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seq2 = pF1KB5922/gi568815593r_170148700.tfa (gi568815593r:170148700_170397611), 248912 bp

>pF1KB5922 1599
>gi568815593r:170148700_170397611 (Chr5)

(complement)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-141  (104240-104302)   100% ->
142-188  (109596-109642)   100% ->
189-254  (121752-121817)   100% ->
255-286  (122261-122292)   100% ->
287-324  (123274-123311)   100% ->
325-523  (126695-126893)   100% ->
524-621  (129130-129227)   98% ->
622-688  (130537-130603)   100% ->
689-772  (130721-130804)   100% ->
773-798  (134620-134645)   100% ->
799-818  (134751-134770)   100% ->
819-926  (134870-134977)   100% ->
927-968  (136475-136509)   83% ->
969-1100  (139446-139575)   98% ->
1101-1150  (141037-141086)   100% ->
1151-1245  (144399-144493)   100% ->
1246-1323  (145101-145178)   100% ->
1324-1479  (146727-146882)   100% ->
1480-1599  (148793-148912)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACTGAGGAATGTGCCCTTTCGCTCAGAGGTCCTGGGCTGGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCACTGAGGAATGTGCCCTTTCGCTCAGAGGTCCTGGGCTGGGACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACAGCCTTGCTGACTATTTCAAGAAG         CTCAACTATAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 CGACAGCCTTGCTGACTATTTCAAGAAGGTA...CAGCTCAACTATAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTGTGAGAAGGCAGTGAAGAAGTACCACATCGATGGGGCTCGCTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104253 ACTGTGAGAAGGCAGTGAAGAAGTACCACATCGATGGGGCTCGCTTCTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142          AACCTGACAGAAAATGACATCCAGAAGTTCCCCAAGCTCCG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104303 GTA...CAGAACCTGACAGAAAATGACATCCAGAAGTTCCCCAAGCTCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGTGCC         GATTCTCAGTAAGTTAAGTCAGGAAATCAACAAGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109637 GGTGCCGTA...CAGGATTCTCAGTAAGTTAAGTCAGGAAATCAACAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ACGAAGAGAGGAGGAGCATCTTCACACGCAA         ACCCCAAGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 121787 ACGAAGAGAGGAGGAGCATCTTCACACGCAAGTG...CAGACCCCAAGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 CCGCGGTTTCCTGAAGAGACAG         AAAGCCACGAAGAGGACAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 122271 CCGCGGTTTCCTGAAGAGACAGGTA...CAGAAAGCCACGAAGAGGACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    306 TGGGGGCTGGTCGTCCTTT         GAAGAAGACGATTATGAAAGTC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 123293 TGGGGGCTGGTCGTCCTTTGTG...CAGGAAGAAGACGATTATGAAAGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    347 CCAATGATGACCAGGATGGGGAGGATGATGGAGACTATGAGTCCCCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126717 CCAATGATGACCAGGATGGGGAGGATGATGGAGACTATGAGTCCCCCAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    397 GAGGAGGAAGAGGCACCCGTGGAAGATGACGCGGATTATGAGCCGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126767 GAGGAGGAAGAGGCACCCGTGGAAGATGACGCGGATTATGAGCCGCCACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 CTCCAATGACGAGGAAGCTCTGCAGAACTCCATCCTGCCTGCCAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126817 CTCCAATGACGAGGAAGCTCTGCAGAACTCCATCCTGCCTGCCAAGCCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TCCCCAACTCCAACTCCATGTACATCG         ACCGGCCCCCCTCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 126867 TCCCCAACTCCAACTCCATGTACATCGGTA...CAGACCGGCCCCCCTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GGGAAAACCCCCCAGCAGCCTCCTGTACCCCCCCAGAGACCGATGGCCGC
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 129144 GGGAAAACCCCCCAGCAGCCTCCTGTGCCCCCCCAGAGACCGATGGCCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 CCTCCCGCCCCCACCAGCCGGCCGGAATCACTCG         CCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 129194 CCTCCCGCCCCCACCAGCCGGCCGGAATCACTCGGTA...CAGCCACTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 CCCCACCCCAGACCAACCACGAAGAACCCAGCAGAAGCAGAAACCACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130544 CCCCACCCCAGACCAACCACGAAGAACCCAGCAGAAGCAGAAACCACAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 ACGGCAAAGC         TCCCTGCTCCTTCAATAGACAGAAGCACGAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 130594 