGCTGTATGGCAGCTACCCTGAGGATCATTGAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102591 CCTGAATCGCAGAAGCTGTATGGCAGCTACCCTGAGGATCATTGAAGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ACATCCCTGAG         CTATTGTCCTTGAACTTGAGCAACAACAGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 102641 ACATCCCTGAGGTA...CAGCTATTGTCCTTGAACTTGAGCAACAACAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CTGTACAGGCTGGATGACATGTCTAGCATTGTTCAGAAGGCACCCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102809 CTGTACAGGCTGGATGACATGTCTAGCATTGTTCAGAAGGCACCCAACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GAAGATCCTAAACCTTTCTGGAAATGAA         TTGAAGTCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102859 GAAGATCCTAAACCTTTCTGGAAATGAAGTG...CAGTTGAAGTCTGAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 GGGAATTGGACAAGATAAAGGGGCTGAAGCTAGAAGAGCTCTGGCTCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103507 GGGAATTGGACAAGATAAAGGGGCTGAAGCTAGAAGAGCTCTGGCTCGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GGAAACTCCCTGTGTGACACCTTCCGAGACCAGTCCACCTACATCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103557 GGAAACTCCCTGTGTGACACCTTCCGAGACCAGTCCACCTACATCAGGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1017       CGCCATTCGCGAACGATTTCCCAAGTTACTACGCCTG       
        ...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 103607 ...CAGCGCCATTCGCGAACGATTTCCCAAGTTACTACGCCTGGTA...C

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1054   GATGGCCATGAGCTACCCCCACCAATTGCCTTTGATGTTGAAGCCCCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106592 AGGATGGCCATGAGCTACCCCCACCAATTGCCTTTGATGTTGAAGCCCCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 ACGACGTTACCGCCCTGCAAG         GGAAGCTATTTTGGAACAGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 106642 ACGACGTTACCGCCCTGCAAGGTA...CAGGGAAGCTATTTTGGAACAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 AAACTTGAAGAGTCTGGTCTTGCACTTCCTGCAACA         GTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 106762 AAACTTGAAGAGTCTGGTCTTGCACTTCCTGCAACAGTA...TAGGTACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 ATGCAATTTACGACTCTGGAGACCGACAAGGGCTCCTGGATGCCTACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107418 ATGCAATTTACGACTCTGGAGACCGACAAGGGCTCCTGGATGCCTACCAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 GATGGGGCCTGCTGTTCCCTGAGCATTCCTTTCATTCCTCAGAACCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107468 GATGGGGCCTGCTGTTCCCTGAGCATTCCTTTCATTCCTCAGAACCCTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 CCG         AAGCAGCTTAGCCGAGTATTTCAAGGATAGCAGAAATG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107518 CCGGTT...CAGAAGCAGCTTAGCCGAGTATTTCAAGGATAGCAGAAATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 TGAAGAAGCTTAAAGACCCTA         CCTTGCGGTTCCGGCTGCTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 107673 TGAAGAAGCTTAAAGACCCTAGTA...CAGCCTTGCGGTTCCGGCTGCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366 AAGCACACGCGTCTCAACGTTGTTGCCTTCCTCAATGAGTTGCCCAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107819 AAGCACACGCGTCTCAACGTTGTTGCCTTCCTCAATGAGTTGCCCAAAAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 CCAGCACGACGTCAATTCCTTCGTGGTAGACATAAGCGCCCAGACA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 107869 CCAGCACGACGTCAATTCCTTCGTGGTAGACATAAGCGCCCAGACAGTA.

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1462      AGCACATTGCTGTGTTTTTCTGTCAATGGAGTCTTCAAGGAAG  
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 107919 ..CAGAGCACATTGCTGTGTTTTTCTGTCAATGGAGTCTTCAAGGAAGGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1505        TGGACGGAAAGTCCCGGGATTCTTTGCGAGCCTTCACCCGGAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108082 A...CAGTGGACGGAAAGTCCCGGGATTCTTTGCGAGCCTTCACCCGGAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1548 ATTCATTGCTGTTCCTGCTAGCAATTCAGG         GCTATGTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 109016 ATTCATTGCTGTTCCTGCTAGCAATTCAGGGTA...AAGGCTATGTATTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1589 TAAATGATGAGCTATTTGTGCGGAATGCCAGTTCTGAAGAGATCCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109551 TAAATGATGAGCTATTTGTGCGGAATGCCAGTTCTGAAGAGATCCAAAGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1639 GCCTTCGCTATGCCTGCACCCACGCCTTCCTCCAGCCCGGTGCCCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109601 GCCTTCGCTATGCCTGCACCCACGCCTTCCTCCAGCCCGGTGCCCACCCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1689 CTCTCCAGAGCAGCAGGAAATGTTGCAAGCATTCTCTACCCAGTCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109651 CTCTCCAGAGCAGCAGGAAATGTTGCAAGCATTCTCTACCCAGTCTGGCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1739 TGAACCTCGAGTGGTCCCAGAA         GTGCCTTCAGGACAACAAC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 109701 TGAACCTCGAGTGGTCCCAGAAGTG...CAGGTGCCTTCAGGACAACAAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1780 TGGGACTACACCAGATCTGCCCAGGCCTTCACTCATCTCAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 111298 TGGGACTACACCAGATCTGCCCAGGCCTTCACTCATCTCAAGGTA...CA

   2000     .    :    .    :    .    :    .
   1822  GCCAAGGGCGAGATCCCAGAAGTGGCATTCATGAAG
        >||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111465 GGCCAAGGGCGAGATCCCAGAAGTGGCATTCATGAAG