seq1 = pF1KB5923.tfa, 1515 bp
seq2 = pF1KB5923/gi568815597r_112610166.tfa (gi568815597r:112610166_112815301), 205136 bp

>pF1KB5923 1515
>gi568815597r:112610166_112815301 (Chr1)

(complement)

1-326  (100001-100326)   100% ->
327-441  (101691-101805)   100% ->
442-729  (102271-102558)   99% ->
730-842  (102845-102957)   100% ->
843-927  (103247-103331)   100% ->
928-1046  (103918-104036)   100% ->
1047-1110  (104231-104294)   100% ->
1111-1218  (104451-104558)   100% ->
1219-1370  (104691-104842)   100% ->
1371-1515  (104992-105136)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTAAACCGGGTGCGCTCGGCCGTGGCGCACCTGGTGAGCTCCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTAAACCGGGTGCGCTCGGCCGTGGCGCACCTGGTGAGCTCCGGGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCTCCGCCTCCGCGCCCCAAATCCCCGGACCTGCCCAACGCCGCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCTCCGCCTCCGCGCCCCAAATCCCCGGACCTGCCCAACGCCGCCTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCGCCCGCCGCCGCTCCAGAAGCGCCCAGGAGCCCTCCCGCGAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCGCCCGCCGCCGCTCCAGAAGCGCCCAGGAGCCCTCCCGCGAAGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGAGCGGGAGCGCGACGCCCGCGAAGGCTGTTGAGGCTCGAGCGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGAGCGGGAGCGCGACGCCCGCGAAGGCTGTTGAGGCTCGAGCGAGCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCAGACCGACCTTTCTGCAGCTGAGCCCCGGGGGGCTGCGACGCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCAGACCGACCTTTCTGCAGCTGAGCCCCGGGGGGCTGCGACGCGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGACCACGCGGGCCGGGCTGTGCAAAGCCCCCCGGACACGGGCCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGACCACGCGGGCCGGGCTGTGCAAAGCCCCCCGGACACGGGCCGCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCCCTGGAGCACAGGCTACGCCGA         GGTCATCAATGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100301 CTGCCCTGGAGCACAGGCTACGCCGAGTG...CAGGGTCATCAATGCTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAAGAGTCGGCACAATGAGGACCAGGCTTGCTGTGAAGTGGTGTATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101706 CAAGAGTCGGCACAATGAGGACCAGGCTTGCTGTGAAGTGGTGTATGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AAGGTCGGAGGAGTGTTACAGGAGTACCTAGGGAGCCTAGCCGAGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101756 AAGGTCGGAGGAGTGTTACAGGAGTACCTAGGGAGCCTAGCCGAGGCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442          GGACTCTGCTTCTACTACTGGGGCCTATTTGATGGGCATGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101806 GTA...CAGGGACTCTGCTTCTACTACTGGGGCCTATTTGATGGGCATGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGGGGGCGGAGCTGCTGAAATGGCCTCACGGCTCCTGCATCGCCATATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102312 AGGGGGCGGAGCTGCTGAAATGGCCTCACGGCTCCTGCATCGCCATATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GAGAGCAGCTAAAGGACCTGGTAGAGATACTTCAGGACCCTTCGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102362 GAGAGCAGCTAAAGGACCTGGTAGAGATACTTCAGGACCCTTCGCCACCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CCCCTCTGCCTCCCAACCACTCCGGGGACCCCAGATTCCTCCGATCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102412 CCCCTCTGCCTCCCAACCACTCCGGGGACCCCAGATTCCTCCGATCCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TCACTTGCTTGGCCCTCAGTCCTGCTGGTCTTCACAGAAGGAAGTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102462 TCACTTGCTTGGCCCTCAGTCCTGCTGGTCTTCACAGAAGGAAGTGAGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACGAGAGCCTGGTAGTGGGGGCCATTGAGAATGCCTTCCAGCTCATG   
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||>>>
