seq1 = pF1KB5985.tfa, 1563 bp
seq2 = pF1KB5985/gi568815579r_49761251.tfa (gi568815579r:49761251_49967204), 205954 bp

>pF1KB5985 1563
>gi568815579r:49761251_49967204 (Chr19)

(complement)

1-151  (100001-100151)   100% ->
152-198  (100760-100806)   100% ->
199-498  (101779-102078)   100% ->
499-578  (102802-102881)   100% ->
579-636  (102969-103026)   100% ->
637-744  (103134-103241)   100% ->
745-816  (103445-103516)   100% ->
817-865  (104467-104515)   100% ->
866-936  (104597-104667)   100% ->
937-1029  (104742-104834)   100% ->
1030-1126  (104924-105020)   100% ->
1127-1188  (105100-105161)   100% ->
1189-1298  (105324-105433)   100% ->
1299-1386  (105510-105597)   100% ->
1387-1448  (105695-105756)   100% ->
1449-1563  (105840-105954)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCGAGGTGGAGGCCCCGGGCCGCTTGTGGCTCGAGAGCCCCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCGAGGTGGAGGCCCCGGGCCGCTTGTGGCTCGAGAGCCCCCCTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGAGCGCCCCCCATCTTCCTGCCCTCGGACGGGCAAGCCCTGGTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGAGCGCCCCCCATCTTCCTGCCCTCGGACGGGCAAGCCCTGGTCCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGGGGACCCCTGACCCAGGTTACGGACCGGAAGTGCTCCAGAACTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAGGGGACCCCTGACCCAGGTTACGGACCGGAAGTGCTCCAGAACTCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 G         TGGAGCTGGTCGCAGATCCTGAGACCCGGACAGTGGCAGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTG...CAGTGGAGCTGGTCGCAGATCCTGAGACCCGGACAGTGGCAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAACAG         CTGGGAGTTAACCCCTCAACTACCGGGACCCAGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100800 GAAACAGGTA...CAGCTGGGAGTTAACCCCTCAACTACCGGGACCCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGTTGAAGCCGGGGTTGGAGGGCTCTCTGGGGGTGGGGGACACACTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101813 AGTTGAAGCCGGGGTTGGAGGGCTCTCTGGGGGTGGGGGACACACTGTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTGGTCAATGGCCTCCACCCACTGACCCTGCGCTGGGAAGAGACCCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101863 TTGGTCAATGGCCTCCACCCACTGACCCTGCGCTGGGAAGAGACCCGCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACCAGAATCCCAGCCAGATACTCCGCCTGGCACCCCTCTGGTGTCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101913 ACCAGAATCCCAGCCAGATACTCCGCCTGGCACCCCTCTGGTGTCCCAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGAGAAGAGAGATGCTGAGCTGCCGAAGAAGCGTATGCGGAAGTCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101963 ATGAGAAGAGAGATGCTGAGCTGCCGAAGAAGCGTATGCGGAAGTCAAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCCGGCTGGGAGAACTTGGAGAAGTTGCTAGTGTTCACCGCAGCTGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102013 CCCGGCTGGGAGAACTTGGAGAAGTTGCTAGTGTTCACCGCAGCTGGGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GAAACCCCAGGGCAAG         GTGGCTGGCTTTGATCTGGACGGGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102063 GAAACCCCAGGGCAAGGTG...CAGGTGGCTGGCTTTGATCTGGACGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CGCTCATCACCACACGCTCTGGGAAGGTCTTTCCCACTGGCCCCAGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102827 CGCTCATCACCACACGCTCTGGGAAGGTCTTTCCCACTGGCCCCAGTGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGGAG         GATCTTGTACCCAGAGATTCCCCGTAAGCTCCGAGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102877 TGGAGGTG...TAGGATCTTGTACCCAGAGATTCCCCGTAAGCTCCGAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCTGGAAGCCGAGGGCTACAAG         CTGGTGATCTTCACCAACC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 103005 GCTGGAAGCCGAGGGCTACAAGGTA...CAGCTGGTGATCTTCACCAACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGATGAGCATCGGGCGCGGGAAGCTGCCAGCCGAGGAGTTCAAGGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103153 AGATGAGCATCGGGCGCGGGAAGCTGCCAGCCGAGGAGTTCAAGGCCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTGGAGGCTGTGGTGGAGAAGCTGGGGGTCCCCTTCCAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 