seq1 = pF1KB6003.tfa, 3594 bp
seq2 = pF1KB6003/gi568815587f_43258955.tfa (gi568815587f:43258955_43593901), 334947 bp

>pF1KB6003 3594
>gi568815587f:43258955_43593901 (Chr11)

1-159  (100001-100159)   100% ->
160-249  (120279-120368)   100% ->
250-419  (130698-130867)   100% ->
420-531  (132511-132622)   100% ->
532-663  (132867-132998)   100% ->
664-773  (137755-137864)   100% ->
774-918  (138393-138537)   100% ->
919-1058  (139020-139159)   100% ->
1059-1219  (140934-141094)   100% ->
1220-1332  (142492-142604)   100% ->
1333-1479  (145044-145190)   100% ->
1480-1595  (146560-146675)   100% ->
1596-1761  (146832-146997)   100% ->
1762-1839  (148184-148261)   100% ->
1840-2064  (148399-148623)   100% ->
2065-2251  (155636-155822)   100% ->
2252-2422  (177210-177380)   100% ->
2423-2682  (184371-184630)   100% ->
2683-2836  (185102-185255)   100% ->
2837-2957  (189048-189168)   100% ->
2958-3117  (191128-191287)   100% ->
3118-3201  (192228-192311)   100% ->
3202-3321  (231285-231404)   100% ->
3322-3465  (233066-233209)   100% ->
3466-3594  (234819-234947)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCAGTAGGGGTTCGTGGCCGGTACGAGCTGCCGCCTTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGGCAGTAGGGGTTCGTGGCCGGTACGAGCTGCCGCCTTGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCCCAGGCTGGCTCCTCAGCCTTTCCGCCTTGCTGAGTGTGGCGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCCCAGGCTGGCTCCTCAGCCTTTCCGCCTTGCTGAGTGTGGCGGCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGGGGCCTTCGCCACCACGCACTGGGTCGTCACGGAGGACGGGAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGGGGCCTTCGCCACCACGCACTGGGTCGTCACGGAGGACGGGAAAATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCAGCAG         GTGGATTCACCAATGAACTTGAAGCATCCTCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCAGCAGGTA...CAGGTGGATTCACCAATGAACTTGAAGCATCCTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGACCTAGTCATATTAATGAGACAAGAAGCAACAGTTAACTACCTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120311 TGACCTAGTCATATTAATGAGACAAGAAGCAACAGTTAACTACCTCAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AATTAGAG         AAACAATTAGTTGCTCAAAAAATTCACATAGAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 120361 AATTAGAGGTG...CAGAAACAATTAGTTGCTCAAAAAATTCACATAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGAATGAGGACAGAGACACAGGACTGGAACAGAGACATAATAAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130731 GAGAATGAGGACAGAGACACAGGACTGGAACAGAGACATAATAAAGAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCAGACTGCATCAAAGCCAAGGTGCCCTTAGGGGACCTGGATCTATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130781 CCCAGACTGCATCAAAGCCAAGGTGCCCTTAGGGGACCTGGATCTATATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGGCACATACATAACTTTGGAGAGCAAAGACATCAG         TCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 130831 ATGGCACATACATAACTTTGGAGAGCAAAGACATCAGGTA...TAGTCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAGATTATATAGACACAGAATCTCCTGTCCCTCCAGACCCAGAGCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132515 GAAGATTATATAGACACAGAATCTCCTGTCCCTCCAGACCCAGAGCAACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGATTGTACTAAAATTCTAGAACTTCCATATAGTATACATGCTTTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132565 TGATTGTACTAAAATTCTAGAACTTCCATATAGTATACATGCTTTTCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACTTGAGA         GGTGTACAGGAGAGAGTTAATCTTTCTGCACCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 132615 ACTTGAGAGTA...CAGGGTGTACAGGAGAGAGTTAATCTTTCTGCACCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGCTACCTAAAGAAGACCCAATCTTCACATATTTATCTAAACGGTTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132900 CTGCTACCTAAAGAAGACCCAATCTTCACATATTTATCTAAACGGTTAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AAGGAGTATAGATGACATAGGTCACCTCATTCATGAAGGCCTACAGAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 132950 AAGGAGTATAGATGACATAGGTCACCTCATTCATGAAGGCCTACAGAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    664         AACACTTCCTCGTGGGTACTGTATAACATGGCTTCATTTTAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133000 TA...TAGAACACTTCCTCGTGGGTACTGTATAACATGGCTTCATTTTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TGGAGAATTAAGAATGAGCCATATCAGGTAGTAGAATGTGCCATGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137797 TGGAGAATTAAGAATGAGCCATATCAGGTAGTAGAATGTGCCATGCGAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ACTTCACTTCTCTTCCAG         GCACAATAAAGACATTGCCCTGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 137847 ACTTCACTTCTCTTCCAGGTA...TAGGCACAATAAAGACATTGCCCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCAACCTGGCAAACGTTCTACACAGAGCACACTTCTCTGCTGATGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138416 TCAACCTGGCAAACGTTCTACACAGAGCACACTTCTCTGCTGATGCTGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GTCGTGGTCCATGCAGCTCTGGATGACAGTGACTTCTTCACCAGCTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138466 GTCGTGGTCCATGCAGCTCTGGATGACAGTGACTTCTTCACCAGCTATTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CACTTTGGGGAATATATATGCA         ATGCTTGGGGAATATAACC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 138516 CACTTTGGGGAATATATATGCAGTA...CAGATGCTTGGGGAATATAACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ACTCAGTGCTCTGTTATGACCACGCTTTGCAGGCCAGACCTGGGTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139039 ACTCAGTGCTCTGTTATGACCACGCTTTGCAGGCCAGACCTGGGTTTGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CAAGCTATAAAGAGGAAGCATGCTGTCCTATGTCAGCAAAAACTGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139089 CAAGCTATAAAGAGGAAGCATGCTGTCCTATGTCAGCAAAAACTGGAGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GAAATTGGAGGCTCAGCATAG         ATCTCTCCAGCGAACACTGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 139139 GAAATTGGAGGCTCAGCATAGGTA...AAGATCTCTCCAGCGAACACTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ATGAGTTAAAAGAGTATCAAAAGCAGCATGACCACTACCTGAGACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140954 ATGAGTTAAAAGAGTATCAAAAGCAGCATGACCACTACCTGAGACAGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GAAATCCTAGAAAAACATAAACTGATTCAGGAGGAGCAAATCTTAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141004 GAAATCCTAGAAAAACATAAACTGATTCAGGAGGAGCAAATCTTAAGAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TATCATTCATGAGACTCAGATGGCAAAAGAGGCACAATTAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 141054 TATCATTCATGAGACTCAGATGGCAAAAGAGGCACAATTAGGTA...CAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GAAATCATCAGATATGCCGACTGGTCAACCAGCAGCATAGTTTACATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142492 GAAATCATCAGATATGCCGACTGGTCAACCAGCAGCATAGTTTACATTGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CAGTGGGACCAGCCTGTACGCTATCATCGTGGAGATATCTTTGAAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142542 CAGTGGGACCAGCCTGTACGCTATCATCGTGGAGATATCTTTGAAAATGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GGACTATGTTCAG         TTTGGTGAGGATTCATCAACCTCCAGTA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 142592 GGACTATGTTCAGGTC...TAGTTTGGTGAGGATTCATCAACCTCCAGTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TGATGTCTGTGAACTTTGATGTTCAATCAAATCAGAGTGATATCAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145072 TGATGTCTGTGAACTTTGATGTTCAATCAAATCAGAGTGATATCAATGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TCGGTCAAGTCTTCTCCCGTAGCCCATTCTATTCTCTGGATTTGGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145122 TCGGTCAAGTCTTCTCCCGTAGCCCATTCTATTCTCTGGATTTGGGGCAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GGACTCTGATGCATATAGG         GACAAACAGCATATTCTATGGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 145172 GGACTCTGATGCATATAGGGTA...CAGGACAAACAGCATATTCTATGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 CTAAAAGAGCAGATTGTACAGAAAGCTACCCTAGAGTCCCTGTTGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146582 CTAAAAGAGCAGATTGTACAGAAAGCTACCCTAGAGTCCCTGTTGGTGGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GAATTGCCAACGTATTTTCTGCCTCCGGAAAACAAAGGACTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 146632 GAATTGCCAACGTATTTTCTGCCTCCGGAAAACAAAGGACTCAGGCA...

