seq1 = pF1KB5982.tfa, 1704 bp
seq2 = pF1KB5982/gi568815597r_202792536.tfa (gi568815597r:202792536_203025162), 232627 bp

>pF1KB5982 1704
>gi568815597r:202792536_203025162 (Chr1)

(complement)

1-195  (100001-100195)   100% ->
196-349  (105255-105408)   99% ->
350-567  (106775-106992)   100% ->
568-717  (113960-114109)   100% ->
718-832  (116039-116153)   100% ->
833-939  (128203-128309)   100% ->
940-1135  (129446-129641)   100% ->
1136-1294  (130414-130572)   100% ->
1295-1393  (130881-130979)   100% ->
1394-1580  (131738-131924)   100% ->
1581-1704  (132504-132627)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGGCATTATGGCCCCCAAAGACATAATGACAAATACTCATGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAGGCATTATGGCCCCCAAAGACATAATGACAAATACTCATGCTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCCATCCTCAATTCAATGAACTCCCTCAGGAAGAGCAATACCCTCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCCATCCTCAATTCAATGAACTCCCTCAGGAAGAGCAATACCCTCTGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGTGACATTGAGAGTAGAGCAGAAAGACTTCCCTGCCCATCGGATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGTGACATTGAGAGTAGAGCAGAAAGACTTCCCTGCCCATCGGATTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGCTGCCTGTAGTGATTACTTCTGTGCCATGTTCACTAGTGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100151 CTGGCTGCCTGTAGTGATTACTTCTGTGCCATGTTCACTAGTGAGGTA..

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    196     CTCTCAGAGAAGGGGAAACCTTATGTTGACATCCAAGGTTTGACTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 .CAGCTCTCAGAGAAGGGGAAACCTTATGTTGACATCCAAGGTTTGACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTCTACCATGGAAATTTTATTGGACTTTGTGTACACAGAAACGGTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 105301 CCTCTACCATGGAAATTTTATTGGACTTTGTGTACACAGAAACAGTACAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGACAGTGGAGAATGTACAAGAACTGCTTCCTGCAGCCTGTCTGCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105351 GTGACAGTGGAGAATGTACAAGAACTGCTTCCTGCAGCCTGTCTGCTTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GTTGAAAG         GTGTGAAACAAGCCTGCTGTGAGTTCTTAGAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 105401 GTTGAAAGGTA...TAGGTGTGAAACAAGCCTGCTGTGAGTTCTTAGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTCAGTTGGACCCTTCTAATTGCCTGGGTATTAGGGATTTTGCTGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106808 GTCAGTTGGACCCTTCTAATTGCCTGGGTATTAGGGATTTTGCTGAAACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACAATTGTGTTGACCTGATGCAAGCAGCTGAGGTTTTTAGCCAGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106858 CACAATTGTGTTGACCTGATGCAAGCAGCTGAGGTTTTTAGCCAGAAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TTTTCCTGAAGTGGTACAGCATGAAGAGTTCATTCTTCTGAGTCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106908 TTTTCCTGAAGTGGTACAGCATGAAGAGTTCATTCTTCTGAGTCAAGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGGTGGAAAAGCTAATCAAGTGCGACGAAATTCAG         GTGGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 106958 AGGTGGAAAAGCTAATCAAGTGCGACGAAATTCAGGTA...CAGGTGGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCTGAAGAGCCAGTCTTTGAGGCTGTCATCAACTGGGTGAAGCATGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113966 TCTGAAGAGCCAGTCTTTGAGGCTGTCATCAACTGGGTGAAGCATGCCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAAAGAGCGGGAAGAATCCTTGCCTAACCTGCTACAGTATGTGCGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114016 GAAAGAGCGGGAAGAATCCTTGCCTAACCTGCTACAGTATGTGCGGATGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCCTACTAACCCCCAGGTATATCACAGATGTAATAGATGCTGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 114066 CCCTACTAACCCCCAGGTATATCACAGATGTAATAGATGCTGAGGTA...

