seq1 = pF1KB5952.tfa, 1641 bp
seq2 = pF1KB5952/gi568815579r_10233860.tfa (gi568815579r:10233860_10439614), 205755 bp

>pF1KB5952 1641
>gi568815579r:10233860_10439614 (Chr19)

(complement)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-343  (100667-100933)   99% ->
344-649  (103639-103944)   100% ->
650-937  (104262-104549)   100% ->
938-1192  (104833-105087)   100% ->
1193-1441  (105207-105455)   100% ->
1442-1641  (105556-105755)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACCATGGTACCATCCGTGTTGTGGCCCAGGGCCTGCTGGACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACCATGGTACCATCCGTGTTGTGGCCCAGGGCCTGCTGGACTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGTCTGCTGTCTGCTGACCCCAG         GTGTCCAGGGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 GCTGGTCTGCTGTCTGCTGACCCCAGGTG...AAGGTGTCCAGGGGCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGTTCCTTTTGCGGGTGGAGCCCCAGAACCCTGTGCTCTCTGCTGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100682 AGTTCCTTTTGCGGGTGGAGCCCCAGAACCCTGTGCTCTCTGCTGGAGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCCTGTTTGTGAACTGCAGTACTGATTGTCCCAGCTCTGAGAAAATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100732 TCCCTGTTTGTGAACTGCAGTACTGATTGTCCCAGCTCTGAGAAAATCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTGGAGACGTCCCTATCAAAGGAGCTGGTGGCCAGTGGCATGGGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100782 CTTGGAGACGTCCCTATCAAAGGAGCTGGTGGCCAGTGGCATGGGCTGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGCCTTCAATCTCAGCAACGTGACTGGCAACAGTCGGATCCTCTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100832 CAGCCTTCAATCTCAGCAACGTGACTGGCAACAGTCGGATCCTCTGCTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGTACTGCAATGGCTCCCAGATAACAGGCTCCTCTAACATCACCGTGTA
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100882 GTGTACTGCAATGGCTCTCAGATAACAGGCTCCTCTAACATCACCGTGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CA         GGCTCCCGGAGCGTGTGGAGCTGGCACCCCTGCCTCCTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100932 CAGTG...CAGGGCTCCCGGAGCGTGTGGAGCTGGCACCCCTGCCTCCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGCAGCCGGTGGGCCAGAACTTCACCCTGCGCTGCCAAGTGGAGGATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103678 GGCAGCCGGTGGGCCAGAACTTCACCCTGCGCTGCCAAGTGGAGGATGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCGCCCCGGACCAGCCTCACGGTGGTGCTGCTTCGCTGGGAGGAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103728 TCGCCCCGGACCAGCCTCACGGTGGTGCTGCTTCGCTGGGAGGAGGAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GAGCCGGCAGCCCGCAGTGGAGGAGCCAGCGGAGGTCACTGCCACTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103778 GAGCCGGCAGCCCGCAGTGGAGGAGCCAGCGGAGGTCACTGCCACTGTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGGCCAGCAGAGACGACCACGGAGCCCCTTTCTCATGCCGCACAGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103828 TGGCCAGCAGAGACGACCACGGAGCCCCTTTCTCATGCCGCACAGAACTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GACATGCAGCCCCAGGGGCTGGGACTGTTCGTGAACACCTCAGCCCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103878 GACATGCAGCCCCAGGGGCTGGGACTGTTCGTGAACACCTCAGCCCCCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCAGCTCCGAACCTTTG         TCCTGCCCGTGACCCCCCCGCGCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 103928 CCAGCTCCGAACCTTTGGTG...CAGTCCTGCCCGTGACCCCCCCGCGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCGTGGCCCCCCGGTTCTTGGAGGTGGAAACGTCGTGGCCGGTGGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104286 TCGTGGCCCCCCGGTTCTTGGAGGTGGAAACGTCGTGGCCGGTGGACTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ACCCTAGACGGGCTTTTTCCAGCCTCAGAGGCCCAGGTCTACCTGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104336 