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1596    GATCCACGAACTCAGCAGTGATGATTATTCTACAGAAGAAGAGGCCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146829 CAGGATCCACGAACTCAGCAGTGATGATTATTCTACAGAAGAAGAGGCCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AAACCCCTGACTGTTCCATAACTGACTTCAGAAAAAGCCACACTCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146879 AAACCCCTGACTGTTCCATAACTGACTTCAGAAAAAGCCACACTCTGTCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 TACTTAGTCAAAGAATTAGAGGTTCGCATGGATCTGAAAGCCAAAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146929 TACTTAGTCAAAGAATTAGAGGTTCGCATGGATCTGAAAGCCAAAATGCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 AGATGACCATGCACGAAAA         ATTTTGCTTTCCCGTATTAATA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 146979 AGATGACCATGCACGAAAAGTA...CAGATTTTGCTTTCCCGTATTAATA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 ACTATACTATCCCAGAAGAAGAAATTGGGTCTTTCTTATTTCATGCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148206 ACTATACTATCCCAGAAGAAGAAATTGGGTCTTTCTTATTTCATGCTATT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 AATAAG         CCAAATGCTCCTATCTGGCTCATACTCAATGAAGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148256 AATAAGGTG...CAGCCAAATGCTCCTATCTGGCTCATACTCAATGAAGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 TGGACTATACTGGAGAGCAGTAGGAAATAGCACTTTTGCTATTGCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148434 TGGACTATACTGGAGAGCAGTAGGAAATAGCACTTTTGCTATTGCCTGTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 TTCAGAGGGCTTTGAATTTAGCTCCACTTCAATACCAAGATGTTCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148484 TTCAGAGGGCTTTGAATTTAGCTCCACTTCAATACCAAGATGTTCCTCTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GTCAACTTGGCCAACCTTTTGATTCATTACGGCCTTCATCTTGATGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148534 GTCAACTTGGCCAACCTTTTGATTCATTACGGCCTTCATCTTGATGCCAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 TAAGCTGCTACTTCAAGCTTTGGCCATCAATAGCTCTGAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 148584 TAAGCTGCTACTTCAAGCTTTGGCCATCAATAGCTCTGAGGTG...CAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 CTCTGACCTTTTTGAGCCTGGGAAATGCTTACCTTGCTCTGAAGAATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155637 CTCTGACCTTTTTGAGCCTGGGAAATGCTTACCTTGCTCTGAAGAATATC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 AGTGGGGCACTTGAGGCCTTTAGACAGGCCTTGAAATTAACCACCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155687 AGTGGGGCACTTGAGGCCTTTAGACAGGCCTTGAAATTAACCACCAAATG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 TCCAGAGTGTGAAAACAGCCTGAAGTTGATCCGCTGTATGCAGTTTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155737 TCCAGAGTGTGAAAACAGCCTGAAGTTGATCCGCTGTATGCAGTTTTATC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 CTTTTCTGTACAACATCACTTCTTCTGTTTGCAGTG         GTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 155787 CTTTTCTGTACAACATCACTTCTTCTGTTTGCAGTGGTA...GAGGTAAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 TGTCATGAGAAAACCCTGGACAACAGCCATGACAAACAGAAATATTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177215 TGTCATGAGAAAACCCTGGACAACAGCCATGACAAACAGAAATATTTTGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 CAACTCACAGTCACTGGATGCTGCTGAAGAAGAGCCCTCTGAGAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177265 CAACTCACAGTCACTGGATGCTGCTGAAGAAGAGCCCTCTGAGAGAGGAA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 CAGAGGAGGACCCTGTATTCTCTGTTGAGAATTCAGGGAGGGACTCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177315 CAGAGGAGGACCCTGTATTCTCTGTTGAGAATTCAGGGAGGGACTCAGAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 GCCCTTAGACTTGAAA         GTACGGTGGTTGAGGAGAGCAATGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 177365 GCCCTTAGACTTGAAAGTA...CAGGTACGGTGGTTGAGGAGAGCAATGG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 TTCTGATGAGATGGAGAATTCAGATGAAACCAAAATGTCAGAAGAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184396 TTCTGATGAGATGGAGAATTCAGATGAAACCAAAATGTCAGAAGAAATAC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 TGGCTTTGGTGGATGAATTTCAACAGGCATGGCCTTTGGAAGGCTTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184446 TGGCTTTGGTGGATGAATTTCAACAGGCATGGCCTTTGGAAGGCTTTGGG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 GGTGCACTAGAGATGAAAGGGCGGCGTCTAGACTTACAAGGAATACGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184496 GGTGCACTAGAGATGAAAGGGCGGCGTCTAGACTTACAAGGAATACGGGT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 GCTGAAGAAAGGTCCCCAGGATGGAGTGGCCAGAAGCTCTTGCTATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184546 GCTGAAGAAAGGTCCCCAGGATGGAGTGGCCAGAAGCTCTTGCTATGGAG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 ACTGCAGAAGTGAAGATGATGAAGCAACAGAATGG         ATTACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 184596 ACTGCAGAAGTGAAGATGATGAAGCAACAGAATGGGTA...CAGATTACA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 TTCCAGGTCAAACGTGTAAAGAAACCCAAAGGAGATCATAAGAAAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185108 TTCCAGGTCAAACGTGTAAAGAAACCCAAAGGAGATCATAAGAAAACTCC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 TGGGAAAAAAGTAGAAACAGGTCAGATAGAAAATGGACATCGTTACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185158 TGGGAAAAAAGTAGAAACAGGTCAGATAGAAAATGGACATCGTTACCAAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 CAAACCTAGAGATCACTGGCCCCAAGGTGGCATCTCCTGGGCCACAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 185208 CAAACCTAGAGATCACTGGCCCCAAGGTGGCATCTCCTGGGCCACAAGGT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2837        GAAAAAAACGTGACTACCAGCGTCTGGGATGGCCCAGCCCGGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185258 A...CAGGAAAAAAACGTGACTACCAGCGTCTGGGATGGCCCAGCCCGGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2880 CGAATGCCTCAAACTCCGCTGGGTAGAGCTGACTGCCATCGTGAGTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 189091 CGAATGCCTCAAACTCCGCTGGGTAGAGCTGACTGCCATCGTGAGTACCT