ACGGCAAAGCGTG...CAGTCCCTGCTCCTTCAATAGACAGAAGCACGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 ACCTCCCCTAGATCGTTCATTAGCTCCGTTTGATAGAGAACCCTTCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130752 ACCTCCCCTAGATCGTTCATTAGCTCCGTTTGATAGAGAACCCTTCACAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 TAG         GAAAGAAACCACCATTTTCTGACAAG         CCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 130802 TAGGTG...CAGGAAAGAAACCACCATTTTCTGACAAGGTA...CAGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    802 TCGATTCCAGCGGGAAG         GTCACTCGGGGAGCATTTACCCAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 134754 TCGATTCCAGCGGGAAGGTA...CAGGTCACTCGGGGAGCATTTACCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    843 GATTCAAAAGCCTCCTTTACCACCGACCACGGAAAGACATGAAAGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134894 GATTCAAAAGCCTCCTTTACCACCGACCACGGAAAGACATGAAAGGAGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    893 GCCCCCTGCCAGGGAAGAAGCCACCTGTGCCAAA         GCATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 134944 GCCCCCTGCCAGGGAAGAAGCCACCTGTGCCAAAGTA...CAGGCATGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    934 TGGGGACCAGACAGAAGAGAGAATGATGAAGATGA         TGTGCA
        |||||||||||||||||||||||||-|-||----->>>...>>>--||||
 136482 TGGGGACCAGACAGAAGAGAGAATG T AA     GTA...CAG  TGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    975 TCAGAGACCTTTGCCCCAGCCAGCACTACTTCCTATGAGCTCCAACACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139450 TCAGAGACCTTTGCCCCAGCCAGCACTACTTCCTATGAGCTCCAACACTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1025 TCCCTTCAAGATCTACTAAGCCAAGTCCCATGAACCCTCTCCCATCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139500 TCCCTTCAAGATCTACTAAGCCAAGTCCCATGAACCCTCTCCCATCCTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1075 CACATGCCTGGAGCATTCTCAGAAAG         TAACAGCAGTTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 139550 CACATGCCTGGAGCATTCTCAGAAAGGTT...CAGTAACAGCAGTTTTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1116 ACAGAGTGCCTCCCTGCCACCATACTTCTCTCAAG         GCCCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 141052 ACAGAGTGCCTCCCTGCCACCATACTTCTCTCAAGGTT...AAGGCCCTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1157 GCAACAGACCACCTATCAGAGCCGAAGGCAGAAACTTCCCCTTGCCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144405 GCAACAGACCACCTATCAGAGCCGAAGGCAGAAACTTCCCCTTGCCACTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1207 CCAAACAAACCTCGGCCCCCATCCCCCGCGGAGGAAGAG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 144455 CCAAACAAACCTCGGCCCCCATCCCCCGCGGAGGAAGAGGTA...CAGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1248 TTCATTAAATGAAGAGTGGTACGTTTCTTATATTACCCGACCAGAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145103 TTCATTAAATGAAGAGTGGTACGTTTCTTATATTACCCGACCAGAGGCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1298 AAGCTGCTCTTAGAAAGATAAACCAG         GATGGCACATTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 145153 AAGCTGCTCTTAGAAAGATAAACCAGGTA...TAGGATGGCACATTTCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1339 GTCAGAGACAGCTCTAAAAAAACAACAACCAATCCATATGTCCTCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146742 GTCAGAGACAGCTCTAAAAAAACAACAACCAATCCATATGTCCTCATGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1389 GTTGTACAAAGATAAAGTTTACAACATCCAGATCCGTTATCAGAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146792 GTTGTACAAAGATAAAGTTTACAACATCCAGATCCGTTATCAGAAGGAAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1439 GTCAAGTTTACTTGTTGGGAACTGGACTCCGAGGGAAAGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 146842 GTCAAGTTTACTTGTTGGGAACTGGACTCCGAGGGAAAGAGGTA...CAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1480 GACTTTCTGTCTGTGTCAGATATTATTGACTACTTCAGGAAAATGCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148793 GACTTTCTGTCTGTGTCAGATATTATTGACTACTTCAGGAAAATGCCACT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1530 TCTGCTCATTGATGGGAAAAACCGAGGTTCCAGATACCAGTGCACATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148843 TCTGCTCATTGATGGGAAAAACCGAGGTTCCAGATACCAGTGCACATTAA

   1750     .    :    .    :
   1580 CGCATGCTGCAGGGTACCCA
        ||||||||||||||||||||
 148893 CGCATGCTGCAGGGTACCCA