 102512 ACGAGAGCCTGGTAGTGGGGGCCGTTGAGAATGCCTTCCAGCTCATGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    730       GATGAGCAGATGGCCCGGGAGCGGCGTGGCCACCAAGTGGAGGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102562 ...CAGGATGAGCAGATGGCCCGGGAGCGGCGTGGCCACCAAGTGGAGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGGCTGCTGTGCACTGGTTGTGATCTACCTGCTAGGCAAGGTGTACGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102889 GGGCTGCTGTGCACTGGTTGTGATCTACCTGCTAGGCAAGGTGTACGTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCAATGCAGGCGATAGCAG         GGCCATCATTGTCCGGAATGGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102939 CCAATGCAGGCGATAGCAGGTA...CAGGGCCATCATTGTCCGGAATGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GAAATCATTCCAATGTCCCGGGAGTTTACCCCGGAGACTGAGCGCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103269 GAAATCATTCCAATGTCCCGGGAGTTTACCCCGGAGACTGAGCGCCAGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TCTTCAGCTGCTT         GGCTTCCTGAAACCAGAGCTGCTAGGCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103319 TCTTCAGCTGCTTGTA...CAGGGCTTCCTGAAACCAGAGCTGCTAGGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GTGAATTCACCCACCTTGAGTTCCCCCGCAGAGTTCTGCCCAAGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103946 GTGAATTCACCCACCTTGAGTTCCCCCGCAGAGTTCTGCCCAAGGAGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GGGCAGAGGATGTTGTACCGGGACCAGAACATGACCGGCTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 103996 GGGCAGAGGATGTTGTACCGGGACCAGAACATGACCGGCTGGTA...CAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGCCTACAAAAAGATCGAGCTGGAGGATCTCAGGTTTCCTCTGGTCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104231 GGCCTACAAAAAGATCGAGCTGGAGGATCTCAGGTTTCCTCTGGTCTGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GGGAGGGCAAAAAG         GCTCGGGTGATGGCCACCATTGGGGTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 104281 GGGAGGGCAAAAAGGTA...CAGGCTCGGGTGATGGCCACCATTGGGGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ACCCGAGGCTTGGGAGACCACAGCCTTAAGGTCTGCAGTTCCACCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104478 ACCCGAGGCTTGGGAGACCACAGCCTTAAGGTCTGCAGTTCCACCCTGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CATCAAGCCCTTTCTCTCCTGCTTCCCTGAG         GTACGAGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 104528 CATCAAGCCCTTTCTCTCCTGCTTCCCTGAGGTG...CAGGTACGAGTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ATGACCTGACACAATATGAGCACTGCCCAGATGATGTGCTAGTCCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104701 ATGACCTGACACAATATGAGCACTGCCCAGATGATGTGCTAGTCCTGGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ACAGATGGCCTGTGGGATGTCACTACTGACTGTGAGGTAGCTGCCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104751 ACAGATGGCCTGTGGGATGTCACTACTGACTGTGAGGTAGCTGCCACTGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGACAGGGTGCTGTCGGCCTATGAGCCTAATGACCACAGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104801 GGACAGGGTGCTGTCGGCCTATGAGCCTAATGACCACAGCAGGTA...CA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1371  GTATACAGCTCTGGCCCAAGCTCTGGTCCTGGGGGCCCGGGGTACCCCC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104991 GGTATACAGCTCTGGCCCAAGCTCTGGTCCTGGGGGCCCGGGGTACCCCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CGAGACCGTGGCTGGCGTCTCCCCAACAACAAGCTGGGTTCCGGGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105041 CGAGACCGTGGCTGGCGTCTCCCCAACAACAAGCTGGGTTCCGGGGATGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1470 CATCTCTGTCTTCGTCATCCCCCTGGGAGGGCCAGGCAGTTACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105091 CATCTCTGTCTTCGTCATCCCCCTGGGAGGGCCAGGCAGTTACTCC