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2930 GGCTTGCAGTTTCTTCAAAAAACATTGA         CATCACAGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 189141 GGCTTGCAGTTTCTTCAAAAAACATTGAGTA...CAGCATCACAGAACAC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2971 ATAGATTTTGCCACCCCTATACAGCAGCCAGCAATGGAGCCTCTTTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191141 ATAGATTTTGCCACCCCTATACAGCAGCCAGCAATGGAGCCTCTTTGCAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3021 TGGCAATCTCCCCACGAGTATGCATACCCTGGACCACTTGCATGGGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191191 TGGCAATCTCCCCACGAGTATGCATACCCTGGACCACTTGCATGGGGTTT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3071 CCAACCGAGCCAGCCTGCACTACACAGGGGAGAGTCAGTTAACAGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 191241 CCAACCGAGCCAGCCTGCACTACACAGGGGAGAGTCAGTTAACAGAGGTG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3118       GTATTACAAAATCTCGGCAAAGACCAATATCCACAACAGTCGCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191291 ...CAGGTATTACAAAATCTCGGCAAAGACCAATATCCACAACAGTCGCT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3162 TGAACAGATTGGCACCCGAATTGCCAAAGTTTTGGAAAAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 192272 TGAACAGATTGGCACCCGAATTGCCAAAGTTTTGGAAAAGGTA...CAGA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3203 ACCAGACGTCCTGGGTCCTCTCCAGCATGGCAGCCCTCTACTGGAGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231286 ACCAGACGTCCTGGGTCCTCTCCAGCATGGCAGCCCTCTACTGGAGGGTG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3253 AAAGGCCAAGGAAAGAAGGCAATCGACTGCCTCCGCCAGGCTCTGCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 231336 AAAGGCCAAGGAAAGAAGGCAATCGACTGCCTCCGCCAGGCTCTGCACTA

