seq1 = pF1KB6110.tfa, 1884 bp
seq2 = pF1KB6110/gi568815597r_145749449.tfa (gi568815597r:145749449_145957008), 207560 bp

>pF1KB6110 1884
>gi568815597r:145749449_145957008 (Chr1)

(complement)

1-24  (98019-98042)   100% ->
25-442  (100003-100420)   100% ->
443-527  (100578-100662)   100% ->
528-578  (100891-100941)   100% ->
579-669  (101183-101273)   100% ->
670-804  (102129-102263)   100% ->
805-910  (102446-102551)   100% ->
911-984  (103123-103196)   100% ->
985-1145  (103345-103505)   100% ->
1146-1279  (105856-105989)   100% ->
1280-1448  (106070-106238)   100% ->
1449-1582  (106423-106556)   100% ->
1583-1620  (106740-106777)   100% ->
1621-1884  (107297-107560)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGCTGGGCGAATTAAAG         CACATGGTGATGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  98019 ATGGCGGAGCTGGGCGAATTAAAGGTA...CAGCACATGGTGATGAGTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCGGGTGTCTGAGCTCCAGGTGCTTCTTGGCTTTGCTGGCCGGAACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100020 CCGGGTGTCTGAGCTCCAGGTGCTTCTTGGCTTTGCTGGCCGGAACAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGGACGGAAGCACGAGCTCCTGGCCAAGGCTCTGCACCTCCTGAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100070 GTGGACGGAAGCACGAGCTCCTGGCCAAGGCTCTGCACCTCCTGAAGTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGCTGTGCCCCTAGTGTCCAGATGAAGATCAAAGAGCTTTACCGACGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100120 AGCTGTGCCCCTAGTGTCCAGATGAAGATCAAAGAGCTTTACCGACGACG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTTCCCCGGAAGACCCTGGGGCCCTCTGATCTCTCCCTTCTCTCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100170 CTTTCCCCGGAAGACCCTGGGGCCCTCTGATCTCTCCCTTCTCTCTTTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCCTGGCACCTCTCCTGTAGGCTCCCCTGGTCCTCTAGCTCCCATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100220 CCCCTGGCACCTCTCCTGTAGGCTCCCCTGGTCCTCTAGCTCCCATTCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCAACGCTGTTGGCCCCTGGCACCCTGCTGGGCCCCAAGCGTGAGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100270 CCAACGCTGTTGGCCCCTGGCACCCTGCTGGGCCCCAAGCGTGAGGTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATGCACCCCCCTCTGCCCCAGCCTGTGCACCCTGATGTCACCATGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100320 CATGCACCCCCCTCTGCCCCAGCCTGTGCACCCTGATGTCACCATGAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CATTGCCCTTCTATGAAGTCTATGGGGAGCTCATCCGGCCCACCACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100370 CATTGCCCTTCTATGAAGTCTATGGGGAGCTCATCCGGCCCACCACCCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 G         CATCCACTTCTAGCCAGCGGTTTGAGGAAGCGCACTTTAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100420 GGTA...CAGCATCCACTTCTAGCCAGCGGTTTGAGGAAGCGCACTTTAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTTTGCCCTCACACCCCAGCAAGTGCAGCAGATTCTTACATCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100618 CTTTGCCCTCACACCCCAGCAAGTGCAGCAGATTCTTACATCCAGGTA..

