seq1 = pF1KB5937.tfa, 1524 bp
seq2 = pF1KB5937/gi568815579r_12822751.tfa (gi568815579r:12822751_13033696), 210946 bp

>pF1KB5937 1524
>gi568815579r:12822751_13033696 (Chr19)

(complement)

1-147  (100001-100147)   100% ->
148-285  (102948-103085)   100% ->
286-384  (103170-103268)   100% ->
385-503  (103356-103474)   100% ->
504-596  (104850-104942)   100% ->
597-725  (105034-105162)   100% ->
726-841  (105240-105355)   100% ->
842-926  (108523-108607)   100% ->
927-1026  (108694-108793)   100% ->
1027-1195  (108890-109058)   100% ->
1196-1273  (109171-109248)   100% ->
1274-1388  (109432-109546)   100% ->
1389-1524  (110811-110946)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGATGGTCAGGTGGCGGAACTGCTGCTCCGGCGGCTGGAGGCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGATGGTCAGGTGGCGGAACTGCTGCTCCGGCGGCTGGAGGCGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGATGGCGGCCTGGACAGCGCCGAGTTGGCGGCTGAGCTGGGCATGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGATGGCGGCCTGGACAGCGCCGAGTTGGCGGCTGAGCTGGGCATGGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCAGGCGGTGGTGGGCGCCGTGAAGAGCCTTCAGGCGCTGGGCGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100101 ACCAGGCGGTGGTGGGCGCCGTGAAGAGCCTTCAGGCGCTGGGCGAGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    148       GTCATCGAGGCTGAACTTCGGTCCACCAAGCACTGGGAGCTTAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ...TAGGTCATCGAGGCTGAACTTCGGTCCACCAAGCACTGGGAGCTTAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGCGGAGGGCGAGGAGATTGCCCGGGAGGGCAGCCATGAGGCCCGTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102992 TGCGGAGGGCGAGGAGATTGCCCGGGAGGGCAGCCATGAGGCCCGTGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTCGAAGCATTCCCCCAGAGGGCCTGGCCCAGAGCGAGCTTATG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103042 TTCGAAGCATTCCCCCAGAGGGCCTGGCCCAGAGCGAGCTTATGGTA...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    286    CGACTGCCCAGTGGCAAAGTGGGCTTCAGCAAGGCCATGTCCAACAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103167 CAGCGACTGCCCAGTGGCAAAGTGGGCTTCAGCAAGGCCATGTCCAACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTGGATTCGGGTGGACAAGAGTGCGGCTGACGGGCCCCGGGTGTTCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103217 GTGGATTCGGGTGGACAAGAGTGCGGCTGACGGGCCCCGGGTGTTCCGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TG         GTGGACAGCATGGAGGATGAGGTGCAGCGGCGGCTCCAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103267 TGGTG...CAGGTGGACAGCATGGAGGATGAGGTGCAGCGGCGGCTCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGGTCCGGGGGGGACAGGCTGAGAAGCTGGGGGAGAAGGAGAGGAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103395 CTGGTCCGGGGGGGACAGGCTGAGAAGCTGGGGGAGAAGGAGAGGAGCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCTGAGGAAGAGGAAGCTGTTGGCTGAAGT         GACTCTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103445 GCTGAGGAAGAGGAAGCTGTTGGCTGAAGTGTG...CAGGACTCTGAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCTACTGGGTGAGCAAAGGCAGTGCCTTTAGTACCAGCATCTCCAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104861 CCTACTGGGTGAGCAAAGGCAGTGCCTTTAGTACCAGCATCTCCAAGCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAGACAGAGCTGAGCCCAGAGATGATCTCCAG         TGGCTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 104911 GAGACAGAGCTGAGCCCAGAGATGATCTCCAGGTA...CAGTGGCTCTTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCGGGACCGGCCCTTCAAGCCCTACAACTTCTTGGCCCACGGTGTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105043 GCGGGACCGGCCCTTCAAGCCCTACAACTTCTTGGCCCACGGTGTCCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCGACAGCGGCCACCTTCACCCGCTGCTCAAGGTCCGCTCCCAGTTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105093 CCGACAGCGGCCACCTTCACCCGCTGCTCAAGGTCCGCTCCCAGTTCCGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CAGATCTTCCTGGAGATGGG         GTTCACCGAGATGCCGACTGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 105143 CAGATCTTCCTGGAGATGGGGTG...CAGGTTCACCGAGATGCCGACTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TAACTTCATTGAGAGCTCCTTCTGGAACTTTGACGCCCTCTTCCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105261 TAACTTCATTGAGAGCTCCTTCTGGAACTTTGACGCCCTCTTCCAGCCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGCAGCACCCAGCCCGTGACCAGCACGACACCTTCTTCCTTCGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 105311 AGCAGCACCCAGCCCGTGACCAGCACGACACCTTCTTCCTTCGAGGTG..