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3303 TGCGCCACACCAGATGAAG         GATGTGCCCCTGATTAGCCTGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 231386 TGCGCCACACCAGATGAAGGTG...CAGGATGTGCCCCTGATTAGCCTGG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3344 CCAACATCTTGCACAATGCCAAGCTCTGGAATGACGCCGTCATAGTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233088 CCAACATCTTGCACAATGCCAAGCTCTGGAATGACGCCGTCATAGTAGCC

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3394 ACCATGGCAGTAGAGATCGCACCACACTTTGCTGTGAACCACTTCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233138 ACCATGGCAGTAGAGATCGCACCACACTTTGCTGTGAACCACTTCACTCT

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3444 GGGCAATGTCTACGTGGCAATG         GAAGAATTTGAAAAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 233188 GGGCAATGTCTACGTGGCAATGGTG...CAGGAAGAATTTGAAAAAGCAC

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3485 TGGTGTGGTATGAATCCACATTGAAGCTTCAGCCCGAGTTTGTCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234838 TGGTGTGGTATGAATCCACATTGAAGCTTCAGCCCGAGTTTGTCCCAGCC

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3535 AAGAACCGAATCCAGACCATCCAGTGTCACTTAATGCTGAAGAAGGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 234888 AAGAACCGAATCCAGACCATCCAGTGTCACTTAATGCTGAAGAAGGGACG

   3800     .    :
   3585 GCGCTCTCCT
        ||||||||||
 234938 GCGCTCTCCT