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    528     AGAGGTTCTGCCAGGAGCCAAATGTGATTATACCATACAGGTGCAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100668 .CAGAGAGGTTCTGCCAGGAGCCAAATGTGATTATACCATACAGGTGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTAAG         GTTCTGTCTCTGTGAGACCAGCTGCCCCCAGGAAGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100937 CTAAGGTG...CAGGTTCTGTCTCTGTGAGACCAGCTGCCCCCAGGAAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTATTTTCCCCCCAACCTCTTTGTCAAGGTCAATGGGAAACTGTGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101219 TTATTTTCCCCCCAACCTCTTTGTCAAGGTCAATGGGAAACTGTGCCCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGCCG         GGTTACCTTCCCCCAACCAAGAATGGGGCCGAGCCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101269 TGCCGGTA...CAGGGTTACCTTCCCCCAACCAAGAATGGGGCCGAGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAGAGGCCCAGCCGCCCCATCAACATCACACCCCTGGCTCGACTCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102165 AAGAGGCCCAGCCGCCCCATCAACATCACACCCCTGGCTCGACTCTCAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CACTGTTCCCAACACCATTGTGGTCAATTGGTCATCTGAGTTCGGACGG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 102215 CACTGTTCCCAACACCATTGTGGTCAATTGGTCATCTGAGTTCGGACGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    805         AATTACTCCTTGTCTGTGTACCTGGTGAGGCAGTTGACTGCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102265 TG...TAGAATTACTCCTTGTCTGTGTACCTGGTGAGGCAGTTGACTGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGAACCCTTCTACAAAAACTCAGAGCAAAGGGTATCCGGAACCCAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102488 GGAACCCTTCTACAAAAACTCAGAGCAAAGGGTATCCGGAACCCAGACCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTCGCGGGCACTGA         TCAAGGAGAAATTGACTGCTGACCCTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102538 CTCGCGGGCACTGAGTG...CAGTCAAGGAGAAATTGACTGCTGACCCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ACAGTGAGGTGGCCACTACAAGTCTCCGGGTGTCACTCATGTGCCCG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103150 ACAGTGAGGTGGCCACTACAAGTCTCCGGGTGTCACTCATGTGCCCGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    985       CTAGGGAAGATGCGCCTGACTGTCCCTTGTCGTGCCCTCACCTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103200 ...CAGCTAGGGAAGATGCGCCTGACTGTCCCTTGTCGTGCCCTCACCTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CGCCCACCTGCAGAGCTTCGATGCTGCCCTTTATCTACAGATGAATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103389 CGCCCACCTGCAGAGCTTCGATGCTGCCCTTTATCTACAGATGAATGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGAAGCCTACATGGACATGTCCTGTGTGTGACAAGAAGGCTCCCTATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103439 AGAAGCCTACATGGACATGTCCTGTGTGTGACAAGAAGGCTCCCTATGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TCTCTTATCATTGATGG         TTTATTTATGGAGATTCTTAGTTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103489 TCTCTTATCATTGATGGGTA...CAGTTTATTTATGGAGATTCTTAGTTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CTGTTCAGATTGTGATGAGATCCAATTCATGGAAGATGGATCCTGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105880 CTGTTCAGATTGTGATGAGATCCAATTCATGGAAGATGGATCCTGGTGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CAATGAAACCCAAGAAGGAGGCATCTGAGGTTTGCCCCCCGCCAGGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105930 CAATGAAACCCAAGAAGGAGGCATCTGAGGTTTGCCCCCCGCCAGGGTAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GGGCTGGATG         GCCTCCAGTACAGCCCAGTCCAGGGGGGAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 105980 GGGCTGGATGGTG...CAGGCCTCCAGTACAGCCCAGTCCAGGGGGGAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TCCATCAGAGAATAAGAAGAAGGTCGAAGTTATTGACTTGACAATAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106101 TCCATCAGAGAATAAGAAGAAGGTCGAAGTTATTGACTTGACAATAGAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GCTCATCAGATGAGGAGGATCTGCCCCCTACCAAGAAGCACTGTTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106151 GCTCATCAGATGAGGAGGATCTGCCCCCTACCAAGAAGCACTGTTCTGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 ACCTCAGCTGCCATCCCGGCCCTACCTGGAAGCAAAGG         AGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 106201 ACCTCAGCTGCCATCCCGGCCCTACCTGGAAGCAAAGGGTA...CAGAGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CCTGACATCTGGCCACCAGCCATCCTCGGTGCTAAGGAGCCCTGCTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106426 CCTGACATCTGGCCACCAGCCATCCTCGGTGCTAAGGAGCCCTGCTATGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 GCACGTTGGGTGGGGATTTCCTGTCCAGTCTCCCACTACATGAGTACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106476 GCACGTTGGGTGGGGATTTCCTGTCCAGTCTCCCACTACATGAGTACCCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CCTGCCTTCCCACTGGGAGCCGACATCCAAG         GTTTAGATTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 106526 CCTGCCTTCCCACTGGGAGCCGACATCCAAGGTA...CAGGTTTAGATTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 ATTTTCATTTCTTCAGACAGAGAGTCAG         CACTATGGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 106750 ATTTTCATTTCTTCAGACAGAGAGTCAGGTA...TAGCACTATGGCCCCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 CTGTCATCACCTCACTAGATGAACAGGATGCCCTTGGCCACTTCTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107310 CTGTCATCACCTCACTAGATGAACAGGATGCCCTTGGCCACTTCTTCCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 TACCGAGGGACCCCTTCTCACTTTCTGGGCCCACTGGCCCCCACGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107360 TACCGAGGGACCCCTTCTCACTTTCTGGGCCCACTGGCCCCCACGCTGGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GAGCTCCCACTGCAGCGCCACTCCGGCGCCCCCTCCTGGCCGTGTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107410 GAGCTCCCACTGCAGCGCCACTCCGGCGCCCCCTCCTGGCCGTGTCAGCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GCATTGTGGCCCCTGGGGGGGCCTTGAGGGAGGGGCATGGAGGACCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107460 GCATTGTGGCCCCTGGGGGGGCCTTGAGGGAGGGGCATGGAGGACCCCTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CCCTCAGGTCCCTCTTTGACTGGCTGTCGGTCAGACATCATTTCCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107510 CCCTCAGGTCCCTCTTTGACTGGCTGTCGGTCAGACATCATTTCCCTGGA

   2000 
   1884 C
        |
 107560 C