103203 GTGGAGGCTGTGGTGGAGAAGCTGGGGGTCCCCTTCCAGGTA...CAGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCTGGTGGCCACGCACGCAGGCTTGTACCGGAAGCCGGTGACGGGCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103447 GCTGGTGGCCACGCACGCAGGCTTGTACCGGAAGCCGGTGACGGGCATGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GGGACCATCTGCAGGAGCAG         GCCAACGACGGCACGCCCATA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 103497 GGGACCATCTGCAGGAGCAGGTG...TAGGCCAACGACGGCACGCCCATA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TCCATCGGGGACAGCATCTTTGTGGGAG         ACGCAGCCGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 104488 TCCATCGGGGACAGCATCTTTGTGGGAGGTA...CAGACGCAGCCGGACG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CCCGGCCAACTGGGCCCCGGGGCGGAAGAAGAAAGACTTCTCCTGCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104610 CCCGGCCAACTGGGCCCCGGGGCGGAAGAAGAAAGACTTCTCCTGCGCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATCGCCTG         TTTGCCCTCAACCTTGGCCTGCCCTTCGCCACG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104660 ATCGCCTGGTG...TAGTTTGCCCTCAACCTTGGCCTGCCCTTCGCCACG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 CCTGAGGAGTTCTTTCTCAAGTGGCCAGCAGCCGGCTTCGAGCTCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104775 CCTGAGGAGTTCTTTCTCAAGTGGCCAGCAGCCGGCTTCGAGCTCCCAGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CTTTGATCCG         AGGACTGTCTCCCGCTCAGGGCCTCTCTGCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 104825 CTTTGATCCGGTG...CAGAGGACTGTCTCCCGCTCAGGGCCTCTCTGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TCCCCGAGTCCAGGGCCCTCCTGAGCGCCAGCCCGGAGGTGGTTGTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104955 TCCCCGAGTCCAGGGCCCTCCTGAGCGCCAGCCCGGAGGTGGTTGTCGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GTGGGATTCCCTGGGG         CCGGGAAGTCCACCTTTCTCAAGAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105005 GTGGGATTCCCTGGGGGTA...CAGCCGGGAAGTCCACCTTTCTCAAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GCACCTCGTGTCGGCCGGATATGTCCACGTGAACAGG         GACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 105125 GCACCTCGTGTCGGCCGGATATGTCCACGTGAACAGGGTA...CAGGACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 CGCTAGGCTCCTGGCAGCGCTGTGTGACCACGTGTGAGACAGCCCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105328 CGCTAGGCTCCTGGCAGCGCTGTGTGACCACGTGTGAGACAGCCCTGAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 CAAGGGAAACGGGTCGCCATCGACAACACAAACCCAGACGCCGCGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105378 CAAGGGAAACGGGTCGCCATCGACAACACAAACCCAGACGCCGCGAGCCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 CGCCAG         GTACGTCCAGTGTGCCCGAGCCGCGGGCGTCCCCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105428 CGCCAGGTA...CAGGTACGTCCAGTGTGCCCGAGCCGCGGGCGTCCCCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 GCCGCTGCTTCCTCTTCACCGCCACTCTGGAGCAGGCGCGCCACAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105545 GCCGCTGCTTCCTCTTCACCGCCACTCTGGAGCAGGCGCGCCACAACAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 CGG         TTTCGAGAGATGACGGACTCCTCTCATATCCCCGTGTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105595 CGGGTG...CAGTTTCGAGAGATGACGGACTCCTCTCATATCCCCGTGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 AGACATGGTCATGTATGGCTACAG         GAAGCAGTTCGAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 105733 AGACATGGTCATGTATGGCTACAGGTA...CAGGAAGCAGTTCGAGGCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 CAACGCTGGCTGAAGGCTTCTCTGCCATCCTGGAGATCCCGTTCCGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105857 CAACGCTGGCTGAAGGCTTCTCTGCCATCCTGGAGATCCCGTTCCGGCTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1516 TGGGTGGAGCCGAGGCTGGGGCGGCTGTACTGCCAGTTCTCCGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105907 TGGGTGGAGCCGAGGCTGGGGCGGCTGTACTGCCAGTTCTCCGAGGGC