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    718    CCTTTCATCCGCTGTAGTTTACAATGCAGGGATCTGGTTGATGAAGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116036 CAGCCTTTCATCCGCTGTAGTTTACAATGCAGGGATCTGGTTGATGAAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AAAGAAGTTTCATCTGAGGCCTGAACTTCGGAGTCAGATGCAGGGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116086 AAAGAAGTTTCATCTGAGGCCTGAACTTCGGAGTCAGATGCAGGGACCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GGACAAGGGCTCGCCTAG         GAGCCAATGAAGTGCTTTTGGTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 116136 GGACAAGGGCTCGCCTAGGTA...CAGGAGCCAATGAAGTGCTTTTGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GTTGGGGGCTTTGGAAGCCAGCAGTCTCCCATTGATGTGGTAGAGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128226 GTTGGGGGCTTTGGAAGCCAGCAGTCTCCCATTGATGTGGTAGAGAAATA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGACCCCAAGACTCAGGAGTGGAGCTTTTTGCCA         AGCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 128276 TGACCCCAAGACTCAGGAGTGGAGCTTTTTGCCAGTA...TAGAGCATCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTCGTAAGAGACGTTATGTGGCCTCAGTGTCCCTTCATGACCGGATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129453 CTCGTAAGAGACGTTATGTGGCCTCAGTGTCCCTTCATGACCGGATCTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GTCATTGGTGGCTATGATGGCCGTTCCCGCCTTAGTTCAGTGGAATGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129503 GTCATTGGTGGCTATGATGGCCGTTCCCGCCTTAGTTCAGTGGAATGTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGACTACACAGCAGATGAGGATGGGGTCTGGTATTCTGTGGCCCCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129553 AGACTACACAGCAGATGAGGATGGGGTCTGGTATTCTGTGGCCCCTATGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 ATGTCCGACGAGGTCTTGCTGGAGCCACCACCCTGGGAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 129603 ATGTCCGACGAGGTCTTGCTGGAGCCACCACCCTGGGAGGTA...CAGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ATGATCTATGTCTCTGGAGGCTTTGATGGAAGCAGGCGTCACACCAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130416 ATGATCTATGTCTCTGGAGGCTTTGATGGAAGCAGGCGTCACACCAGTAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGAGCGCTATGATCCAAACATTGACCAGTGGAGCATGCTGGGAGATATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130466 GGAGCGCTATGATCCAAACATTGACCAGTGGAGCATGCTGGGAGATATGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 AGACAGCCCGGGAAGGTGCCGGACTCGTAGTGGCCAGTGGAGTGATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130516 AGACAGCCCGGGAAGGTGCCGGACTCGTAGTGGCCAGTGGAGTGATCTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TGTCTAG         GAGGATATGACGGCTTGAATATCTTAAATTCAGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130566 TGTCTAGGTA...CAGGAGGATATGACGGCTTGAATATCTTAAATTCAGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TGAGAAATACGACCCTCATACAGGACATTGGACTAATGTTACACCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130915 TGAGAAATACGACCCTCATACAGGACATTGGACTAATGTTACACCAATGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCACCAAGCGTTCTG         GTGCAGGAGTAGCCCTGCTGAATGAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 130965 CCACCAAGCGTTCTGGTA...CAGGTGCAGGAGTAGCCCTGCTGAATGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CATATTTATGTGGTGGGGGGATTTGATGGTACAGCCCACCTTTCTTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131764 CATATTTATGTGGTGGGGGGATTTGATGGTACAGCCCACCTTTCTTCCGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TGAAGCATACAACATTCGCACTGATTCCTGGACAACTGTCACCAGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131814 TGAAGCATACAACATTCGCACTGATTCCTGGACAACTGTCACCAGTATGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CCACTCCACGATGCTATGTAGGGGCCACAGTGCTTCGGGGGAGACTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131864 CCACTCCACGATGCTATGTAGGGGCCACAGTGCTTCGGGGGAGACTCTAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GCAATTGCAGG         ATATGATGGTAATTCCCTGCTAAGTAGCAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 131914 GCAATTGCAGGGTG...CAGATATGATGGTAATTCCCTGCTAAGTAGCAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TGAATGTTATGACCCTATCATCGACAGCTGGGAAGTCGTGACATCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132534 TGAATGTTATGACCCTATCATCGACAGCTGGGAAGTCGTGACATCCATGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GAACCCAGCGCTGTGATGCTGGTGTTTGTGTTCTCCGCGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132584 GAACCCAGCGCTGTGATGCTGGTGTTTGTGTTCTCCGCGAGAAG