ACCCTAGACGGGCTTTTTCCAGCCTCAGAGGCCCAGGTCTACCTGGCGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGGGGACCAGATGCTGAATGCGACAGTCATGAACCACGGGGACACGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104386 GGGGGACCAGATGCTGAATGCGACAGTCATGAACCACGGGGACACGCTAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CGGCCACAGCCACAGCCACGGCGCGCGCGGATCAGGAGGGTGCCCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104436 CGGCCACAGCCACAGCCACGGCGCGCGCGGATCAGGAGGGTGCCCGGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 ATCGTCTGCAACGTGACCCTAGGGGGCGAGAGACGGGAGGCCCGGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104486 ATCGTCTGCAACGTGACCCTAGGGGGCGAGAGACGGGAGGCCCGGGAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CTTGACGGTCTTTA         GCTTCCTAGGACCCATTGTGAACCTCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 104536 CTTGACGGTCTTTAGTA...TAGGCTTCCTAGGACCCATTGTGAACCTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GCGAGCCCACCGCCCATGAGGGGTCCACAGTGACCGTGAGTTGCATGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104860 GCGAGCCCACCGCCCATGAGGGGTCCACAGTGACCGTGAGTTGCATGGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GGGGCTCGAGTCCAGGTCACGCTGGACGGAGTTCCGGCCGCGGCCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104910 GGGGCTCGAGTCCAGGTCACGCTGGACGGAGTTCCGGCCGCGGCCCCGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GCAGCCAGCTCAACTTCAGCTAAATGCTACCGAGAGTGACGACGGACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104960 GCAGCCAGCTCAACTTCAGCTAAATGCTACCGAGAGTGACGACGGACGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GCTTCTTCTGCAGTGCCACTCTCGAGGTGGACGGCGAGTTCTTGCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105010 GCTTCTTCTGCAGTGCCACTCTCGAGGTGGACGGCGAGTTCTTGCACAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 AACAGTAGCGTCCAGCTGCGAGTCCTGT         ATGGTCCCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 105060 AACAGTAGCGTCCAGCTGCGAGTCCTGTGTG...CAGATGGTCCCAAAAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TGACCGAGCCACATGCCCCCAGCACTTGAAATGGAAAGATAAAACGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105220 TGACCGAGCCACATGCCCCCAGCACTTGAAATGGAAAGATAAAACGAGAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 ACGTCCTGCAGTGCCAAGCCAGGGGCAACCCGTACCCCGAGCTGCGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105270 ACGTCCTGCAGTGCCAAGCCAGGGGCAACCCGTACCCCGAGCTGCGGTGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 TTGAAGGAAGGCTCCAGCCGGGAGGTGCCGGTGGGGATCCCGTTCTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105320 TTGAAGGAAGGCTCCAGCCGGGAGGTGCCGGTGGGGATCCCGTTCTTCGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CAACGTAACACATAATGGTACTTATCAGTGCCAAGCGTCCAGCTCACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105370 CAACGTAACACATAATGGTACTTATCAGTGCCAAGCGTCCAGCTCACGAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 GCAAATACACCCTGGTCGTGGTGATGGACATTGAGG         CTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 105420 GCAAATACACCCTGGTCGTGGTGATGGACATTGAGGGTG...CAGCTGGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 AGCTCCCACTTTGTCCCCGTCTTCGTGGCGGTGTTACTGACCCTGGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105561 AGCTCCCACTTTGTCCCCGTCTTCGTGGCGGTGTTACTGACCCTGGGCGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 GGTGACTATCGTACTGGCCTTAATGTACGTCTTCAGGGAGCACCAACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105611 GGTGACTATCGTACTGGCCTTAATGTACGTCTTCAGGGAGCACCAACGGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 GCGGCAGTTACCATGTTAGGGAGGAGAGCACCTATCTGCCCCTCACGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105661 GCGGCAGTTACCATGTTAGGGAGGAGAGCACCTATCTGCCCCTCACGTCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1597 ATGCAGCCGACAGAAGCAATGGGGGAAGAACCGTCCAGAGCTGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105711 ATGCAGCCGACAGAAGCAATGGGGGAAGAACCGTCCAGAGCTGAG