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842     ATCCAGCGGAGGCCCTGCAGCTCCCAATGGACTATGTCCAGCGGGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105361 .CAGATCCAGCGGAGGCCCTGCAGCTCCCAATGGACTATGTCCAGCGGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CAAGCGGACCCACTCTCAGGGCGGCTACGGCTCACAGGG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 108569 CAAGCGGACCCACTCTCAGGGCGGCTACGGCTCACAGGGGTG...AAGGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ACAAGTATAACTGGAAGCTGGACGAGGCCCGGAAAAACCTACTGCGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108696 ACAAGTATAACTGGAAGCTGGACGAGGCCCGGAAAAACCTACTGCGAACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CACACCACATCAGCCAGCGCCCGTGCGCTCTACCGCCTTGCCCAGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 108746 CACACCACATCAGCCAGCGCCCGTGCGCTCTACCGCCTTGCCCAGAAGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1027        AAGCCCTTCACTCCGGTCAAGTACTTCTCCATCGACCGCGTAT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108796 G...TAGAAGCCCTTCACTCCGGTCAAGTACTTCTCCATCGACCGCGTAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TCCGGAATGAGACCCTGGACGCCACGCACCTGGCTGAGTTCCACCAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108933 TCCGGAATGAGACCCTGGACGCCACGCACCTGGCTGAGTTCCACCAGATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GAGGGCGTGGTGGCGGATCATGGTCTCACCTTGGGCCACCTCATGGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108983 GAGGGCGTGGTGGCGGATCATGGTCTCACCTTGGGCCACCTCATGGGCGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TCTGCGGGAGTTCTTCACCAAGCTGG         GTATCACGCAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 109033 TCTGCGGGAGTTCTTCACCAAGCTGGGTG...CAGGTATCACGCAACTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 GCTTCAAGCCAGCCTACAACCCATACACAGAGCCCAGCATGGAGGTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109186 GCTTCAAGCCAGCCTACAACCCATACACAGAGCCCAGCATGGAGGTGTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AGCTACCACCAAG         GCCTGAAGAAGTGGGTGGAGGTCGGAAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 109236 AGCTACCACCAAGGTC...CAGGCCTGAAGAAGTGGGTGGAGGTCGGAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CTCGGGGGTCTTCCGTCCAGAGATGCTGCTGCCCATGGGGCTTCCCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109460 CTCGGGGGTCTTCCGTCCAGAGATGCTGCTGCCCATGGGGCTTCCCGAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 ACGTGTCGGTCATTGCCTGGGGCCTCTCCCTGGAGCG         CCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 109510 ACGTGTCGGTCATTGCCTGGGGCCTCTCCCTGGAGCGGTA...AAGCCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 ACGATGATCAAATATGGCATCAACAATATCCGGGAGCTGGTGGGCCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110815 ACGATGATCAAATATGGCATCAACAATATCCGGGAGCTGGTGGGCCACAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GGTGAACCTGCAGATGGTGTATGACAGTCCCCTGTGCCGCCTGGATGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110865 GGTGAACCTGCAGATGGTGTATGACAGTCCCCTGTGCCGCCTGGATGCCG

   1600     .    :    .    :    .    :
   1493 AGCCGAGGCCCCCTCCCACACAGGAGGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 110915 AGCCGAGGCCCCCTCCCACACAGGAGGCTGCG